178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2143 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2143  glutaminase  100 
 
 
335 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2130  glutaminase  100 
 
 
335 aa  689    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2254  glutaminase  100 
 
 
335 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1503  Glutaminase  70.44 
 
 
330 aa  473  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1407  glutaminase  58.59 
 
 
331 aa  413  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3760  glutaminase  54.13 
 
 
332 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37730  L-glutaminase  56.47 
 
 
338 aa  363  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.89769  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4729  glutaminase  44.63 
 
 
311 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0038  glutaminase  44.84 
 
 
313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.744531 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0048  glutaminase  41.56 
 
 
310 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0340  glutaminase  48.28 
 
 
317 aa  263  3e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0524  glutaminase  43.14 
 
 
310 aa  259  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0528  glutaminase  42.48 
 
 
310 aa  259  6e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0578  glutaminase  42.48 
 
 
310 aa  256  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  42.68 
 
 
624 aa  255  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00436  predicted glutaminase  42.48 
 
 
310 aa  255  9e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3125  Glutaminase  42.48 
 
 
310 aa  255  9e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.28972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0420  glutaminase  42.16 
 
 
310 aa  255  9e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00441  hypothetical protein  42.48 
 
 
310 aa  255  9e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3131  glutaminase  42.48 
 
 
310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0971481  hitchhiker  0.0000872807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0564  glutaminase  42.48 
 
 
310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0446  Glutaminase  46.37 
 
 
412 aa  252  7e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2331  glutaminase  41.18 
 
 
425 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  43.38 
 
 
624 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2670  Glutaminase  42.18 
 
 
343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3446  Glutaminase  41.84 
 
 
343 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  41.37 
 
 
601 aa  241  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  40.32 
 
 
613 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1319  Glutaminase  39.41 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1945  Glutaminase  41.41 
 
 
483 aa  232  7.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  37.7 
 
 
334 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  38.34 
 
 
318 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0080  Glutaminase  37.22 
 
 
422 aa  219  7.999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.742612  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2799  Glutaminase  37.62 
 
 
343 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.095609 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3926  cyclic nucleotide-binding protein  37.16 
 
 
608 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1163  glutaminase  40.19 
 
 
331 aa  215  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  40.52 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  39.33 
 
 
620 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  40.42 
 
 
305 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  40.42 
 
 
305 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3622  glutaminase  37.79 
 
 
418 aa  202  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22150  L-glutaminase  36.33 
 
 
456 aa  197  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2907  glutaminase  34.31 
 
 
326 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0924561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3164  glutaminase  34.31 
 
 
326 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.566002 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2932  glutaminase  33.99 
 
 
326 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2857  glutaminase  33.99 
 
 
326 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.872371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3155  glutaminase  33.99 
 
 
326 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3171  glutaminase  33.99 
 
 
326 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3142  glutaminase  33.66 
 
 
326 aa  186  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2097  glutaminase  33.66 
 
 
326 aa  185  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851377  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2044  glutaminase  34.84 
 
 
307 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  35.6 
 
 
311 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25660  L-glutaminase  34.24 
 
 
333 aa  181  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0571  glutaminase  35.79 
 
 
307 aa  179  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  36.59 
 
 
311 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0557  glutaminase  35.45 
 
 
307 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0751  glutaminase  33.77 
 
 
304 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5532  glutaminase  34.27 
 
 
304 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25618 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2961  glutaminase  33.44 
 
 
308 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2652  glutaminase  33.97 
 
 
309 aa  175  8e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3676  glutaminase  33.44 
 
 
304 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.471921 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  34.64 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1127  glutaminase  33.45 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5348  glutaminase  34.24 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  0.201751 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4370  glutaminase  31.9 
 
 
333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00679253  normal  0.0112972 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4940  glutaminase  34.24 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.000018103 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1254  L-glutaminase  34.59 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0305  Glutaminase  35.11 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4887  glutaminase  33.66 
 
 
304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000632239 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2375  glutaminase  33.65 
 
 
309 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188361  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  32.91 
 
 
309 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3428  glutaminase  33.9 
 
 
304 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0507  glutaminase  33.44 
 
 
306 aa  172  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3725  glutaminase  34.73 
 
 
309 aa  170  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4504  glutaminase  32.91 
 
 
309 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0814  glutaminase  34.36 
 
 
304 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0029  glutaminase  34.36 
 
 
304 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.359819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0934  glutaminase  34.36 
 
 
304 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1594  glutaminase  34.36 
 
 
304 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2189  glutaminase  34.36 
 
 
304 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0842  glutaminase  34.36 
 
 
304 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1788  glutaminase  33.55 
 
 
346 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  35.89 
 
 
315 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4570  glutaminase  33.01 
 
 
309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2331  glutaminase  31.63 
 
 
309 aa  166  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5773  glutaminase  32.41 
 
 
304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1541  glutaminase  33.33 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345343  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1946  glutaminase  33.56 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2155  glutaminase  33.56 
 
 
309 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948088 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2917  glutaminase  33.56 
 
 
434 aa  160  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1928  glutaminase  33.1 
 
 
308 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0553  glutaminase  33.22 
 
 
309 aa  155  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00275922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0471  glutaminase  33.22 
 
 
309 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.233073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0410  glutaminase  33.22 
 
 
309 aa  155  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0499  glutaminase  33.22 
 
 
309 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0044437  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0555  glutaminase  33.22 
 
 
309 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000637393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0414  glutaminase  33.56 
 
 
309 aa  155  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000025535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4820  glutaminase  33.22 
 
 
309 aa  155  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404932  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0480  glutaminase  33.22 
 
 
309 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0502  glutaminase  33.22 
 
 
309 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>