102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2124 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2124  calcium/sodium:proton antiporter  100 
 
 
366 aa  723    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2523  calcium/sodium:proton antiporter  100 
 
 
366 aa  723    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2233  calcium/sodium:proton antiporter  100 
 
 
366 aa  723    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2920  calcium/sodium:proton antiporter  83.79 
 
 
366 aa  622  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2267  calcium/sodium:proton antiporter  79.89 
 
 
366 aa  578  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2574  calcium/sodium:proton antiporter  79.61 
 
 
366 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2332  calcium/sodium:proton antiporter  78.25 
 
 
364 aa  563  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1902  calcium/sodium:proton antiporter  78.73 
 
 
366 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.22655  normal  0.347346 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1966  calcium/sodium:proton antiporter  78.45 
 
 
366 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.788667 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1908  calcium/sodium:proton antiporter  78.73 
 
 
366 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1552  calcium/sodium:proton antiporter  78.45 
 
 
366 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.154529 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1368  calcium/sodium:proton antiporter  78.45 
 
 
366 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.455587  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1757  calcium/sodium:proton antiporter  77.37 
 
 
366 aa  552  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1699  calcium/sodium:proton antiporter  78.37 
 
 
366 aa  548  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.569241  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01194  calcium/sodium:proton antiporter  78.09 
 
 
366 aa  547  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2430  calcium/proton exchanger  78.09 
 
 
366 aa  545  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1324  calcium/sodium:proton antiporter  78.09 
 
 
366 aa  547  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.185191  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1366  calcium/sodium:proton antiporter  78.09 
 
 
366 aa  547  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0643431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2407  calcium/sodium:proton antiporter  78.09 
 
 
366 aa  547  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000227831 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1383  calcium/sodium:proton antiporter  78.09 
 
 
366 aa  547  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.779424  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01204  hypothetical protein  78.09 
 
 
366 aa  547  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1924  calcium/sodium:proton antiporter  78.09 
 
 
366 aa  543  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25776  normal  0.0698126 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1793  calcium/sodium:proton antiporter  76.58 
 
 
366 aa  513  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0979  sodium/calcium exchanger membrane region  47.06 
 
 
365 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3290  sodium/calcium exchanger membrane region  47.06 
 
 
365 aa  298  8e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0959  sodium/calcium exchanger membrane region  47.06 
 
 
361 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0994  sodium/calcium exchanger membrane region  47.06 
 
 
361 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1001  calcium/proton antiporter  46.07 
 
 
365 aa  297  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0910  sodium/calcium exchanger membrane region  49.06 
 
 
365 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3384  sodium/calcium exchanger membrane region  46.5 
 
 
370 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3511  sodium/calcium exchanger membrane region  41.07 
 
 
377 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3806  sodium/calcium exchanger membrane region  41.03 
 
 
377 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209552  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1359  sodium/calcium exchanger membrane region  39.94 
 
 
368 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0140249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3397  sodium/calcium exchanger membrane region  41.82 
 
 
365 aa  209  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689879  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6853  putative ionic transporter y4hA  39.14 
 
 
365 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal  0.370974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3493  sodium/calcium exchanger membrane region  38.64 
 
 
386 aa  204  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0439084  normal  0.408385 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3452  sodium/calcium exchanger membrane region  38.78 
 
 
368 aa  200  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0343  calcium/proton antiporter  36.78 
 
 
385 aa  199  9e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5773  sodium/calcium exchanger membrane region  38.49 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3837  sodium/calcium exchanger membrane region  38.49 
 
 
362 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4531  sodium/calcium exchanger membrane region  38.49 
 
 
362 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117991  normal  0.913167 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1393  calcium/proton exchanger  38.31 
 
 
381 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107806  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3387  sodium/calcium exchanger membrane region  35.18 
 
 
360 aa  196  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0305214  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1195  calcium/proton exchanger  38.31 
 
 
361 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0009  calcium/proton exchanger  38.31 
 
 
380 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0433  calcium/cation antiporter  38.31 
 
 
361 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1490  calcium/proton exchanger  38.31 
 
 
361 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1405  calcium/cation antiporter  38.31 
 
 
361 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1144  calcium/cation antiporter  38.31 
 
 
361 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.293577  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4424  sodium/calcium exchanger membrane region  37.83 
 
 
362 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612228  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3961  sodium/calcium exchanger membrane region  37.83 
 
 
362 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830114  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1646  sodium/calcium exchanger membrane region  36.27 
 
 
359 aa  192  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.23409  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0155  calcium/cation antiporter  37.99 
 
 
361 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.416293  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4124  sodium/calcium exchanger membrane region  37.83 
 
 
362 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5666  sodium/calcium exchanger membrane region  37.42 
 
 
380 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3965  sodium/calcium exchanger membrane region  38.68 
 
 
360 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116135  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3898  sodium/calcium exchanger membrane region  36.25 
 
 
360 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.905693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4012  sodium/calcium exchanger membrane region  36.25 
 
 
360 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.406694  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0265  sodium/calcium exchanger membrane region  42.58 
 
 
359 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.152273  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1316  Sodium/calcium exchanger  37.83 
 
 
362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572805  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0545  calcium/proton transporter, putative  36.68 
 
 
378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.97035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3735  sodium/calcium exchanger membrane region  34.87 
 
 
371 aa  179  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4970  sodium/calcium exchanger membrane region  38.34 
 
 
360 aa  179  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.14573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5473  sodium/calcium exchanger membrane region  40.89 
 
 
361 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6447  calcium/proton exchanger  33.97 
 
 
369 aa  175  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194017  normal  0.51142 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6051  sodium/calcium exchanger membrane region  35.98 
 
 
379 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1680  Ca2+/H+ antiporter  38.02 
 
 
360 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56452  normal  0.743279 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0997  Ca2+/H+ antiporter  38.73 
 
 
355 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0674  Sodium/calcium exchanger membrane region  30.99 
 
 
363 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774852  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4437  sodium/calcium antiporter  37.58 
 
 
355 aa  169  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.212303  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4874  putative sodium/calcium exchanger membrane region  34.63 
 
 
392 aa  169  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0764  calcium/proton antiporter, putative  30.34 
 
 
365 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3860  sodium/calcium exchanger membrane region  31.73 
 
 
358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0668  Sodium/calcium exchanger membrane region  29.72 
 
 
367 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1979  calcium/proton antiporter  30.27 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4399  Sodium/calcium exchanger membrane region  35.28 
 
 
361 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.636528  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0339  sodium/calcium exchanger membrane region  32.08 
 
 
343 aa  161  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3245  sodium/calcium exchanger membrane region  37.06 
 
 
382 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.71488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6768  sodium/calcium exchanger membrane region  32.63 
 
 
392 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3147  Ca2+/H+ antiporter  32.63 
 
 
385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409231  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2175  CaCA family calcium/proton exchanger  30.61 
 
 
382 aa  152  5.9999999999999996e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2992  sodium/calcium exchanger membrane region  33.54 
 
 
365 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198433  normal  0.141377 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11623  ionic transporter integral membrane protein chaA  35.62 
 
 
360 aa  133  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.140145 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2731  sodium/calcium exchanger membrane region  32.7 
 
 
365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0140  sodium/calcium exchanger membrane region  31.41 
 
 
374 aa  129  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24550  Ca2+/H+ antiporter  29.1 
 
 
440 aa  122  8e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0945764  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3557  calcium/proton antiporter, CaCA family  27.35 
 
 
365 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.494626 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2549  calcium/proton antiporter, CaCA family  27.35 
 
 
365 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4558  calcium/proton exchanger  27.55 
 
 
363 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3001  calcium/proton antiporter, CaCA family  24.11 
 
 
358 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0894  calcium/proton exchanger  23.7 
 
 
367 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0927  calcium/proton antiporter, CaCA family  28.4 
 
 
363 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0406  calcium/proton exchanger  23.43 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0393  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  23.11 
 
 
354 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0419  calcium/proton exchanger  23.43 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0465  calcium/proton exchanger  23.43 
 
 
351 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0397  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  23.43 
 
 
354 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1624  calcium/proton exchanger  24.07 
 
 
348 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000062591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0535  calcium/proton exchanger  23.43 
 
 
351 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0535  calcium/proton exchanger  23.43 
 
 
354 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>