More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1995 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  597  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  100 
 
 
289 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  100 
 
 
289 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  72.03 
 
 
288 aa  441  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  71.33 
 
 
293 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  68.88 
 
 
286 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  70.63 
 
 
293 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  68.88 
 
 
286 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  68.53 
 
 
286 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  68.53 
 
 
286 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  68.53 
 
 
286 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  70.28 
 
 
288 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  68.88 
 
 
288 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  68.18 
 
 
288 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  68.18 
 
 
288 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  68.18 
 
 
288 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  67.48 
 
 
288 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  67.48 
 
 
288 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  67.48 
 
 
288 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  67.48 
 
 
288 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  67.48 
 
 
288 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  67.93 
 
 
293 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  68.53 
 
 
288 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  67.48 
 
 
288 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  67.48 
 
 
288 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  68.53 
 
 
288 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  67.36 
 
 
290 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  65.73 
 
 
288 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  65.38 
 
 
305 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  64.69 
 
 
292 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  64.34 
 
 
288 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  64.69 
 
 
295 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  64.11 
 
 
293 aa  392  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2453  pirin domain-containing protein  65.28 
 
 
291 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  62.94 
 
 
293 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  63.99 
 
 
288 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  63.99 
 
 
295 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  63.67 
 
 
290 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4321  pirin domain-containing protein  66.43 
 
 
303 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2359  pirin domain-containing protein  62.94 
 
 
295 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397775  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  65.37 
 
 
286 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  59.79 
 
 
288 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  62.24 
 
 
287 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  64.66 
 
 
286 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  60.84 
 
 
288 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  60.07 
 
 
286 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  58.95 
 
 
290 aa  353  1e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  54.7 
 
 
287 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4059  Pirin domain protein  51.05 
 
 
290 aa  310  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0792  pirin family protein  46.85 
 
 
293 aa  281  7.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42930  predicted protein  46.71 
 
 
311 aa  268  7e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1938  pirin family protein  47.06 
 
 
288 aa  265  7e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0765198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  47.2 
 
 
286 aa  259  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  43.43 
 
 
282 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  42.86 
 
 
290 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  42.86 
 
 
290 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  42.86 
 
 
290 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  42.86 
 
 
290 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  42.86 
 
 
290 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  42.86 
 
 
290 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  41.85 
 
 
290 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  42.96 
 
 
290 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  42.4 
 
 
282 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  42.22 
 
 
290 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  42.96 
 
 
290 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  42.96 
 
 
290 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  42.59 
 
 
290 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  41.81 
 
 
337 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  42.59 
 
 
290 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6985  Pirin domain protein  40.23 
 
 
287 aa  201  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.16689  hitchhiker  0.00000014497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  41.5 
 
 
286 aa  199  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1048  Pirin-like  42.18 
 
 
322 aa  194  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0624  Pirin domain protein  39.6 
 
 
323 aa  193  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  40.07 
 
 
292 aa  192  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  40.51 
 
 
318 aa  191  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  37.83 
 
 
328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5507  pirin domain-containing protein  41.52 
 
 
322 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  40.4 
 
 
337 aa  188  9e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00280  Pirin-related protein  38.57 
 
 
342 aa  187  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  36.99 
 
 
315 aa  186  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5014  Pirin domain protein  36.51 
 
 
286 aa  185  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0099  pirin domain-containing protein  37.8 
 
 
324 aa  185  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.854553  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  38.29 
 
 
290 aa  185  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0747  pirin domain-containing protein  38.57 
 
 
324 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.989283  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  39.78 
 
 
346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  37.82 
 
 
331 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  0.0000248585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  39.01 
 
 
320 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  38.97 
 
 
292 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  38.69 
 
 
294 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0677  hypothetical protein  36.68 
 
 
293 aa  176  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  39.25 
 
 
307 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  38.43 
 
 
287 aa  176  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  37.88 
 
 
310 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0074  pirin domain-containing protein  37.25 
 
 
328 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416203  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0084  Pirin-like protein  37.25 
 
 
328 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0093  pirin domain-containing protein  37.25 
 
 
328 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28108  normal  0.0211992 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2491  Pirin domain protein  39.15 
 
 
277 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  39.46 
 
 
293 aa  170  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  41.51 
 
 
298 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  37.02 
 
 
288 aa  168  9e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>