More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1986 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2350  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 		 137 aa  291  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167897  normal  0.0377518 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2095  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 		 137 aa  291  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000449437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1986  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 		 137 aa  291  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000131447  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2727  methionine sulfoxide reductase B  74.45 
 
 		 137 aa  233  8e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00340114  hitchhiker  0.000973633 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1884  methionine sulfoxide reductase B  70.8 
 
 		 137 aa  217  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000227022  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1385  methionine sulfoxide reductase B  70.8 
 
 		 137 aa  216  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0497198  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1418  methionine sulfoxide reductase B  70.8 
 
 		 137 aa  216  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.445758 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2065  methionine sulfoxide reductase B  70.8 
 
 		 137 aa  216  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.717826  hitchhiker  0.00120288 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1402  methionine sulfoxide reductase B  70.8 
 
 		 137 aa  216  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  hitchhiker  0.0051199 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1972  methionine-R-sulfoxide reductase  76.15 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2214  methionine-R-sulfoxide reductase  67.39 
 
 		 138 aa  211  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.399657  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1863  methionine sulfoxide reductase B  70.07 
 
 		 137 aa  209  9e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000150257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1854  methionine sulfoxide reductase B  70.07 
 
 		 137 aa  209  9e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0487085  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01747  methionine sulfoxide reductase B  69.34 
 
 		 137 aa  208  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0193587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1864  methionine-R-sulfoxide reductase  69.34 
 
 		 137 aa  208  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000480706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01735  hypothetical protein  69.34 
 
 		 137 aa  208  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2002  methionine sulfoxide reductase B  69.34 
 
 		 137 aa  208  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00962024  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2502  methionine sulfoxide reductase B  69.34 
 
 		 137 aa  208  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1413  methionine sulfoxide reductase B  69.34 
 
 		 137 aa  208  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1676  methionine sulfoxide reductase B  66.42 
 
 		 137 aa  208  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000216334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1966  methionine sulfoxide reductase B  68.94 
 
 		 139 aa  207  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0169175  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2262  methionine sulfoxide reductase B  70.4 
 
 		 139 aa  203  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00190122  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  64.35 
 
 		 166 aa  167  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  63.48 
 
 		 136 aa  167  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1850  methionine sulfoxide reductase B  61.4 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  56.45 
 
 		 148 aa  157  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  55.47 
 
 		 132 aa  157  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1584  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 		 147 aa  157  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000628294  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  55.47 
 
 		 132 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  57.02 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  54.69 
 
 		 134 aa  154  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3401  methionine sulfoxide reductase B  60.87 
 
 		 141 aa  153  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  59.48 
 
 		 131 aa  153  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  56.25 
 
 		 128 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  56.25 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  51.88 
 
 		 142 aa  150  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  53.91 
 
 		 133 aa  149  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  53.91 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  54.2 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  57.39 
 
 		 137 aa  148  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  56.52 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  54.31 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  57.89 
 
 		 146 aa  147  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  54.4 
 
 		 140 aa  147  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  55.12 
 
 		 134 aa  147  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  53.12 
 
 		 131 aa  147  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 136 aa  147  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  57.02 
 
 		 140 aa  147  7e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  57.52 
 
 		 136 aa  146  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  53.91 
 
 		 131 aa  146  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  55.37 
 
 		 133 aa  146  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  53.28 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03070  methionine sulfoxide reductase B  57.14 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  55.28 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  50.77 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  51.97 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0440  methionine sulfoxide reductase B  56.91 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  56.03 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  55.12 
 
 		 133 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  52.8 
 
 		 140 aa  144  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  51.13 
 
 		 135 aa  144  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  57.02 
 
 		 138 aa  144  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  56.52 
 
 		 134 aa  144  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  53.66 
 
 		 321 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  53.66 
 
 		 321 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2558  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 141 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0971304  normal  0.867883 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  53.66 
 
 		 321 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2945  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 141 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  52.85 
 
 		 321 aa  142  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  52.85 
 
 		 321 aa  142  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  52.85 
 
 		 133 aa  143  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  52.85 
 
 		 321 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  58.26 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  52.85 
 
 		 321 aa  142  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  51.18 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  51.22 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  52.85 
 
 		 321 aa  142  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  52.85 
 
 		 321 aa  142  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  53.66 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2329  methionine sulfoxide reductase B  53.08 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  52.85 
 
 		 138 aa  141  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  53.66 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  52.85 
 
 		 321 aa  141  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  57.52 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  53.66 
 
 		 159 aa  140  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  53.12 
 
 		 133 aa  140  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  54.78 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  50.39 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  53.91 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  52 
 
 		 144 aa  137  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5350  methionine sulfoxide reductase B  53.97 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  55.08 
 
 		 133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  51.67 
 
 		 321 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2342  methionine-R-sulfoxide reductase  51.61 
 
 		 125 aa  137  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929654  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 141 aa  137  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2975  protein-methionine-S-oxide reductase  50 
 
 		 135 aa  137  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0725689 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0125  methionine sulfoxide reductase B  53.79 
 
 		 147 aa  137  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  51.97 
 
 		 185 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7118  methionine-R-sulfoxide reductase  53.15 
 
 		 171 aa  136  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  56.03 
 
 		 133 aa  135  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>