More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1884 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01868  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  79.27 
 
 
504 aa  804  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.97097  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  79.27 
 
 
504 aa  804  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00548515  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  80.08 
 
 
506 aa  829  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01857  hypothetical protein  79.27 
 
 
504 aa  804  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.974378  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  83.37 
 
 
507 aa  864  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  79.84 
 
 
504 aa  806  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.74587  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1286  L-arabinose transporter ATP-binding protein  79.47 
 
 
504 aa  805  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00939133  hitchhiker  1.20675e-07 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2330  L-arabinose transporter ATP-binding protein  83.37 
 
 
507 aa  865  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1735  L-arabinose transporter ATP-binding protein  79.27 
 
 
504 aa  804  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1024  L-arabinose transporter ATP-binding protein  79.47 
 
 
504 aa  806  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  100 
 
 
523 aa  1067  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2636  L-arabinose transporter ATP-binding protein  79.27 
 
 
504 aa  804  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  4.58478e-11 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2131  L-arabinose transporter ATP-binding protein  79.47 
 
 
504 aa  805  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00340592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1884  L-arabinose transporter ATP-binding protein  100 
 
 
523 aa  1067  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326668  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  84.82 
 
 
511 aa  872  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  5.48441e-07 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  81.69 
 
 
507 aa  840  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2262  L-arabinose transporter ATP-binding protein  99.81 
 
 
523 aa  1065  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1743  ABC transporter related protein  79.27 
 
 
504 aa  804  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2372  L-arabinose transporter ATP-binding protein  58.54 
 
 
507 aa  588  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.245048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2639  L-arabinose ABC transporter, ATP-binding protein  58.05 
 
 
507 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0558785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4140  L-arabinose transporter ATP-binding protein  57.71 
 
 
514 aa  578  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.17 
 
 
515 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.77 
 
 
522 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.97 
 
 
515 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2614  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.8 
 
 
504 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383886  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.97 
 
 
515 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.38 
 
 
519 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2586  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.77 
 
 
511 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.97 
 
 
511 aa  544  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519724  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0547  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.17 
 
 
516 aa  541  1e-152  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429295  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.79 
 
 
515 aa  540  1e-152  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1180  L-arabinose transporter ATP-binding protein  56.73 
 
 
503 aa  539  1e-152  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.62 
 
 
520 aa  540  1e-152  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0511877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3410  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.77 
 
 
512 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0659281  normal  0.140224 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2485  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.38 
 
 
503 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0590  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.71 
 
 
503 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164103  normal  0.0495673 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3704  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.31 
 
 
503 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0139  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.71 
 
 
503 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3485  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.58 
 
 
503 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2757  L-arabinose transporter ATP-binding protein  53.53 
 
 
511 aa  532  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.68449  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0622  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.71 
 
 
503 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0518663  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3447  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.38 
 
 
503 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3483  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.58 
 
 
503 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1265  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.38 
 
 
503 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  53.28 
 
 
525 aa  534  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0405  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.38 
 
 
503 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3300  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.38 
 
 
503 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0547  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.44 
 
 
503 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0138907  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2599  L-arabinose transporter ATP-binding protein  52.21 
 
 
509 aa  521  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2763  L-arabinose transporter ATP-binding protein  53.06 
 
 
520 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691602  normal  0.315971 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3009  L-arabinose transporter ATP-binding protein  52.21 
 
 
509 aa  518  1e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3776  L-arabinose transporter ATP-binding protein  52.17 
 
 
514 aa  517  1e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.947339  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4218  L-arabinose transporter ATP-binding protein  52.23 
 
 
520 aa  516  1e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231533  normal  0.845406 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1020  L-arabinose transporter ATP-binding protein  52.34 
 
 
497 aa  515  1e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.537406  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0523  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.49 
 
 
487 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.431344  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3961  L-arabinose transporter ATP-binding protein  51.87 
 
 
515 aa  505  1e-142  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3601  L-arabinose transporter ATP-binding protein  50.31 
 
 
508 aa  493  1e-138  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611963  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3764  L-arabinose transporter ATP-binding protein  47.45 
 
 
501 aa  459  1e-128  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.639409  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3476  L-arabinose transporter ATP-binding protein  46.84 
 
 
501 aa  454  1e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  46.03 
 
 
494 aa  441  1e-122  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  46.84 
 
 
496 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.05 
 
 
501 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  45.33 
 
 
495 aa  428  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  45.6 
 
 
514 aa  426  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  44.85 
 
 
501 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  44.93 
 
 
505 aa  423  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  42.74 
 
 
513 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  44.2 
 
 
499 aa  423  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  43.15 
 
 
513 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  42.33 
 
 
516 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  43.65 
 
 
514 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  44.4 
 
 
501 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  43.65 
 
 
514 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  44.31 
 
 
516 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  43.65 
 
 
514 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  44.44 
 
 
496 aa  416  1e-115  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  44.67 
 
 
508 aa  417  1e-115  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0711  ABC transporter related  45.53 
 
 
495 aa  417  1e-115  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109933  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  41.75 
 
 
498 aa  416  1e-115  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  44.33 
 
 
497 aa  416  1e-115  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  41.62 
 
 
512 aa  415  1e-115  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  44.65 
 
 
519 aa  418  1e-115  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  42.33 
 
 
524 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  43.38 
 
 
495 aa  412  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  41.9 
 
 
524 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  42.33 
 
 
524 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.48 
 
 
527 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  42.28 
 
 
524 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  44.67 
 
 
511 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  42 
 
 
523 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 
507 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  42.48 
 
 
524 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  42.33 
 
 
524 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  43.29 
 
 
513 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  45.34 
 
 
507 aa  411  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  44.07 
 
 
525 aa  409  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  42.11 
 
 
521 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  43.62 
 
 
504 aa  411  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  43.43 
 
 
500 aa  409  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  44.53 
 
 
506 aa  411  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>