More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1749 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2441  pyruvate kinase  85.74 
 
 
470 aa  814  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2187  pyruvate kinase  92.13 
 
 
470 aa  885  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  5.45007e-08  hitchhiker  5.75338e-07 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2582  pyruvate kinase  100 
 
 
470 aa  954  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00785837  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2390  pyruvate kinase  86.6 
 
 
470 aa  834  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  7.43671e-07  hitchhiker  1.73681e-05 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1855  pyruvate kinase  100 
 
 
470 aa  954  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  8.69854e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1955  pyruvate kinase  86.6 
 
 
470 aa  834  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  4.01811e-06  unclonable  1.4136e-08 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1520  pyruvate kinase  86.6 
 
 
470 aa  834  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.24591e-07  decreased coverage  3.36273e-09 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1702  pyruvate kinase  85.96 
 
 
470 aa  819  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  4.72586e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01635  hypothetical protein  86.6 
 
 
470 aa  834  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  4.27708e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1664  pyruvate kinase  86.6 
 
 
469 aa  823  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  4.86614e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1877  pyruvate kinase  86.6 
 
 
470 aa  834  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  1.80077e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1491  pyruvate kinase  86.81 
 
 
470 aa  839  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0197868  hitchhiker  4.13859e-15 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1511  pyruvate kinase  86.81 
 
 
470 aa  839  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00345195  hitchhiker  2.77605e-09 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1475  pyruvate kinase  86.81 
 
 
470 aa  839  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.0298859 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1793  pyruvate kinase  86.81 
 
 
470 aa  839  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  2.63395e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2701  pyruvate kinase  78.72 
 
 
470 aa  747  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1892  pyruvate kinase  86.6 
 
 
470 aa  834  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.4147e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1757  pyruvate kinase  86.6 
 
 
470 aa  834  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.18747e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01645  pyruvate kinase  86.6 
 
 
470 aa  834  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  3.22143e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1966  pyruvate kinase  86.6 
 
 
470 aa  834  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  9.9684e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001645  pyruvate kinase  78.09 
 
 
470 aa  733  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  4.13201e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1768  pyruvate kinase  86.47 
 
 
473 aa  831  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  5.14797e-07  unclonable  2.09228e-06 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1964  pyruvate kinase  86.81 
 
 
470 aa  839  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000120282  hitchhiker  2.45997e-09 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0037  pyruvate kinase  76.81 
 
 
470 aa  726  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2744  pyruvate kinase  85.04 
 
 
491 aa  806  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000110572  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2879  pyruvate kinase  70.64 
 
 
469 aa  670  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.357906  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00829  pyruvate kinase  77.45 
 
 
470 aa  726  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1749  pyruvate kinase  100 
 
 
470 aa  954  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.39981e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1716  pyruvate kinase  62.34 
 
 
469 aa  566  1e-160  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0413  pyruvate kinase  60.8 
 
 
479 aa  551  1e-155  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  52.32 
 
 
587 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  52.31 
 
 
588 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  52.09 
 
 
585 aa  465  1e-130  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  52.1 
 
 
585 aa  461  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  52.31 
 
 
585 aa  464  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  50.42 
 
 
583 aa  464  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  6.47409e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  52.22 
 
 
584 aa  462  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.82258e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  51.89 
 
 
585 aa  460  1e-128  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  51.89 
 
 
585 aa  460  1e-128  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  51.89 
 
 
585 aa  460  1e-128  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  51.89 
 
 
585 aa  460  1e-128  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  51.89 
 
 
585 aa  460  1e-128  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  51.89 
 
 
585 aa  460  1e-128  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  51.89 
 
 
585 aa  460  1e-128  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  51.89 
 
 
585 aa  461  1e-128  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0351  pyruvate kinase  51.06 
 
 
467 aa  454  1e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0288145  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0342  pyruvate kinase  50.85 
 
 
467 aa  454  1e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  50.53 
 
 
585 aa  453  1e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  1.0731e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  50.63 
 
 
582 aa  446  1e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  49.27 
 
 
590 aa  437  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  49.58 
 
 
577 aa  433  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  47.06 
 
 
474 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  49.68 
 
 
472 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  49.68 
 
 
580 aa  426  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  47.06 
 
 
474 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  47.56 
 
 
578 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0882  pyruvate kinase  47.48 
 
 
589 aa  421  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.441073  hitchhiker  2.01084e-13 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  45.26 
 
 
580 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  46.53 
 
 
580 aa  417  1e-115  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  46.64 
 
 
582 aa  417  1e-115  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  48.64 
 
 
583 aa  417  1e-115  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0751  pyruvate kinase  47.55 
 
 
473 aa  414  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000115769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  47.05 
 
 
583 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1040  pyruvate kinase  46.8 
 
 
480 aa  410  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  46.72 
 
 
474 aa  406  1e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  9.57395e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0775  pyruvate kinase  48.02 
 
 
473 aa  405  1e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.153908  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  44.82 
 
 
581 aa  404  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  47.91 
 
 
585 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  47.28 
 
 
585 aa  405  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  47.91 
 
 
585 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1115  pyruvate kinase  46.8 
 
 
490 aa  391  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  1.41137e-07  hitchhiker  5.41512e-14 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1002  pyruvate kinase  45.93 
 
 
477 aa  389  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_56445  kinase pyruvate kinase 3  45.32 
 
 
543 aa  387  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2535  pyruvate kinase  43.79 
 
 
471 aa  387  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0129939  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03080  pyruvate kinase, putative  45.32 
 
 
572 aa  384  1e-105  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  45.88 
 
 
585 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  46.3 
 
 
586 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05210  Pyruvate kinase (PK)(EC 2.7.1.40) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22360]  45.57 
 
 
526 aa  380  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1163  pyruvate kinase  41.77 
 
 
500 aa  379  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  44.66 
 
 
478 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  45.3 
 
 
479 aa  376  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  1.34054e-09 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  45.28 
 
 
471 aa  378  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  44.04 
 
 
471 aa  373  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1221  pyruvate kinase  44.14 
 
 
472 aa  373  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.724591  normal  0.678636 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40662  predicted protein  46.99 
 
 
572 aa  369  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.612902  normal  0.0247222 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27708  predicted protein  47.18 
 
 
527 aa  370  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0235252 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1456  pyruvate kinase  40.59 
 
 
502 aa  370  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.348226  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  45.2 
 
 
474 aa  371  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  44.4 
 
 
594 aa  371  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  43.58 
 
 
589 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0941  pyruvate kinase  40.96 
 
 
500 aa  369  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45997  kinase pyruvate kinase 4a  44.11 
 
 
535 aa  366  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.01235  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49098  kinase pyruvate kinase 2  43.88 
 
 
513 aa  365  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51163  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83166  pyruvate kinase  44.14 
 
 
504 aa  368  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27502  kinase pyruvate kinase 4b  44.11 
 
 
535 aa  366  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0142086  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  42.68 
 
 
582 aa  367  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  42.95 
 
 
590 aa  361  2e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  43.22 
 
 
478 aa  359  6e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2215  pyruvate kinase  44.59 
 
 
474 aa  358  1e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  43.58 
 
 
476 aa  357  2e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>