49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1748 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2583  major outer membrane lipoprotein  100 
 
 
81 aa  150  6e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.15895e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1854  LPP repeat-containing protein  100 
 
 
78 aa  150  6e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  7.96453e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1748  major outer membrane lipoprotein  100 
 
 
78 aa  150  6e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.4636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2186  LPP repeat-containing protein  96.15 
 
 
78 aa  147  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  3.06733e-11  hitchhiker  3.05308e-07 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1767  LPP repeat-containing protein  93.59 
 
 
78 aa  143  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  8.00001e-09  unclonable  1.27827e-06 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2442  LPP repeat-containing protein  91.03 
 
 
78 aa  141  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000387277  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2745  LPP repeat-containing protein  91.03 
 
 
78 aa  141  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  7.53676e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1474  major outer membrane lipoprotein  91.03 
 
 
78 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  8.04906e-08  normal  0.0109348 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1490  major outer membrane lipoprotein  91.03 
 
 
78 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  3.17688e-06  hitchhiker  1.24306e-14 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1965  major outer membrane lipoprotein  91.03 
 
 
78 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  5.37115e-06  decreased coverage  1.67771e-10 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1794  major outer membrane lipoprotein  91.03 
 
 
78 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  7.10111e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1510  major outer membrane lipoprotein  91.03 
 
 
78 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  9.17327e-06  hitchhiker  2.17872e-09 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1519  major outer membrane lipoprotein  87.18 
 
 
78 aa  132  2e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.33689e-10  decreased coverage  9.78616e-10 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1954  LPP repeat-containing protein  87.18 
 
 
78 aa  132  2e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  3.68464e-09  unclonable  8.44814e-09 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2391  major outer membrane lipoprotein  87.18 
 
 
78 aa  132  2e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  9.96739e-10  decreased coverage  2.5912e-06 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01636  hypothetical protein  87.18 
 
 
78 aa  132  2e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.4736e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1878  major outer membrane lipoprotein  87.18 
 
 
78 aa  132  2e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  5.16329e-15  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01646  murein lipoprotein  87.18 
 
 
78 aa  132  2e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.90635e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1893  major outer membrane lipoprotein  87.18 
 
 
78 aa  132  2e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.01718e-13  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1965  LPP repeat-containing protein  87.18 
 
 
78 aa  132  2e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  8.12979e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1758  major outer membrane lipoprotein  87.18 
 
 
78 aa  132  2e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.20557e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1795  hypothetical protein  86.3 
 
 
79 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  2.58833e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1473  hypothetical protein  84.93 
 
 
79 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  9.26239e-08  normal  0.022042 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1966  hypothetical protein  79.22 
 
 
80 aa  120  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  5.59478e-06  hitchhiker  1.39787e-09 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1489  hypothetical protein  84.93 
 
 
79 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  4.83373e-05  hitchhiker  8.89895e-13 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1701  LPP repeat-containing protein  76.92 
 
 
78 aa  119  2e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  6.09145e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1663  LPP repeat-containing protein  76.92 
 
 
78 aa  117  4e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  2.05201e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1508  hypothetical protein  80.82 
 
 
79 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0719392  hitchhiker  1.92461e-09 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3344  putative outer membrane lipoprotein  53.97 
 
 
77 aa  79.7  1e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3299  putative outer membrane lipoprotein  50 
 
 
85 aa  74.7  4e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.117538 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3483  putative outer membrane lipoprotein  50 
 
 
85 aa  74.7  4e-13  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3193  putative outer membrane lipoprotein  50 
 
 
85 aa  74.7  4e-13  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0682  putative outer membrane lipoprotein  50 
 
 
85 aa  74.7  4e-13  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0685  putative lipoprotein  50 
 
 
85 aa  74.7  4e-13  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3443  putative outer membrane lipoprotein  50 
 
 
85 aa  74.7  4e-13  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02887  predicted outer membrane lipoprotein  50 
 
 
85 aa  74.7  4e-13  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02837  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  74.7  4e-13  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4326  putative outer membrane lipoprotein  50 
 
 
85 aa  73.9  6e-13  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0089  major outer membrane lipoprotein  35.96 
 
 
114 aa  64.7  4e-10  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.186795  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2623  major outer membrane lipoprotein, putative  40.24 
 
 
81 aa  55.1  3e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0202513  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2985  major outer membrane lipoprotein, putative  35.96 
 
 
88 aa  50.8  6e-06  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73465  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3159  major outer membrane lipoprotein, putative  35.96 
 
 
88 aa  48.5  3e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.764364  normal  0.139344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1154  major outer membrane lipoprotein, putative  35.96 
 
 
88 aa  48.5  3e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0547044  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1198  major outer membrane lipoprotein, putative  35.96 
 
 
88 aa  48.5  3e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1231  major outer membrane lipoprotein, putative  35.96 
 
 
88 aa  48.5  3e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.942856  normal  0.491239 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2824  major outer membrane lipoprotein, putative  34.83 
 
 
88 aa  44.3  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.86041e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0970  major outer membrane lipoprotein, putative  33.71 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  3.94431e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1083  major outer membrane lipoprotein, putative  37.08 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  2.93694e-07  normal  0.0136333 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1165  major outer membrane lipoprotein, putative  31.52 
 
 
88 aa  40.4  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.70818e-07  hitchhiker  0.000784933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>