224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1663 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2108  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  55.04 
 
 
782 aa  879    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424267 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2362  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.18 
 
 
797 aa  645    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  43.62 
 
 
808 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.218123  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1802  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.45 
 
 
781 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0548904  normal  0.220264 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1774  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  99.39 
 
 
815 aa  1639    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.613765  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1962  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.7 
 
 
765 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2671  fimbrial usher protein  99.26 
 
 
815 aa  1639    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0183033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3333  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.18 
 
 
797 aa  644    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1663  fimbrial usher protein  100 
 
 
815 aa  1650    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61540  hypothetical protein  42.73 
 
 
790 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.675454  normal  0.215257 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2677  fimbrial usher protein  42.11 
 
 
766 aa  619  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5301  hypothetical protein  42.93 
 
 
790 aa  621  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1793  putative fimbriae-related protein  42.19 
 
 
810 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1399  fimbrial usher protein  42.08 
 
 
782 aa  611  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0477  fimbrial usher family protein  42.08 
 
 
803 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.468363  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1636  fimbrial usher protein  41.96 
 
 
803 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1614  fimbrial usher protein  42.37 
 
 
803 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2819  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.17 
 
 
788 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2459  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.77 
 
 
794 aa  552  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1446  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.32 
 
 
789 aa  546  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.79 
 
 
786 aa  514  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.930496 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001218  CsuD  32.95 
 
 
804 aa  439  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03043  signal peptide protein  30.44 
 
 
786 aa  350  9e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.117793  normal  0.374685 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4395  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.43 
 
 
794 aa  345  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621063  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0865  fimbrial usher protein  30.49 
 
 
842 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142606  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2341  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.09 
 
 
816 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2475  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.4 
 
 
748 aa  336  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5759  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.08 
 
 
785 aa  334  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1069  fimbrial usher protein  31.02 
 
 
766 aa  332  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1220  fimbrial usher protein  30.9 
 
 
803 aa  331  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348737  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1062  P pilus assembly protein, porin PapC  31.1 
 
 
766 aa  331  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819207  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1921  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.48 
 
 
775 aa  330  5.0000000000000004e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1268  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.95 
 
 
849 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0271633  normal  0.105864 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2992  fimbrial usher protein  30.64 
 
 
984 aa  327  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1607  fimbrial usher protein  30.64 
 
 
766 aa  327  7e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0719  fimbrial usher protein  30.52 
 
 
766 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.308044  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2294  fimbrial usher protein  30.52 
 
 
766 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.46 
 
 
834 aa  312  2e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0007  outer membrane usher protein, putative  29.99 
 
 
814 aa  300  8e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0008  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.99 
 
 
807 aa  300  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.333359  hitchhiker  0.00375796 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01136  outer membrane usher protein FasD  31.7 
 
 
783 aa  296  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0354539  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2693  putative outer membrane usher transmembrane protein  27.26 
 
 
754 aa  263  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.513198 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1270  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.37 
 
 
790 aa  246  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.465422 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0778  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.16 
 
 
778 aa  238  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.243314  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0610  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.71 
 
 
798 aa  197  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000874993  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0144  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.71 
 
 
791 aa  197  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0342  putative outer membrane usher protein fimD  24.53 
 
 
765 aa  187  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2057  fimbrial biogenesis protein  22.28 
 
 
834 aa  160  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000165922  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0535  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.2 
 
 
734 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  23 
 
 
872 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3740  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.73 
 
 
778 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540058  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.13 
 
 
778 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0304  fimbrial biogenesis protein  24.19 
 
 
788 aa  95.5  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3599  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.73 
 
 
778 aa  95.5  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.48 
 
 
852 aa  92.8  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.71 
 
 
870 aa  93.2  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  23.71 
 
 
870 aa  93.6  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.18 
 
 
837 aa  82.8  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3960  outer membrane usher protein FimD  21.7 
 
 
842 aa  75.5  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3851  outer membrane usher protein FimD  21.54 
 
 
842 aa  75.1  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3916  fimbrial usher protein  21.7 
 
 
842 aa  74.7  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.834184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.41 
 
 
840 aa  73.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.09 
 
 
866 aa  72  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.46 
 
 
1040 aa  71.6  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2406  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.06 
 
 
812 aa  71.6  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2245  fimbrial usher protein  23.34 
 
 
826 aa  71.2  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.141315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1538  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.34 
 
 
826 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3835  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.08 
 
 
857 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.322059 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1548  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.34 
 
 
826 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.2778  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.14 
 
 
872 aa  69.7  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1477  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.86 
 
 
890 aa  69.7  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.432789  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1365  fimbrial usher protein  22.7 
 
 
833 aa  69.3  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.347917  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.02 
 
 
901 aa  68.6  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1889  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.99 
 
 
831 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716127 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2399  fimbrial usher protein  23.18 
 
 
826 aa  67.8  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0934  fimbrial usher protein  23.69 
 
 
826 aa  67.8  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1049  outer membrane usher protein fimD-like protein  21.76 
 
 
866 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.607471  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  22.19 
 
 
901 aa  67  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1055  outer membrane usher protein fimD  21.76 
 
 
866 aa  67  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0391  outer membrane fimbrial usher protein  22.02 
 
 
853 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0860729  normal  0.0225647 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.18 
 
 
856 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.124902 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2703  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.76 
 
 
866 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0538339  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2295  fimbrial usher protein  22.62 
 
 
829 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2384  fimbrial usher protein  22.86 
 
 
829 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0771751  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3092  fimbrial usher protein  21.66 
 
 
826 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.595563 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2179  outer membrane usher protein fimD-like protein  21.95 
 
 
866 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.932643  normal  0.834799 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00944  predicted outer membrane usher protein  21.76 
 
 
866 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.887822  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00951  hypothetical protein  21.76 
 
 
866 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.90606  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0431  outer membrane fimbrial usher protein  22.07 
 
 
853 aa  65.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000247284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2339  fimbrial usher protein  22.82 
 
 
828 aa  65.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.365526  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1499  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.77 
 
 
832 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2388  fimbrial usher protein  22.5 
 
 
828 aa  64.7  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1817  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.06 
 
 
851 aa  65.1  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513641 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0369  outer membrane fimbrial usher protein  22.02 
 
 
853 aa  64.7  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2496  fimbrial usher protein  22.71 
 
 
828 aa  64.7  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.775864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0371  outer membrane fimbrial usher protein  22.15 
 
 
853 aa  64.3  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2377  outer membrane usher protein fimD homolog  21.58 
 
 
866 aa  64.3  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.71 
 
 
963 aa  64.3  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  22.95 
 
 
913 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.25 
 
 
876 aa  63.9  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>