More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1526 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1633  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 346 aa  713    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1737  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 346 aa  713    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.000686199 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1526  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 346 aa  713    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0346  transcriptional regulator, LacI family  34.55 
 
 		 367 aa  193  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13608  LacI family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 404 aa  189  7e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311872 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35310  transcriptional regulator, LacI family  33.03 
 
 		 366 aa  186  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.263381  normal  0.860746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1479  LacI family transcription regulator  35.53 
 
 		 362 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1457  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.73 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5317  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.73 
 
 		 366 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4919  transcriptional regulator, LacI family  33.02 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0144  LacI family transcription regulator  32.47 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5101  LacI family transcription regulator  31.38 
 
 		 366 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.181934 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4716  LacI family transcription regulator  31.38 
 
 		 366 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417684  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4802  LacI family transcription regulator  31.38 
 
 		 366 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2243  LacI family transcription regulator  32.85 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2982  transcriptional regulator, LacI family  32 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000384304  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6966  LacI family transcription regulator  30.89 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1521  LacI family transcription regulator  30.89 
 
 		 388 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6308  LacI family transcription regulator  30.89 
 
 		 388 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.3516 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4340  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.11 
 
 		 366 aa  149  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02629  Transcriptional regulator  29.33 
 
 		 341 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2718  transcriptional regulator, LacI family  29.86 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.204137 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2909  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  28.24 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.420519 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3821  LacI family transcription regulator  29.91 
 
 		 324 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1312  periplasmic binding protein and sugar binding domain of the LacI family protein  30 
 
 		 353 aa  132  6.999999999999999e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3991  transcriptional regulator, LacI family protein  30.18 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00173292  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1119  transcriptional regulator, LacI family  28.93 
 
 		 350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4294  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0060  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0065  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0064  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 		 343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0063  LacI family transcription regulator  29.76 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000367552 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0061  LacI family transcription regulator  29.76 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000329359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0196  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.64 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7452  LacI family transcription regulator  30.31 
 
 		 357 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.390478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0065  LacI family transcription regulator  29.76 
 
 		 342 aa  125  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000194735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2559  alanine racemase  29.58 
 
 		 358 aa  123  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3061  transcriptional regulator, LacI family  29.24 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1849  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 358 aa  119  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0321954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1434  transcriptional regulator, LacI family  25.98 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07700  transcriptional regulator  27.37 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.241125  normal  0.0525574 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  29.1 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03890  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  30.47 
 
 		 343 aa  116  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  28.28 
 
 		 339 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3807  LacI family transcription regulator  27.4 
 
 		 350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0659508  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  27.88 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  26.51 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3181  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 348 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  26.11 
 
 		 340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.81 
 
 		 336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4590  LacI family transcription regulator  29.83 
 
 		 359 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  28.25 
 
 		 335 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  27.58 
 
 		 340 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0927  LacI family transcription regulator  29.26 
 
 		 335 aa  112  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5334  transcriptional regulator, LacI family  28.77 
 
 		 339 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.431046 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  28.98 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  26.89 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  26.99 
 
 		 338 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 331 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  26.36 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.92 
 
 		 336 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0274  alanine racemase  27.67 
 
 		 340 aa  109  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0294  LacI family transcription regulator  26.59 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.28119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  25.99 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.76 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  26.97 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2219  transcriptional regulator, LacI family  28.49 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000733875  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  27.53 
 
 		 336 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  28.05 
 
 		 339 aa  106  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  26.07 
 
 		 348 aa  106  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  25.99 
 
 		 340 aa  106  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  26.36 
 
 		 348 aa  106  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 359 aa  105  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05790  transcriptional regulator  26.37 
 
 		 347 aa  105  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  26.39 
 
 		 335 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0459  LacI family transcription regulator  27.91 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  26.7 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  27.79 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4446  transcriptional regulator, LacI family  28.73 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2691  transcriptional regulator, LacI family  27.99 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5848  LacI family transcription regulator  27.35 
 
 		 365 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  26.25 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0764  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.49 
 
 		 348 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  27.32 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1397  LacI family transcription regulator  27.6 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620296 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002440  transcriptional regulator LacI family  25.82 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0100228  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  26.33 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  26.3 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3324  LacI family transcription regulator  28.45 
 
 		 347 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370251  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  26.05 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  27.81 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  27.92 
 
 		 332 aa  103  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1965  LacI family transcription regulator  27.79 
 
 		 338 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1855  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  27.79 
 
 		 338 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  27.05 
 
 		 338 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  25 
 
 		 340 aa  102  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>