74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1501 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1606  outer membrane protein X  100 
 
 
174 aa  355  2e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0413281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1767  outer membrane protein X  100 
 
 
174 aa  355  2e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.37049e-09  normal  0.012422 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1501  outer membrane protein X  100 
 
 
174 aa  355  2e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.02654e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1484  outer membrane protein X  71.26 
 
 
172 aa  244  5e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0871  outer membrane protein X  70.69 
 
 
171 aa  236  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.676559  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0962  outer membrane protein X  70.69 
 
 
171 aa  236  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0899  outer membrane protein X  70.69 
 
 
171 aa  236  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0983  outer membrane protein X  70.69 
 
 
171 aa  236  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0838  outer membrane protein X  70.69 
 
 
171 aa  235  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.202918  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00781  outer membrane protein X  70.69 
 
 
171 aa  235  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2534  outer membrane protein X  70.69 
 
 
171 aa  235  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0526917  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0963  outer membrane protein X  70.69 
 
 
171 aa  235  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00475804  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2829  outer membrane protein X  70.69 
 
 
171 aa  235  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00798  hypothetical protein  70.69 
 
 
171 aa  235  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2828  virulence-related outer membrane protein  70.69 
 
 
171 aa  235  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.166158  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0884  outer membrane protein X  70.69 
 
 
171 aa  235  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00860999  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0871  outer membrane protein X  70.69 
 
 
171 aa  235  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00356643  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0929  outer membrane protein X  70.11 
 
 
171 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2874  outer membrane protein X  66.09 
 
 
171 aa  224  5e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156851  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1301  outer membrane protein X  68.97 
 
 
172 aa  224  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0373252  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2389  outer membrane protein X  67.43 
 
 
171 aa  221  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.44963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1588  outer membrane protein X  65.52 
 
 
171 aa  219  1e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000727095  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2485  outer membrane protein X  63.79 
 
 
170 aa  197  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.114339  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0444  attachment invasion locus protein  40.66 
 
 
179 aa  127  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  1.96272e-12  hitchhiker  7.3955e-07 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1268  virulence-related outer membrane protein  40.66 
 
 
179 aa  126  1e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.13528e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1160  attachment invasion locus protein  40.66 
 
 
179 aa  126  2e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.92969e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2061  virulence-related outer membrane protein  42.59 
 
 
179 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.906515  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1951  Ail/Lom family protein  42.59 
 
 
179 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2152  attachment invasion locus protein precursor  42.59 
 
 
179 aa  119  2e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.224676  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2257  Ail/Lom family protein  32.98 
 
 
183 aa  101  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00208525  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2048  attachment invasion locus protein  32.46 
 
 
183 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0054596  hitchhiker  0.00421914 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2360  virulence-related outer membrane protein  32.46 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1153  attachment/invasion protein  34.62 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1204  Ail/Lom family protein  34.45 
 
 
199 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0613402 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4206  virulence-related outer membrane protein  37.91 
 
 
182 aa  94.7  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2110  virulence-related outer membrane protein  32.51 
 
 
199 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018608  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0914  Ail/Lom family protein  35.12 
 
 
199 aa  94  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1638  Ail/Lom family protein  33.01 
 
 
199 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0379  attachment invasion locus protein  37.89 
 
 
174 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00107279  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0399  attachment invasion locus protein  37.89 
 
 
174 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0017153  hitchhiker  6.19073e-05 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0377  attachment invasion locus protein  37.89 
 
 
174 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.857663  hitchhiker  0.00813108 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0386  attachment invasion locus protein  37.89 
 
 
174 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0188056  hitchhiker  0.00070272 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1475  Ail/Lom family protein  32.54 
 
 
199 aa  92.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0439  attachment invasion locus protein  37.27 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.17037e-07 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1349  virulence membrane protein PagC  36.51 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0661499 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1363  virulence membrane protein PagC  36.51 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.232924  normal  0.546382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1936  virulence membrane protein PagC  37.23 
 
 
185 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.336016  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2120  virulence membrane protein PagC  36.51 
 
 
185 aa  88.6  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119055 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3136  virulence-related outer membrane protein  35.5 
 
 
187 aa  88.6  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1639  Ail/Lom family protein  32.06 
 
 
199 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4489  virulence-related outer membrane protein  35.29 
 
 
182 aa  87.8  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1333  outer membrane invasion protein  37.23 
 
 
185 aa  88.2  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.670538 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2872  Ail/Lom family protein  32.54 
 
 
199 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.015622 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2761  Ail/Lom family protein  32.54 
 
 
199 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.308137  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1202  Ail/Lom family protein  31.53 
 
 
199 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5541  Ail/Lom family protein  32.54 
 
 
199 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2166  Ail/Lom family protein  32.54 
 
 
199 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.469806  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2231  Ail/Lom family protein  32.54 
 
 
199 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02188e-06 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0879  Ail/Lom family protein  33.82 
 
 
199 aa  85.5  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3187  Ail/Lom family protein  32.06 
 
 
199 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  4.77e-09 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1879  Ail/Lom family protein  32.06 
 
 
199 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0581032 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3119  Ail/Lom family protein  34.3 
 
 
199 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.116259 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1803  Ail/Lom family protein  32.85 
 
 
199 aa  80.5  1e-14  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.021538 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1418  attachment/invasion protein  32.7 
 
 
165 aa  79  3e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0141818 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4278  outer membrane invasion protein  33.52 
 
 
177 aa  77.8  7e-14  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0643904  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3500  outer membrane protein Lom  29.94 
 
 
244 aa  65.5  3e-10  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.755187  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10055  outer host membrane  28.29 
 
 
206 aa  60.8  1e-08  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782687  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00751  hypothetical protein  28.29 
 
 
206 aa  60.8  1e-08  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3201  outer membrane protein  31.06 
 
 
178 aa  50.8  9e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.823229  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3250  outer membrane protein  31.06 
 
 
178 aa  49.7  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0628701  normal  0.157037 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3187  outer membrane protein  31.06 
 
 
178 aa  50.1  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3366  outer membrane protein  30.43 
 
 
178 aa  47.8  9e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.617319  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3265  outer membrane protein  30.43 
 
 
178 aa  47.8  9e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.45758 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1095  putative Ail/Lom protein  41.18 
 
 
84 aa  42.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>