40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1377 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1489  virulence protein SciE type  99.25 
 
 		 268 aa  553  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747548  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1931  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  554  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.350891  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1377  ImpE family protein  100 
 
 		 268 aa  554  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3010  virulence protein SciE type  43.75 
 
 		 284 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6691  virulence protein SciE type  42.19 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1623  SciE protein  39 
 
 		 284 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0152  ImpE/SciE family protein  39 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0174  ImpE/SciE family protein  39 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0138  ImpE protein superfamily protein  40.15 
 
 		 284 aa  192  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0977  virulence protein, SciE type  36.4 
 
 		 284 aa  182  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1686  virulence protein SciE type  36.74 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.207214  normal  0.113631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3471  virulence protein, SciE type  37.66 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal  0.687 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1478  virulence protein, SciE type  37.35 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6117  virulence protein SciE type  35.61 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659534  normal  0.445465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0158  virulence protein, SciE type  37.07 
 
 		 261 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0944  virulence protein SciE type  36.03 
 
 		 290 aa  168  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01040  putative secretion protein  37.79 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2327  virulence protein, SciE type  35.63 
 
 		 261 aa  158  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0365801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0525  virulence protein SciE type  33.98 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3009  virulence protein SciE type  35.07 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3856  virulence protein SciE type  34.35 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0246  ImpE/SciE family protein  31.66 
 
 		 321 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1698  ImpE protein superfamily protein  31.66 
 
 		 321 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2453  virulence protein SciE type  33.58 
 
 		 275 aa  145  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0611141  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0337  ImpE/SciE family protein  30.89 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0293  SciE protein  30.27 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.816472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0295  SciE protein  30.27 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.227917 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0300  SciE protein  29.89 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0308  hypothetical protein  29.89 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.914397 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0917  hypothetical protein  29.73 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79149  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1906  hypothetical protein  29.73 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306251  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1204  hypothetical protein  29.73 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2179  ImpE/SciE family protein  29.73 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00263  ImpE protein  31.06 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0196  virulence protein SciE type  30.18 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000023  protein of avirulence locus ImpE  27.71 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.692484  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1532  hypothetical protein  26.16 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3074  virulence protein, SciE type  26.67 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2366  virulence protein, SciE type  24.81 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6048  hypothetical protein  23.62 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.853181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>