68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1370 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2874  type VI secretion lipoprotein  100 
 
 
179 aa  367  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1370  putative lipoprotein  100 
 
 
179 aa  367  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1482  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  367  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0552  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  34.62 
 
 
171 aa  90.1  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0983  hypothetical protein  31.85 
 
 
167 aa  87.4  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3910  hypothetical protein  34.75 
 
 
167 aa  85.5  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374434  normal  0.782471 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00960  putative lipoprotein  33.33 
 
 
154 aa  82.8  2e-15  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194597  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0151  putative lipoprotein  33.33 
 
 
154 aa  83.6  2e-15  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2090  putative outer membrane lipoprotein  32.17 
 
 
166 aa  80.9  8e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0124  putative lipoprotein  27.22 
 
 
180 aa  78.6  5e-14  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6111  hypothetical protein  29.2 
 
 
168 aa  78.2  5e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24398 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0160  SciN protein  28.57 
 
 
210 aa  78.2  6e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0137  SciN protein  27.89 
 
 
180 aa  77  1e-13  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1676  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  28.86 
 
 
172 aa  77  1e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.973088  hitchhiker  0.0062275 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0306  type VI secretion lipoprotein  27.67 
 
 
163 aa  77  1e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.157499  normal  0.0453584 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0318  type VI secretion lipoprotein, family  27.67 
 
 
163 aa  77  1e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0341521  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0312  type VI secretion lipoprotein, family  27.67 
 
 
163 aa  76.6  2e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.544183 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6676  putative lipoprotein  30.16 
 
 
179 aa  76.3  2e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.974139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0301  SciN protein  27.67 
 
 
163 aa  76.6  2e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.589759 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0937  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  28.47 
 
 
170 aa  73.6  1e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731961  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3477  hypothetical protein  30 
 
 
168 aa  72  4e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000013  type VI secretion lipoprotein/VasD  30.3 
 
 
151 aa  72  4e-12  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3025  putative lipoprotein  26.87 
 
 
180 aa  70.9  9e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1912  hypothetical protein  31.3 
 
 
167 aa  69.3  3e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2187  SciN protein  31.3 
 
 
167 aa  69.3  3e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1212  hypothetical protein  31.3 
 
 
167 aa  69.3  3e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0925  hypothetical protein  31.3 
 
 
167 aa  69.3  3e-11  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0101  hypothetical protein  27.27 
 
 
160 aa  67.4  9e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2319  hypothetical protein  26.92 
 
 
155 aa  67.4  1e-10  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00471412  hitchhiker  0.00131937 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1208  putative lipoprotein  28.28 
 
 
191 aa  64.7  7e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5580  putative lipoprotein  29.66 
 
 
166 aa  64.7  7e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0396  putative lipoprotein  28.46 
 
 
179 aa  64.7  7e-10  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2843  putative lipoprotein  28.28 
 
 
172 aa  64.7  7e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2968  putative lipoprotein  28.28 
 
 
172 aa  64.7  7e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1590  putative lipoprotein  28.28 
 
 
172 aa  64.7  7e-10  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1775  putative lipoprotein  28.28 
 
 
172 aa  64.7  7e-10  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0409935  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0445  putative lipoprotein  28.28 
 
 
172 aa  64.7  7e-10  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5421  lipoprotein, putative  27.35 
 
 
166 aa  63.5  1e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3606  putative lipoprotein  25.66 
 
 
168 aa  63.2  2e-09  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42940  putative lipoprotein  25.66 
 
 
168 aa  63.2  2e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.177757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0210  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  31.48 
 
 
156 aa  63.2  2e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0025  putative lipoprotein  31.58 
 
 
158 aa  63.5  2e-09  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.567085  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1595  hypothetical protein  26.14 
 
 
171 aa  61.6  6e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0251  putative lipoprotein  29.91 
 
 
172 aa  61.6  7e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26740  hypothetical protein  26.98 
 
 
192 aa  60.8  1e-08  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251057  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3843  putative lipoprotein  25 
 
 
199 aa  60.1  2e-08  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00099713  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1202  hypothetical protein  25.38 
 
 
163 aa  59.3  3e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2376  hypothetical protein  27.61 
 
 
156 aa  59.3  3e-08  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2551  hypothetical protein  25 
 
 
163 aa  58.5  5e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273704  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1525  hypothetical protein  34.65 
 
 
164 aa  56.6  2e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1692  putative lipoprotein  32.17 
 
 
167 aa  56.2  2e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.794584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0239  SciN protein  32.17 
 
 
167 aa  56.2  2e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0330  SciN protein  32.17 
 
 
167 aa  56.2  2e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4054  hypothetical protein  28 
 
 
197 aa  54.7  8e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.78046e-06 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1180  putative type VI secretion protein VasD-1  28.03 
 
 
154 aa  53.1  2e-06  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0234801  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000431  type VI secretion lipoprotein/VasD  28.57 
 
 
166 aa  52.8  2e-06  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3249  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  31.52 
 
 
173 aa  52.4  4e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05853  hypothetical protein  27.27 
 
 
149 aa  52  5e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2091  hypothetical protein  26.19 
 
 
156 aa  52  5e-06  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2523  hypothetical protein  28.43 
 
 
176 aa  50.8  1e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365008  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1076  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  32.61 
 
 
174 aa  50.8  1e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.556943  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1116  putative type VI secretion protein VasD  24.39 
 
 
162 aa  49.7  3e-05  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1470  putative lipoprotein  23.16 
 
 
187 aa  48.1  6e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.513143  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2801  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  29.35 
 
 
178 aa  48.1  6e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2450  hypothetical protein  25 
 
 
157 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00189886  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3659  hypothetical protein  24.32 
 
 
172 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177991  normal  0.259907 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0051  hypothetical protein  24 
 
 
190 aa  41.2  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1105  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  25.47 
 
 
177 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>