More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1335 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  100 
 
 		 174 aa  349  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  100 
 
 		 174 aa  349  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  100 
 
 		 174 aa  349  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01889  predicted cytochrome  45.93 
 
 		 176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000869737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1677  cytochrome B561  45.93 
 
 		 176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102602  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1211  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  45.93 
 
 		 176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0465638  normal  0.30426 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2205  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  45.4 
 
 		 176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.202008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01879  hypothetical protein  45.93 
 
 		 176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2075  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  45.93 
 
 		 176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.22561e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1671  cytochrome B561  45.93 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00739522  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2753  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  45.4 
 
 		 176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000856955  normal  0.186819 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  46.02 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0993  cytochrome B561  46.59 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  41.48 
 
 		 178 aa  142  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1928  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  43.23 
 
 		 176 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2111  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  43.23 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  hitchhiker  0.00078066 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1341  cytochrome B561  42.58 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1357  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  43.23 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0540712 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1372  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  46.67 
 
 		 176 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1956  cytochrome b561  40 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  39.88 
 
 		 183 aa  131  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1819  cytochrome b561  41.71 
 
 		 176 aa  131  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1517  cytochrome b561  41.71 
 
 		 176 aa  131  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.39069  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1759  cytochrome b561  41.71 
 
 		 176 aa  131  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.485438  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1700  cytochrome b561  41.71 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0149402  hitchhiker  0.00199396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1756  cytochrome b561  41.71 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  0.0664837 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  39.31 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  40 
 
 		 182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  40 
 
 		 182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3256  cytochrome b561  40.57 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3390  cytochrome b561  40 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  34.48 
 
 		 182 aa  121  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  36.16 
 
 		 186 aa  120  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0932  cytochrome B561  40.34 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0918  cytochrome b561  39.43 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.974416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3685  cytochrome B561  38.29 
 
 		 184 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  36 
 
 		 178 aa  111  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  35.09 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  35.09 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.09 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.09 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1373  cytochrome B561  34.46 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  35.09 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  34.5 
 
 		 225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  35.09 
 
 		 229 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  34.46 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3290  cytochrome B561  36.16 
 
 		 178 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1333  cytochrome B561  35.47 
 
 		 183 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.666388  normal  0.933151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3732  cytochrome B561  37.71 
 
 		 181 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2010  cytochrome B561  37.93 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00709418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3806  cytochrome B561  35.59 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131783  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1542  cytochrome B561  37.14 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.662748  normal  0.360468 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  36.09 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2176  cytochrome B561  35.43 
 
 		 178 aa  101  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0739024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3123  cytochrome B561  35.09 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3912  cytochrome B561  35.43 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3615  cytochrome B561  35.43 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4454  cytochrome B561  35.43 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106952  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1570  cytochrome B561  34.88 
 
 		 181 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1755  cytochrome b561  42.29 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000553481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  36.36 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  34.66 
 
 		 178 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0972  cytochrome B561  37.35 
 
 		 174 aa  94.4  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  37.79 
 
 		 191 aa  93.6  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  30.99 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  33.14 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3348  cytochrome B561  34.1 
 
 		 183 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.696433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  30.06 
 
 		 193 aa  90.9  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1642  cytochrome b561  41.38 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01374  cytochrome b561  41.38 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782687  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2228  cytochrome B561  41.38 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.013498  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1500  cytochrome b561  41.38 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1598  cytochrome b561  41.38 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2023  cytochrome b561  41.38 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000362205 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2241  cytochrome b561  41.38 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  33.52 
 
 		 180 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01386  hypothetical protein  41.38 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  27.43 
 
 		 182 aa  88.6  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  34.68 
 
 		 192 aa  88.6  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  27.01 
 
 		 182 aa  88.2  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  29.48 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0199  cytochrome B561 cytochrome transmembrane protein  31.4 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  31.58 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  31.58 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5657  cytochrome B561  33.91 
 
 		 190 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.998703 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  30.99 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  29.48 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  31.98 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  29.89 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  30.46 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  29.89 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  32.37 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  30.23 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  30.23 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  30.23 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  29.65 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  30.23 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  27.49 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1736  cytochrome B561  33.53 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0874237  normal  0.949544 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0580  cytochrome b561  43.53 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.971319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>