12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1323 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1323  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  220  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.61887e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1434  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  220  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00170755  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2742  hypothetical protein  98.26 
 
 
115 aa  218  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000210671  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3438  hypothetical protein  45.92 
 
 
158 aa  86.7  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  hitchhiker  0.000486984 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0804  hypothetical protein  30.89 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.915166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2695  hypothetical protein  43.48 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000211518  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2772  hypothetical protein  43.48 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000074375  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02307  conserved hypothetical protein  42.03 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000254731  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2542  hypothetical protein  42.03 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000390967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1271  hypothetical protein  42.03 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000174632  hitchhiker  0.00144194 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3639  hypothetical protein  42.03 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332585  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02268  hypothetical protein  42.03 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000251341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>