More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1212 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A2475  multidrug efflux system protein MdtE  70.32 
 
 
470 aa  638  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.829897  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1329  multidrug efflux system protein MdtE  100 
 
 
465 aa  918  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3100  multidrug efflux system protein MdtE  100 
 
 
465 aa  918  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  2.4134e-10  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2705  multidrug efflux system protein MdtE  67.96 
 
 
467 aa  635  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11232  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2366  multidrug efflux system protein MdtE  70.32 
 
 
470 aa  636  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2970  multidrug efflux system protein MdtE  72.73 
 
 
466 aa  659  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3555  multidrug efflux system protein MdtE  78.71 
 
 
477 aa  753  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1212  multidrug efflux system protein MdtE  100 
 
 
465 aa  918  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.5282e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1309  multidrug efflux system protein MdtE  73.43 
 
 
466 aa  671  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2687  multidrug efflux system protein MdtE  71.83 
 
 
471 aa  675  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.906977  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2259  multidrug efflux system protein MdtE  70.32 
 
 
470 aa  637  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.716187  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2315  multidrug efflux system protein MdtE  70.32 
 
 
470 aa  637  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2359  multidrug efflux system protein MdtE  70.11 
 
 
470 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0983  multidrug efflux system protein MdtE  71.83 
 
 
471 aa  631  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.500741  normal  0.355503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3017  multidrug efflux system protein MdtE  71.61 
 
 
471 aa  632  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.103244 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1564  multidrug efflux system protein MdtE  71.83 
 
 
471 aa  630  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.886181  normal  0.734188 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1156  multidrug efflux system protein MdtE  71.83 
 
 
471 aa  630  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2219  multidrug efflux system protein MdtE  71.83 
 
 
471 aa  630  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01982  multidrug efflux system protein  71.83 
 
 
471 aa  630  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1579  major facilitator superfamily MFS_1  71.83 
 
 
471 aa  630  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.383326  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01974  hypothetical protein  71.83 
 
 
471 aa  630  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2369  multidrug efflux system protein MdtE  71.4 
 
 
471 aa  626  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1203  multidrug efflux system protein MdtE  67.96 
 
 
467 aa  624  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.128409  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4865  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.45 
 
 
473 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0547  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.58 
 
 
489 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.387969 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.33 
 
 
489 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0492879  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2454  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.33 
 
 
478 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  6.27963e-05 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4675  major facilitator superfamily MFS_1  47.84 
 
 
476 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610966  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0779  major facilitator superfamily drug efflux pump  48.04 
 
 
482 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.497284  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0759  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.79 
 
 
478 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260682  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4826  EmrB/QacA subfamily transporter  48.37 
 
 
484 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325422  normal  0.202323 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2536  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.11 
 
 
478 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0171268  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.11 
 
 
478 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.11 
 
 
549 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419907  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5867  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.11 
 
 
494 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330086  normal  0.29148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3187  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.33 
 
 
485 aa  417  1e-115  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.0852056 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.23 
 
 
508 aa  417  1e-115  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2136  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  49.23 
 
 
479 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0941  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  49.23 
 
 
479 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13812  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0945  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  49.23 
 
 
479 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402156  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0556  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  49.23 
 
 
479 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1095  MFS transporter  49.23 
 
 
463 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269715  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2259  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.23 
 
 
479 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.41183  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4240  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.55 
 
 
490 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4128  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.55 
 
 
490 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422777  normal  0.15166 
 
 
-
 
NC_003296  RS05323  transporter transmembrane protein  50.67 
 
 
476 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5911  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.92 
 
 
480 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0730599  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3040  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.39 
 
 
469 aa  394  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.071182  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1763  putative MFS transporter  46.53 
 
 
474 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0653401 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0480  major facilitator transporter  47.87 
 
 
488 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1665  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.05 
 
 
478 aa  378  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.85594  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05990  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.31 
 
 
477 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.05141 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2090  major facilitator superfamily transporter  47.05 
 
 
478 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.126245  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0562  MFS family transporter  46.09 
 
 
477 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4048  major facilitator superfamily transporter  48.39 
 
 
482 aa  371  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.674396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.61 
 
 
475 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237506  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6615  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.12 
 
 
501 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5000  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.58 
 
 
475 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4824  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.8 
 
 
475 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0486949  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4951  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.8 
 
 
475 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4099  inner membrane transport protein YieO  42.3 
 
 
475 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0149395  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4114  inner membrane transport protein YieO  42.3 
 
 
475 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00252158  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4279  inner membrane transport protein YieO  42.3 
 
 
475 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124097  normal  0.840989 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  42.3 
 
 
475 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0009  major facilitator transporter  41.99 
 
 
474 aa  358  1e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000535821  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4220  inner membrane transport protein YieO  42.3 
 
 
475 aa  358  1e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4207  major facilitator transporter  41.99 
 
 
474 aa  358  1e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0173293  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0009  major facilitator transporter  41.99 
 
 
474 aa  357  2e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  2.16435e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0514  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.8 
 
 
475 aa  357  3e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507983  normal  0.797447 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0414  major facilitator transporter  42.73 
 
 
473 aa  355  1e-96  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.444257  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4110  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.23 
 
 
475 aa  354  2e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00236277  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4269  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  42.92 
 
 
467 aa  353  3e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.16309e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.92 
 
 
475 aa  353  4e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  5.13335e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03640  predicted multidrug or homocysteine efflux system  42.92 
 
 
475 aa  353  4e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  3.34579e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4121  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  42.92 
 
 
475 aa  353  4e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00185105  normal  0.108904 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03585  hypothetical protein  42.92 
 
 
475 aa  353  4e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  1.82084e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5189  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  42.92 
 
 
475 aa  353  5e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000921639  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3973  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  42.92 
 
 
475 aa  353  5e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.8828e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4895  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.33 
 
 
471 aa  353  5e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145217  hitchhiker  9.11862e-07 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4166  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  42.92 
 
 
475 aa  352  7e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.09718e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4769  major facilitator transporter  44.93 
 
 
470 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.7 
 
 
475 aa  350  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000183505  decreased coverage  0.00293146 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0407  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  44.18 
 
 
462 aa  345  7e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4177  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  45.18 
 
 
469 aa  345  8e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4302  major facilitator transporter  46.24 
 
 
466 aa  343  3e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3897  major facilitator transporter  44.03 
 
 
494 aa  343  3e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5832  major facilitator transporter  44.03 
 
 
462 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160208  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4471  major facilitator transporter  44.03 
 
 
462 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475899  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1409  major facilitator transporter  43.85 
 
 
462 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3908  major facilitator transporter  43.18 
 
 
462 aa  340  3e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.33 
 
 
462 aa  340  3e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.711123 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2021  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  42.38 
 
 
466 aa  332  7e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2247  major facilitator superfamily MFS_1  41.5 
 
 
466 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47683  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05800  Drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  46.98 
 
 
473 aa  329  5e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4370  major facilitator transporter  43.33 
 
 
462 aa  329  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.701723  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.59 
 
 
528 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1382  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.38 
 
 
458 aa  311  1e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.229793  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1145  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.17 
 
 
482 aa  310  3e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.15918e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1079  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  38.9 
 
 
458 aa  310  4e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0013428  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4805  major facilitator transporter  37.14 
 
 
468 aa  308  1e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>