More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1193 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02401  exodeoxyribonuclease VII large subunit  71.81 
 
 
456 aa  667  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.49221e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3734  exodeoxyribonuclease VII large subunit  71.81 
 
 
456 aa  651  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  3.26312e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  73.54 
 
 
449 aa  676  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  9.63372e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  72.03 
 
 
456 aa  669  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.48025e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  71.81 
 
 
456 aa  667  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  6.33307e-06  normal  0.0126087 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  70.9 
 
 
457 aa  673  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  2.10085e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1301  exodeoxyribonuclease VII large subunit  99.56 
 
 
459 aa  925  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  1.14365e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  71.37 
 
 
455 aa  666  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  4.23152e-09  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0410  exodeoxyribonuclease VII large subunit  99.78 
 
 
459 aa  927  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  1.34785e-10  hitchhiker  0.000369784 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  77.36 
 
 
462 aa  702  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02363  hypothetical protein  71.81 
 
 
456 aa  667  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  1.42965e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  73.86 
 
 
465 aa  676  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  4.22836e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3597  exodeoxyribonuclease VII large subunit  84.84 
 
 
458 aa  773  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  1.30865e-09  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  76.97 
 
 
461 aa  727  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  6.45996e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1159  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  71.81 
 
 
456 aa  667  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.02008e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  73.32 
 
 
449 aa  674  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  6.99903e-06  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1193  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
458 aa  929  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.10806e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  73.09 
 
 
449 aa  675  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  1.5005e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1267  exodeoxyribonuclease VII large subunit  76.7 
 
 
464 aa  699  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000176036  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  73.54 
 
 
449 aa  677  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  71.81 
 
 
456 aa  667  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  73.54 
 
 
449 aa  677  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  58.92 
 
 
443 aa  520  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  58.72 
 
 
443 aa  513  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  58.78 
 
 
446 aa  514  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  55.41 
 
 
444 aa  502  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1216  exodeoxyribonuclease VII large subunit  55.96 
 
 
448 aa  478  1e-134  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0401789  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1312  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.5 
 
 
445 aa  472  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1296  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.29 
 
 
442 aa  464  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0430502  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1558  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.61 
 
 
442 aa  461  1e-128  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0686099  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.66 
 
 
446 aa  455  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.6399e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2647  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.02 
 
 
466 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1234  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.45 
 
 
448 aa  455  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.181169  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.56 
 
 
448 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3125  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.94 
 
 
442 aa  452  1e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284972  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2985  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.34 
 
 
448 aa  452  1e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1304  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.45 
 
 
448 aa  454  1e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566056  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1233  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.91 
 
 
448 aa  454  1e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.89 
 
 
448 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1378  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.11 
 
 
448 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2951  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  51.58 
 
 
447 aa  446  1e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19698  normal  0.152138 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2360  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.79 
 
 
447 aa  444  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.203365  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.44 
 
 
445 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02974  exonuclease VII, large subunit  49.1 
 
 
450 aa  437  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143789  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1136  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.43 
 
 
450 aa  433  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.10023e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3121  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  48.87 
 
 
444 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698852  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4244  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.63 
 
 
444 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.77 
 
 
454 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  45.91 
 
 
446 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  2.7114e-06  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.96 
 
 
475 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  46.22 
 
 
467 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1034  Exodeoxyribonuclease VII  50.46 
 
 
447 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.15 
 
 
458 aa  379  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  46.41 
 
 
458 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.85 
 
 
451 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.22 
 
 
447 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.17 
 
 
414 aa  371  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  44.94 
 
 
414 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  45.08 
 
 
452 aa  365  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  7.16955e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1890  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.69 
 
 
446 aa  364  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.01941e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1848  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.27 
 
 
453 aa  360  3e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000692777  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3218  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.79 
 
 
457 aa  353  3e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.31 
 
 
456 aa  353  4e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0718  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.22 
 
 
448 aa  353  5e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00415  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45 
 
 
445 aa  352  6e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.16 
 
 
476 aa  352  6e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.94 
 
 
463 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.57 
 
 
458 aa  351  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.11 
 
 
453 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.07972e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.59 
 
 
458 aa  350  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000215567  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1915  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.6 
 
 
454 aa  350  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  1.69842e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.41 
 
 
448 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1027  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.72 
 
 
459 aa  345  9e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444658  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.72 
 
 
463 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1767  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.25 
 
 
447 aa  343  3e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00135793  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1025  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.79 
 
 
463 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0888  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.25 
 
 
443 aa  340  2e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.6 
 
 
459 aa  341  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.5 
 
 
451 aa  340  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.27 
 
 
452 aa  340  3e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.27 
 
 
452 aa  340  3e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.27 
 
 
452 aa  339  6e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.27 
 
 
452 aa  339  6e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.27 
 
 
452 aa  339  6e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.04 
 
 
452 aa  339  6e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.04 
 
 
452 aa  339  7e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.12 
 
 
463 aa  338  9e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.69 
 
 
460 aa  337  2e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782017  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.47 
 
 
459 aa  337  3e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0516461  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.04 
 
 
452 aa  336  4e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.15 
 
 
463 aa  337  4e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.04 
 
 
452 aa  336  4e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2462  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.69 
 
 
460 aa  336  4e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422545 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.64 
 
 
405 aa  335  7e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.32629e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1339  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.65 
 
 
462 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.47 
 
 
460 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144595  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0857  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.03 
 
 
443 aa  334  2e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0539  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.31 
 
 
459 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15230  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.42 
 
 
459 aa  332  8e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173867  hitchhiker  8.74033e-10 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2759  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.67 
 
 
443 aa  332  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.340088  normal  0.610939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>