86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0966 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  437  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  437  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  437  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  66.51 
 
 
216 aa  294  8e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  58.57 
 
 
231 aa  257  8e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  60.4 
 
 
242 aa  255  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  57.69 
 
 
231 aa  255  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  56.19 
 
 
245 aa  251  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  54.5 
 
 
218 aa  244  6.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  55.45 
 
 
218 aa  231  5e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  53.24 
 
 
256 aa  227  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  54.37 
 
 
214 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  53.14 
 
 
222 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  54.23 
 
 
233 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  50 
 
 
214 aa  209  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  53.17 
 
 
234 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  47.06 
 
 
230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  47.06 
 
 
230 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  47.06 
 
 
230 aa  194  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  47.06 
 
 
230 aa  193  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  47.09 
 
 
233 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  44.5 
 
 
217 aa  185  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  46.77 
 
 
221 aa  185  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  42.11 
 
 
217 aa  182  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  41.63 
 
 
217 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  32.34 
 
 
206 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  32.2 
 
 
206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  32.04 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  31.47 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  32.28 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  33.85 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  33.87 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  38.21 
 
 
218 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  31.77 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  31.77 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  31.77 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  31.77 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  31.77 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  31.77 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  31.77 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  30.37 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  30.27 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  28.64 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  27.08 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  31.12 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  28.21 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  31.29 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  27.23 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  30.15 
 
 
212 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  31.13 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  22.16 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  26.98 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  27.78 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  31.13 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8729  putative DsbA-like thioredoxin protein  30.48 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  27.32 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  28.88 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  27.87 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  28.68 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  26.53 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  26.53 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  27.03 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  26.34 
 
 
208 aa  61.6  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  22.45 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  26.63 
 
 
206 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  25.41 
 
 
200 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  26.6 
 
 
244 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  28.04 
 
 
221 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  27.88 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  26.26 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  27.42 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  25.76 
 
 
303 aa  56.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 
221 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  24.87 
 
 
210 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  23.12 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  25 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  27.92 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  27.43 
 
 
199 aa  52  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  25.65 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  29.1 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  20.71 
 
 
207 aa  48.9  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  25.12 
 
 
215 aa  48.5  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  21.03 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  22.65 
 
 
198 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>