26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0959 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1011  general secretion pathway protein K  99.06 
 
 		 318 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0959  general secretion pathway protein K  100 
 
 		 318 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3263  general secretion pathway protein K  90.57 
 
 		 318 aa  595  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000006292  hitchhiker  0.00000000000000735036 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  23.53 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  21.57 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  22.79 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001885  general secretion pathway protein K  20.73 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  21.59 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  21.65 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4244  general secretion pathway protein K  21.86 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.903399  normal  0.0684356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0388  general secretion pathway protein K  20.83 
 
 		 333 aa  50.1  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.6574 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  21.7 
 
 		 328 aa  49.3  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3526  general secretion pathway protein K  21.97 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0381  general secretion pathway protein K  21.97 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.61941 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0381  General secretion pathway protein K  21.97 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03183  general secretory pathway component, cryptic  21.97 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03134  hypothetical protein  21.97 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  22.22 
 
 		 358 aa  46.6  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02831  hypothetical type II secretion protein GspK  24.15 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000902301  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3240  general secretion pathway protein GspK  24.15 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.656676  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  27.61 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3420  general secretion pathway protein K  24.15 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3131  general secretion pathway protein K  22.89 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2917  general secretion pathway protein K  20.73 
 
 		 339 aa  43.5  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02781  hypothetical protein  24.15 
 
 		 325 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000553793  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  23.04 
 
 		 332 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>