152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0941 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0941  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  100 
 
 
388 aa  805    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3375  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  99.48 
 
 
388 aa  801    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0993  AgaS family sugar isomerase  100 
 
 
388 aa  805    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3577  sugar isomerase (SIS)  48.39 
 
 
380 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.311129  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3435  AgaS family sugar isomerase  47.99 
 
 
384 aa  363  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0318  sugar isomerase (SIS)  49.34 
 
 
387 aa  363  4e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500662  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03003  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  48.66 
 
 
384 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0569  sugar isomerase, AgaS family  48.66 
 
 
384 aa  361  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02954  hypothetical protein  48.66 
 
 
384 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3328  AgaS family sugar isomerase  48.66 
 
 
384 aa  361  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3618  AgaS family sugar isomerase  48.66 
 
 
384 aa  361  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0562  AgaS family sugar isomerase  48.66 
 
 
384 aa  361  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4453  putative sugar isomerase, AgaS family  48.66 
 
 
384 aa  360  3e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.24237  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2392  sugar isomerase, AgaS family  46.26 
 
 
384 aa  342  8e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2108  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  43.85 
 
 
388 aa  316  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2961  putative sugar isomerase  42.11 
 
 
390 aa  311  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2644  sugar isomerase domain-containing protein  42.11 
 
 
390 aa  311  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0115  phosphosugar isomerase  42.56 
 
 
388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  4.6706899999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2578  sugar isomerase AgaS  44.36 
 
 
388 aa  306  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.962598  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1639  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  40.9 
 
 
395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1904  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase, putative  40.37 
 
 
395 aa  302  9e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.767502  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2699  sugar isomerase (SIS)  42.23 
 
 
386 aa  300  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2600  sugar isomerase (SIS)  42.08 
 
 
386 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.792182  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0147  sugar isomerase (SIS)  41.03 
 
 
384 aa  293  2e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2533  sugar isomerase (SIS)  42.08 
 
 
386 aa  293  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1196  phosphosugar isomerase  42.02 
 
 
397 aa  293  4e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0075  sugar isomerase (SIS)  40 
 
 
377 aa  268  1e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1062  sugar isomerase (SIS)  40.55 
 
 
388 aa  266  5.999999999999999e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.316402  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2758  sugar isomerase (SIS)  38.22 
 
 
376 aa  261  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3815  sugar isomerase (SIS)  39.68 
 
 
384 aa  255  8e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.994709  normal  0.536429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1707  sugar isomerase (SIS)  37.23 
 
 
384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0665  sugar isomerase (SIS)  33.06 
 
 
400 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0139  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  25.2 
 
 
354 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0379  sugar isomerase (SIS)  27.37 
 
 
329 aa  65.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4761  sugar isomerase (SIS)  26.98 
 
 
317 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0832  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  24.4 
 
 
353 aa  64.3  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1553  sugar isomerase (SIS)  25.83 
 
 
309 aa  62.4  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5362  sugar isomerase (SIS)  26.34 
 
 
317 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.56285 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0115  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  26.75 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0693  sugar isomerase (SIS)  25 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0113  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  26.09 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1000  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.65 
 
 
602 aa  60.8  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.6 
 
 
614 aa  58.9  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2118  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase  26.53 
 
 
605 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.710102  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6271  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.73 
 
 
606 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00215354 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2231  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  22.1 
 
 
579 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01415  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.8 
 
 
615 aa  57.4  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.411178  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0312  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.69 
 
 
579 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.305646 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0313  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.35 
 
 
615 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0323  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.94 
 
 
586 aa  55.5  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0208  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.55 
 
 
605 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0089  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.82 
 
 
614 aa  54.3  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4464  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.93 
 
 
612 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.582003  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4559  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.25 
 
 
613 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313422  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2658  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.93 
 
 
612 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.144051 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0664  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  24.36 
 
 
580 aa  53.9  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1693  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.2 
 
 
600 aa  53.5  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.457589  normal  0.0574833 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.41 
 
 
611 aa  53.5  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.214537 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0641  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.75 
 
 
636 aa  53.1  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325267  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0620  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.75 
 
 
636 aa  53.1  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1372  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.77 
 
 
613 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.742215  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1778  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.47 
 
 
602 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.285931  normal  0.0291099 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3002  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.97 
 
 
605 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978616  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0138  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.13 
 
 
612 aa  51.2  0.00003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.266568  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2890  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.94 
 
 
605 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000354922 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3379  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.55 
 
 
610 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0517  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.55 
 
 
610 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.698391  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0288  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.55 
 
 
610 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0675  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.56 
 
 
616 aa  50.8  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3050  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.55 
 
 
610 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2042  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.55 
 
 
610 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0323  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.55 
 
 
610 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0336  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.55 
 
 
610 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2242  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.55 
 
 
610 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252302  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0428  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.07 
 
 
603 aa  50.1  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0080  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.48 
 
 
614 aa  50.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0166256  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2368  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.7 
 
 
605 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3029  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.43 
 
 
605 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40621  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2982  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.7 
 
 
605 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.43 
 
 
605 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1074  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.91 
 
 
627 aa  50.1  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0149883  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3728  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.7 
 
 
605 aa  50.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.71832  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4166  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.61 
 
 
608 aa  49.7  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6350  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.87 
 
 
611 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2977  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.19 
 
 
605 aa  49.7  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392279  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1001  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.47 
 
 
626 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73170  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.87 
 
 
611 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.542365  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0462  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.49 
 
 
611 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.661359  normal  0.367239 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2503  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.19 
 
 
605 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208753  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4602  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.08 
 
 
616 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0471  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.56 
 
 
601 aa  48.5  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5508  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.45 
 
 
608 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3499  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.82 
 
 
612 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0102  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.62 
 
 
615 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2676  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.31 
 
 
622 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3375  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  22.98 
 
 
608 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1487  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.59 
 
 
609 aa  47  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3186  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.4 
 
 
602 aa  47  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1501  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.43 
 
 
605 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6331  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.99 
 
 
605 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>