More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0759 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  100 
 
 		 291 aa  602  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  69.07 
 
 		 291 aa  431  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  60.14 
 
 		 290 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  59.79 
 
 		 290 aa  362  3e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  59.45 
 
 		 290 aa  360  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  59.79 
 
 		 290 aa  358  7e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  59.11 
 
 		 290 aa  355  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0467468 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  59.45 
 
 		 290 aa  355  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  52.23 
 
 		 287 aa  311  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  52.23 
 
 		 287 aa  310  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  54.95 
 
 		 288 aa  308  5e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  49.14 
 
 		 291 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  49.48 
 
 		 291 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  43.2 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  40.28 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  40.28 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  39.58 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  39.58 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1658  GTPase-like protein  56.99 
 
 		 236 aa  212  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.374478  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  25 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0825  tRNA modification GTPase TrmE  31.65 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  26.92 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0979  tRNA modification GTPase TrmE  31.88 
 
 		 442 aa  62.4  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.523955  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1036  tRNA modification GTPase TrmE  31.88 
 
 		 442 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.788526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  29.07 
 
 		 650 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  26.89 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  26.11 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2152  GTP-binding protein, HSR1-related  24.48 
 
 		 523 aa  60.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  27.5 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  28.93 
 
 		 529 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  27.67 
 
 		 531 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  27.67 
 
 		 531 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  27.92 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  26.34 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1403  hypothetical protein  23.74 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2082  GTP-binding protein Era  25.63 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592415  normal  0.853182 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4767  GTP-binding protein HSR1-related  27.17 
 
 		 629 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.049365  hitchhiker  0.000697216 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14801  GTP-binding protein Era  23.96 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3778  small GTP-binding protein  23.85 
 
 		 433 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  25.12 
 
 		 434 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.58 
 
 		 440 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  28.87 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1284  tRNA modification GTPase TrmE  28.72 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14661  GTP-binding protein Era  24.46 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  22.13 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  22.13 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  22.13 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  22.13 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  22.13 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  22.13 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  22.13 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2246  small GTP-binding protein  24.46 
 
 		 496 aa  55.8  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  22.92 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  22.83 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  26.38 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  22.83 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  27.35 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  28.44 
 
 		 564 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  20.66 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1377  GTP-binding protein Era  25.13 
 
 		 303 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0974001  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  27.05 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3566  ribosome-associated GTPase EngA  22.92 
 
 		 454 aa  53.9  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.173152  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13500  GTP-binding protein Era  25.42 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  27.44 
 
 		 449 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0548  tRNA modification GTPase TrmE  29.51 
 
 		 442 aa  53.1  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  28.48 
 
 		 524 aa  53.1  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  25.41 
 
 		 302 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  29.94 
 
 		 453 aa  52.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6542  small GTP-binding protein  26.63 
 
 		 441 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  28.32 
 
 		 802 aa  52.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  28.3 
 
 		 506 aa  52.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  24.32 
 
 		 302 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  31.01 
 
 		 529 aa  52.4  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  25.46 
 
 		 435 aa  52.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  22.83 
 
 		 299 aa  52.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  22.83 
 
 		 299 aa  52.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1329  GTP-binding protein EngA  30.33 
 
 		 443 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  23.62 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  23.85 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  29.49 
 
 		 585 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  23.91 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  25.41 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  24.88 
 
 		 436 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  28.93 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0356  GTP-binding protein Era  30 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1390  GTP-binding protein EngA  30.33 
 
 		 443 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf303  GTP-binding protein EngA  25.95 
 
 		 434 aa  52.4  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.778638  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  24.79 
 
 		 436 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2013  GTP-binding protein EngA  25 
 
 		 437 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  24.51 
 
 		 438 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  25.4 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0656  GTP-binding protein HSR1-related protein  29.93 
 
 		 512 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.53051  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  21.2 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  27.37 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  26.78 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1651  GTP-binding protein EngA  25.58 
 
 		 443 aa  51.2  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  33.62 
 
 		 457 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  27.27 
 
 		 614 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1825  GTP-binding protein Era  30.63 
 
 		 309 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  23.74 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>