More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0710 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  99.86 
 
 		 726 aa  1489    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  66.99 
 
 		 733 aa  1012    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  68.22 
 
 		 732 aa  1042    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  46.29 
 
 		 745 aa  681    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  46.43 
 
 		 745 aa  684    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  99.86 
 
 		 726 aa  1488    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  46.57 
 
 		 745 aa  688    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  65.98 
 
 		 732 aa  1002    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  81.61 
 
 		 746 aa  1245    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 726 aa  1491    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  46.7 
 
 		 764 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  46.84 
 
 		 742 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  43.08 
 
 		 723 aa  572  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  43.85 
 
 		 723 aa  569  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  40.88 
 
 		 817 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  40.88 
 
 		 808 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  40.45 
 
 		 808 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  38.14 
 
 		 698 aa  457  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 751 aa  325  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 758 aa  321  3e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  31.89 
 
 		 755 aa  305  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  29.67 
 
 		 813 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  29.59 
 
 		 816 aa  295  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 849 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 		 843 aa  270  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  29.58 
 
 		 812 aa  266  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 839 aa  250  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 738 aa  244  5e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  27.32 
 
 		 709 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 704 aa  208  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  27.53 
 
 		 714 aa  208  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 697 aa  203  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  27.59 
 
 		 713 aa  200  7.999999999999999e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 721 aa  198  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 701 aa  195  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 701 aa  192  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 718 aa  190  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 725 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 725 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 725 aa  180  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 725 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 710 aa  178  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  26.68 
 
 		 717 aa  177  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 723 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 700 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 723 aa  172  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 723 aa  171  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 723 aa  171  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 716 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 783 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  24.05 
 
 		 771 aa  164  8.000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 716 aa  162  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 809 aa  156  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  25.54 
 
 		 721 aa  154  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  24.59 
 
 		 704 aa  152  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 739 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  26.4 
 
 		 724 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 728 aa  145  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 817 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  24.05 
 
 		 713 aa  134  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 753 aa  112  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  28.47 
 
 		 332 aa  98.6  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  23.19 
 
 		 698 aa  89.7  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 698 aa  86.3  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  23.15 
 
 		 690 aa  83.2  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  29.46 
 
 		 646 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 670 aa  79  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1601  TonB-dependent heme receptor  24.91 
 
 		 702 aa  76.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.24 
 
 		 661 aa  75.1  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  22.14 
 
 		 676 aa  75.1  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  21.88 
 
 		 693 aa  74.7  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1786  TonB-dependent heme receptor  24.29 
 
 		 718 aa  73.2  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 706 aa  73.2  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 682 aa  73.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  23.33 
 
 		 712 aa  72.4  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  28.63 
 
 		 660 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  28.63 
 
 		 660 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4088  TonB-dependent receptor  34.22 
 
 		 650 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  24 
 
 		 676 aa  70.9  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  28.88 
 
 		 628 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 627 aa  70.1  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  36.3 
 
 		 634 aa  70.5  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  26.42 
 
 		 676 aa  70.5  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.42 
 
 		 676 aa  70.5  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0094  TonB-dependent receptor  33.69 
 
 		 649 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 615 aa  69.7  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  23.66 
 
 		 646 aa  69.7  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  34.97 
 
 		 618 aa  68.2  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 736 aa  68.2  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 593 aa  68.2  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  31.47 
 
 		 656 aa  67.8  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 626 aa  67.8  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  23.22 
 
 		 664 aa  67.8  0.0000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 626 aa  67.4  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  31.47 
 
 		 677 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 762 aa  67  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.11 
 
 		 614 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 700 aa  65.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.6 
 
 		 867 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  21.94 
 
 		 700 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>