167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0656 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0656  flagellar protein FliS  100 
 
 
127 aa  262  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0206  flagellar protein FliS  96.06 
 
 
126 aa  246  9e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3356  flagellar protein FliS  59.13 
 
 
130 aa  140  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.385304  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0278  lateral flagellar chaperone protein LafC  58.26 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00844444  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0187  flagellar protein FliS  54.31 
 
 
132 aa  138  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.158957  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4661  flagellar protein FliS  48.72 
 
 
129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.227103 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001171  flagellar biosynthesis protein FliS  48.21 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.329244  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04955  flagellin-specific chaperone FliS  46.43 
 
 
128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0055  flagellar protein FliS  41.38 
 
 
126 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0061  flagellar protein FliS  40.87 
 
 
126 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3453  flagellar protein FliS  44.83 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0177  flagellar protein FliS  41.88 
 
 
128 aa  97.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.711098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0229  flagellar protein FliS  41.38 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3954  flagellar protein FliS  44.83 
 
 
126 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0846761  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  37.4 
 
 
135 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  37.4 
 
 
135 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  37.4 
 
 
135 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2524  flagellar protein FliS  39.84 
 
 
136 aa  90.5  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  37.4 
 
 
135 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  37.4 
 
 
135 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  37.7 
 
 
135 aa  84  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  36.59 
 
 
136 aa  82  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  39.47 
 
 
144 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1340  flagellar protein FliS  36.22 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  38.52 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3637  flagellar protein FliS  40.68 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5092  flagellar protein FliS  35.25 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  33.04 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  36.59 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  36.59 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  30.97 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2973  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126092  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  35.77 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3107  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2929  flagellar protein FliS  33.61 
 
 
144 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
144 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  36.28 
 
 
141 aa  76.6  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  36.13 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  31.93 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3059  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895384  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  34.15 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1530  flagellar protein FliS  36.07 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  34.19 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  30.43 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3283  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0781  flagellar protein FliS  33.63 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0419  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0555717  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2948  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2140  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0224  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204088  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0236  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3398  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1012  flagellar protein FliS  31.75 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6411  flagellar protein FliS  31.93 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.168553 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2831  flagellar protein FliS  34.15 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161705  normal  0.0204753 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  31.3 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  30.43 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  29.57 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  33.04 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0625  flagellar protein FliS  31.2 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3671  flagellar protein FliS  33.05 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4748  flagellar protein FliS  33.05 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.304458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  36.29 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  34.95 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3081  flagellar protein FliS  31.09 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2448  flagellar protein FliS  31.09 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3062  flagellar protein FliS  31.09 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0650828  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  30.09 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  38.54 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50250  flagellar protein FliS  35.04 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194402  decreased coverage  0.0000900366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1110  flagellar protein FliS  34.13 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.218751 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  36.52 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  32.46 
 
 
135 aa  70.9  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0202  flagellar protein FliS  31.93 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  29.2 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  28.32 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0503  flagellar protein FliS  33.04 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  29.57 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  29.2 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  28.7 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  29.57 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  30.43 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3082  flagellar protein FliS  31.25 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.699542  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0384  flagellar protein FliS  30.43 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1290  hypothetical protein  28.7 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3585  flagellar protein FliS  28.8 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1291  hypothetical protein  26.89 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2197  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.97 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4398  flagellar protein FliS  28.46 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0620  flagellar protein FliS  30.77 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1496  flagellar protein FliS  33.91 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0407266  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  37.04 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  27.83 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1714  flagellar protein FliS  31.71 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.16255 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2025  flagellar protein FliS  31.71 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2160  flagellar protein FliS  31.71 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1055  flagellar protein FliS  31.71 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  27.83 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1492  flagellar protein FliS  34.43 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>