282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0615 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  100 
 
 
239 aa  489  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  97.91 
 
 
239 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  97.91 
 
 
239 aa  479  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4674  pili assembly chaperone  61.93 
 
 
250 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4145  pili assembly chaperone  55 
 
 
251 aa  264  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193579  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4722  pili assembly chaperone  58.26 
 
 
252 aa  260  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.570892  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0404  pili assembly chaperone  56.68 
 
 
255 aa  249  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2495  fimbrial chaperone protein  46.49 
 
 
250 aa  230  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0727302  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1316  pili assembly chaperone  45.85 
 
 
250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2488  periplasmic pilus chaperone family protein  45.85 
 
 
250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2716  fimbrial chaperone protein  45.85 
 
 
250 aa  223  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.435606  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0234  chaperone protein PapD  46.58 
 
 
250 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0011245  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0216  chaperone protein PapD  46.58 
 
 
250 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000206765  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0233  chaperone protein PapD  46.12 
 
 
250 aa  218  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0218  chaperone protein PapD  46.12 
 
 
250 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000225767  normal  0.548646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02261  predicted periplasmic pilus chaperone  44.81 
 
 
250 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  47.32 
 
 
255 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4164  pili assembly chaperone protein  46.88 
 
 
242 aa  215  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00562333 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1320  Pili assembly chaperone, N-terminal  45.24 
 
 
250 aa  215  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  46.88 
 
 
249 aa  215  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3479  chaperone protein PapD  42.61 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0824  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.54 
 
 
249 aa  211  5.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2631  periplasmic pilus chaperone family protein  45.71 
 
 
241 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3090  chaperone protein PapD  43.93 
 
 
257 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3271  chaperone protein PapD  43.93 
 
 
257 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.685151  normal  0.0204539 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3154  chaperone protein PapD  43.93 
 
 
257 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.190535 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3173  chaperone protein PapD  43.93 
 
 
257 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.315924 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02221  hypothetical protein  45.41 
 
 
230 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1058  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.11 
 
 
249 aa  200  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  40.77 
 
 
248 aa  198  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1610  pili assembly chaperone  40.72 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1548  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.34 
 
 
248 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264488  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4773  pili assembly chaperone  39.91 
 
 
263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.352818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1148  pili assembly chaperone  38.49 
 
 
248 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261386  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1603  pili assembly chaperone  39.45 
 
 
248 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640544  normal  0.23965 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1628  pili assembly chaperone  38.49 
 
 
263 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254202  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2919  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.66 
 
 
242 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.264872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2062  hypothetical protein  41.74 
 
 
246 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1653  P pilus assembly protein, chaperone PapD  41.74 
 
 
249 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0315  fimbrial chaperone  41.74 
 
 
249 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.120821  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1898  fimbrial chaperone yfcS precursor  41.74 
 
 
249 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1911  fimbrial chaperone yfcS precursor  41.74 
 
 
249 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.595232  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0845  MrpD  41.74 
 
 
249 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.788087  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00677  predicted assembly protein  40 
 
 
243 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2938  pili assembly chaperone  40.27 
 
 
243 aa  169  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0807  periplasmic pilus chaperone family protein  41.92 
 
 
243 aa  169  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0634  periplasmic pilus chaperone family protein  39.82 
 
 
243 aa  169  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0743  periplasmic pilus chaperone family protein  39.82 
 
 
243 aa  169  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0765  periplasmic pilus chaperone family protein  39.82 
 
 
243 aa  168  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00666  hypothetical protein  40.47 
 
 
220 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3183  chaperone protein PapD  38.3 
 
 
247 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3246  pili assembly chaperone protein  38.3 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0150608 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3197  pili assembly chaperone protein  38.3 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3260  pili assembly chaperone protein  37.29 
 
 
247 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3362  pili assembly chaperone protein  37.29 
 
 
247 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0478294  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3510  periplasmic pilus chaperone family protein  35.8 
 
 
249 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0652  pili assembly chaperone  34.57 
 
 
249 aa  149  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3223  periplasmic pilus chaperone family protein  34.57 
 
 
249 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000604612  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02867  hypothetical protein  36.6 
 
 
249 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.386418  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02917  predicted periplasmic pilin chaperone  36.6 
 
 
249 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0653  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.6 
 
 
249 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  35.11 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  37.18 
 
 
245 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  37.87 
 
 
227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  35.37 
 
 
225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  35.66 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04795  chaperone PapD  34.08 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.92 
 
 
243 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  36.79 
 
 
248 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  32.71 
 
 
234 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.76 
 
 
243 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.71 
 
 
248 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0989  pili assembly chaperone  35.91 
 
 
230 aa  122  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  31.55 
 
 
233 aa  121  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  31.56 
 
 
246 aa  121  9e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  31.56 
 
 
246 aa  121  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  31.69 
 
 
246 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  35.55 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  31.69 
 
 
246 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  33.74 
 
 
241 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  37.14 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  33.9 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1500  pili assembly chaperone  40.18 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69936  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  35.04 
 
 
241 aa  119  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  36.57 
 
 
236 aa  119  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.43 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.43 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  33.06 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.65 
 
 
231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  33.19 
 
 
232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.69 
 
 
246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  33.19 
 
 
232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  33.19 
 
 
232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  33.19 
 
 
232 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.48 
 
 
244 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  33.17 
 
 
224 aa  118  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  33.17 
 
 
231 aa  118  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  33.17 
 
 
231 aa  118  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  33.17 
 
 
231 aa  118  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  33.17 
 
 
231 aa  118  9e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>