90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0608 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  34.31 
 
 		 2933 aa  825    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  35.28 
 
 		 4953 aa  893    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  100 
 
 		 2795 aa  5329    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  34.93 
 
 		 5337 aa  912    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  39.97 
 
 		 4672 aa  679    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  88.33 
 
 		 1976 aa  3152    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  28.82 
 
 		 2620 aa  561  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  29.73 
 
 		 2367 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  29.73 
 
 		 2383 aa  542  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  29.65 
 
 		 2358 aa  540  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  27.78 
 
 		 2933 aa  532  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  29.33 
 
 		 2358 aa  531  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  33.69 
 
 		 1417 aa  530  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  33.66 
 
 		 1417 aa  525  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  34.1 
 
 		 1396 aa  523  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  34.2 
 
 		 1417 aa  520  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  29.63 
 
 		 2296 aa  516  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  34.62 
 
 		 1418 aa  509  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  42.13 
 
 		 941 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  39.64 
 
 		 969 aa  487  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  29.82 
 
 		 1746 aa  480  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  36.52 
 
 		 1084 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  34.3 
 
 		 1050 aa  440  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  34.3 
 
 		 1075 aa  440  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  34.38 
 
 		 1075 aa  440  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  36.54 
 
 		 934 aa  383  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2774  hypothetical protein  37.53 
 
 		 730 aa  292  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2885  hypothetical protein  37.53 
 
 		 730 aa  292  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  38.74 
 
 		 730 aa  292  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2668  Aec1  37.53 
 
 		 730 aa  292  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2711  hypothetical protein  37.53 
 
 		 730 aa  279  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2661  putative adhesin  44.41 
 
 		 724 aa  275  6e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.440388 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00256  attaching and effacing protein, pathogenesis factor  48.66 
 
 		 410 aa  272  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  36.82 
 
 		 690 aa  252  9e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3306  hypothetical protein  49.57 
 
 		 295 aa  242  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0152605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00260  hypothetical protein  49.57 
 
 		 292 aa  241  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2901  hypothetical protein  34.34 
 
 		 497 aa  218  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1905  hypothetical protein  33.16 
 
 		 474 aa  209  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1899  hypothetical protein  33.16 
 
 		 509 aa  208  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.381916 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2403  hypothetical protein  33.51 
 
 		 476 aa  208  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1370  hypothetical protein  33.51 
 
 		 464 aa  208  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305056  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1920  hypothetical protein  33.51 
 
 		 464 aa  207  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1703  hypothetical protein  33.51 
 
 		 476 aa  207  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1329  hypothetical protein  33.51 
 
 		 464 aa  207  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953339  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2426  putative invasin  33.51 
 
 		 464 aa  207  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439788  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1372  hypothetical protein  33.16 
 
 		 474 aa  207  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.567919  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1963  hypothetical protein  33.16 
 
 		 474 aa  207  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321067 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01208  hypothetical protein  33.51 
 
 		 417 aa  206  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01198  predicted invasin  33.51 
 
 		 417 aa  206  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2319  hypothetical protein  33.24 
 
 		 468 aa  205  9e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1387  hypothetical protein  33.25 
 
 		 464 aa  203  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1555  hypothetical protein  32.91 
 
 		 474 aa  202  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.125708 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  32.56 
 
 		 3209 aa  191  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1794  hypothetical protein  30.85 
 
 		 660 aa  164  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.804919  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1854  hypothetical protein  30.65 
 
 		 660 aa  164  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1482  hypothetical protein  30.59 
 
 		 660 aa  164  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.498309  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1663  hypothetical protein  30.67 
 
 		 660 aa  163  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0949779 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1792  hypothetical protein  30.18 
 
 		 660 aa  160  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66641  normal  0.146371 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a028  putative adhesin/invasin  30.58 
 
 		 1459 aa  129  9e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2659  RatA-like protein  37.9 
 
 		 2691 aa  124  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319254  normal  0.262746 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2751  RatB  35.43 
 
 		 1861 aa  110  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00947302 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2708  hypothetical protein  39.18 
 
 		 1859 aa  104  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2665  RatB  32.95 
 
 		 1861 aa  102  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2771  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1859 aa  101  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  27.88 
 
 		 7434 aa  89  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02885  hypothetical protein  29.49 
 
 		 543 aa  77.8  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2881  hypothetical protein  31.72 
 
 		 563 aa  76.3  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  25.18 
 
 		 1279 aa  75.1  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07115  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1164 aa  75.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  26.93 
 
 		 2625 aa  69.3  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  24.32 
 
 		 1361 aa  67  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  23.73 
 
 		 3439 aa  61.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  28.1 
 
 		 1224 aa  59.7  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  28.1 
 
 		 1224 aa  59.7  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  27.19 
 
 		 1209 aa  59.3  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  26.91 
 
 		 1209 aa  58.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  26.4 
 
 		 1237 aa  57  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1001  Ig domain-containing protein  29.91 
 
 		 614 aa  55.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  28.38 
 
 		 821 aa  55.5  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  28.81 
 
 		 1224 aa  53.5  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.31 
 
 		 5613 aa  53.1  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  26.44 
 
 		 4480 aa  52.8  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  26.2 
 
 		 807 aa  50.1  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0559  hypothetical protein  31.93 
 
 		 302 aa  50.1  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0270722  normal  0.124487 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0328  Ig domain-containing protein  26.09 
 
 		 830 aa  50.1  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.979457  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  27.94 
 
 		 8918 aa  47.8  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  28.12 
 
 		 837 aa  47  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0553  von Willebrand factor, type A  25.39 
 
 		 1002 aa  46.6  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253544  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  26.2 
 
 		 851 aa  46.2  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  31.06 
 
 		 638 aa  46.2  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>