42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0540 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_0601  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  302  1e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0427524  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0540  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  302  1e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1056  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  302  1e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0967482  normal  0.03281 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0882  hypothetical protein  37.78 
 
 
146 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.479556  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0702  hypothetical protein  36.3 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1657  hypothetical protein  36.3 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2010  hypothetical protein  36.3 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132855  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2105  hypothetical protein  36.3 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0592  hypothetical protein  36.3 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0756  hypothetical protein  36.3 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299244  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0519  hypothetical protein  36.3 
 
 
146 aa  93.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  31.47 
 
 
144 aa  77.8  5e-14  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  26.71 
 
 
147 aa  74.3  4e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  30.77 
 
 
144 aa  74.3  5e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  27.78 
 
 
145 aa  73.9  7e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  26.47 
 
 
140 aa  68.2  3e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  27.01 
 
 
143 aa  63.9  7e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  28.85 
 
 
166 aa  53.9  8e-07  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1029  hypothetical protein  32.52 
 
 
145 aa  52.4  2e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.0601496 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  29.81 
 
 
168 aa  52.8  2e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  26.92 
 
 
144 aa  51.2  5e-06  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  29.03 
 
 
136 aa  51.2  5e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  26.57 
 
 
138 aa  50.4  8e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  25.87 
 
 
138 aa  50.1  9e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  3.6824e-06  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  25.36 
 
 
158 aa  50.1  9e-06  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  25.35 
 
 
138 aa  50.1  1e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  24.82 
 
 
162 aa  48.9  2e-05  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  26.83 
 
 
138 aa  48.5  3e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  25.35 
 
 
138 aa  48.5  3e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  26.83 
 
 
138 aa  48.5  3e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  26.83 
 
 
138 aa  48.5  3e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  26.83 
 
 
138 aa  48.5  3e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2858  hypothetical protein  26.12 
 
 
142 aa  48.9  3e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  28.57 
 
 
138 aa  47.4  7e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  28.57 
 
 
138 aa  47.4  7e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  25.17 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  23.91 
 
 
161 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  24.82 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  27.64 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  26.32 
 
 
181 aa  42.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1923  hypothetical protein  29.41 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  28.87 
 
 
157 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>