42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0524 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1072  hypothetical protein  99.35 
 
 		 459 aa  936    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0524  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  941    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00628478  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0585  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  941    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0392402  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  27 
 
 		 2716 aa  94  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  27.67 
 
 		 2747 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  23.77 
 
 		 2769 aa  73.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  27.71 
 
 		 2748 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  26.57 
 
 		 2748 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  26.81 
 
 		 2758 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  24.39 
 
 		 536 aa  63.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  23.12 
 
 		 2786 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  27.75 
 
 		 2880 aa  61.6  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  23.5 
 
 		 2731 aa  61.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  25.43 
 
 		 2887 aa  60.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  25.68 
 
 		 2761 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  28.5 
 
 		 2929 aa  59.7  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  27.27 
 
 		 2845 aa  56.6  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  25.96 
 
 		 2730 aa  56.6  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  24.43 
 
 		 2839 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30460  hypothetical protein  22.64 
 
 		 754 aa  53.5  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0534112  normal  0.427386 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  24.24 
 
 		 2922 aa  51.2  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  25.98 
 
 		 2881 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  24.1 
 
 		 2839 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  27.13 
 
 		 2932 aa  50.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  22.96 
 
 		 2870 aa  50.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  25.57 
 
 		 2864 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  25.81 
 
 		 2864 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  34.62 
 
 		 2901 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  20.58 
 
 		 2868 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  23.64 
 
 		 2842 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  23.68 
 
 		 2860 aa  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  23.35 
 
 		 2453 aa  47  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  28.82 
 
 		 2833 aa  47  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  26.42 
 
 		 2888 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26.42 
 
 		 2732 aa  45.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  27.31 
 
 		 2859 aa  45.8  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  25.23 
 
 		 2916 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0510  hypothetical protein  22.84 
 
 		 536 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  19.42 
 
 		 2823 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26.42 
 
 		 2864 aa  44.3  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  23.47 
 
 		 2779 aa  43.5  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3150  hypothetical protein  24.62 
 
 		 541 aa  43.1  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>