More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0333 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  98.76 
 
 		 1402 aa  2643    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  38.23 
 
 		 1386 aa  802    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  38.36 
 
 		 1385 aa  819    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1418 aa  2936    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  40.14 
 
 		 1419 aa  849    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  38.35 
 
 		 1400 aa  810    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  36.39 
 
 		 1229 aa  722    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  38.88 
 
 		 1409 aa  819    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  99.15 
 
 		 1390 aa  2645    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  37.82 
 
 		 1411 aa  794    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  38.82 
 
 		 1359 aa  795    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  40.47 
 
 		 1410 aa  855    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  38.66 
 
 		 1379 aa  856    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  34.88 
 
 		 1140 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  32.72 
 
 		 1446 aa  590  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  32.21 
 
 		 1421 aa  551  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  41.22 
 
 		 867 aa  529  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  32.15 
 
 		 1568 aa  522  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  31.77 
 
 		 1531 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  40.34 
 
 		 866 aa  502  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  33.24 
 
 		 1362 aa  499  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3017  YD repeat-containing protein  32.19 
 
 		 1149 aa  492  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6684  YD repeat-containing protein  31.3 
 
 		 1149 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0131  Rhs1 protein  30.68 
 
 		 1150 aa  476  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.462528  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0168  Rhs1 protein  30.66 
 
 		 1150 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0145  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  30.57 
 
 		 1150 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1615  Rhs1 protein  30.47 
 
 		 1150 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  32.17 
 
 		 1348 aa  466  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  29.67 
 
 		 1530 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  30.46 
 
 		 1604 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  34.33 
 
 		 855 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  30.44 
 
 		 1583 aa  442  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  35.13 
 
 		 924 aa  422  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  30.08 
 
 		 1527 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  30.35 
 
 		 1586 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  30.46 
 
 		 1547 aa  413  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  30.2 
 
 		 1560 aa  406  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  29.65 
 
 		 1550 aa  406  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  30.14 
 
 		 1520 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  30.2 
 
 		 1551 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  28.17 
 
 		 1654 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  27.49 
 
 		 1620 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  29.43 
 
 		 1626 aa  387  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  28.9 
 
 		 1554 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  29.39 
 
 		 1573 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  30.28 
 
 		 1981 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  29.14 
 
 		 1609 aa  369  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  29.38 
 
 		 1611 aa  367  1e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  29.72 
 
 		 1429 aa  364  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  42.71 
 
 		 561 aa  350  9e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  28.72 
 
 		 1576 aa  348  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  29.04 
 
 		 1572 aa  347  7e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  29.44 
 
 		 1595 aa  336  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4997  YD repeat-containing protein  38.11 
 
 		 555 aa  335  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  29.53 
 
 		 1586 aa  333  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  28.9 
 
 		 1602 aa  332  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  27.79 
 
 		 1494 aa  318  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  27.79 
 
 		 1494 aa  318  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  47.16 
 
 		 480 aa  317  9e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  27.85 
 
 		 1487 aa  313  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1319 aa  312  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  28.11 
 
 		 1495 aa  305  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1317 aa  300  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  26.19 
 
 		 1541 aa  300  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  26.34 
 
 		 1517 aa  299  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  26.49 
 
 		 1541 aa  298  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  26.49 
 
 		 1541 aa  298  7e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  26.49 
 
 		 1541 aa  298  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  26.19 
 
 		 1541 aa  297  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  26.19 
 
 		 1541 aa  297  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  26.46 
 
 		 1381 aa  296  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  47.75 
 
 		 451 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  26.97 
 
 		 1485 aa  285  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  25.68 
 
 		 1518 aa  281  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  25.28 
 
 		 1475 aa  279  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  28.12 
 
 		 1673 aa  276  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  25.4 
 
 		 1508 aa  275  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.45 
 
 		 1197 aa  272  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  25.78 
 
 		 1553 aa  271  5.9999999999999995e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  26.61 
 
 		 1679 aa  271  8.999999999999999e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  25.24 
 
 		 1457 aa  270  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  25.13 
 
 		 1423 aa  268  5.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  24.71 
 
 		 1437 aa  266  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  26.56 
 
 		 1434 aa  266  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  25.99 
 
 		 1384 aa  265  4.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  25.82 
 
 		 1528 aa  260  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  31.21 
 
 		 1614 aa  259  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  28.97 
 
 		 1365 aa  258  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  24.52 
 
 		 1428 aa  255  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  24.73 
 
 		 1447 aa  253  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  27.59 
 
 		 1509 aa  249  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.69 
 
 		 1527 aa  247  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  26.58 
 
 		 1639 aa  246  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  26.38 
 
 		 1488 aa  243  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  25.28 
 
 		 1495 aa  242  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  24.94 
 
 		 1422 aa  241  5e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  25.64 
 
 		 1489 aa  239  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  24.65 
 
 		 1494 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  23.88 
 
 		 1699 aa  234  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  24.83 
 
 		 1600 aa  232  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>