163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0326 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  35.07 
 
 		 1208 aa  680    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1099  type VI secretion protein IcmF  56.69 
 
 		 1153 aa  1322    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  45.41 
 
 		 1165 aa  1038    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  57 
 
 		 1174 aa  1345    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  34.1 
 
 		 1205 aa  640    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 1194 aa  775    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  35.88 
 
 		 1187 aa  803    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1218  hypothetical protein  56.6 
 
 		 1153 aa  1316    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  45.1 
 
 		 1165 aa  1018    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  56.91 
 
 		 1174 aa  1342    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  34.64 
 
 		 1194 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  100 
 
 		 1177 aa  2417    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  45.61 
 
 		 1165 aa  1032    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  39.53 
 
 		 1008 aa  759    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  36.49 
 
 		 1182 aa  813    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  100 
 
 		 1177 aa  2417    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  34.72 
 
 		 1206 aa  628  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  34.49 
 
 		 1206 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  25.13 
 
 		 1172 aa  335  4e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1176 aa  330  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1179 aa  328  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  27.4 
 
 		 1179 aa  320  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1192 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  26.25 
 
 		 1181 aa  310  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1102 aa  307  7e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  26.29 
 
 		 1171 aa  304  6.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000435  IcmF-related protein  24.72 
 
 		 1130 aa  303  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.127342  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05857  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1129 aa  293  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  24.59 
 
 		 1182 aa  290  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  25.06 
 
 		 1212 aa  287  7e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  25.96 
 
 		 1199 aa  287  8e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1175 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1175 aa  284  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1208 aa  280  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  24.96 
 
 		 1209 aa  277  7e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  24.51 
 
 		 1209 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  25.2 
 
 		 1211 aa  276  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  24.43 
 
 		 1209 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  24.43 
 
 		 1209 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  24.43 
 
 		 1209 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  24.43 
 
 		 1209 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  24.43 
 
 		 1209 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  24.43 
 
 		 1209 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  25.84 
 
 		 1152 aa  272  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1168 aa  272  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  25.51 
 
 		 1218 aa  272  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  24.09 
 
 		 1209 aa  267  8e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  25.79 
 
 		 1220 aa  264  6.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  25.72 
 
 		 1175 aa  263  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1205 aa  261  8e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  25.28 
 
 		 1204 aa  253  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  24.55 
 
 		 1302 aa  252  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  24.46 
 
 		 1268 aa  250  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  23.61 
 
 		 1207 aa  244  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  25.04 
 
 		 1302 aa  244  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  24.36 
 
 		 1157 aa  242  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  25.26 
 
 		 1181 aa  240  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  26.05 
 
 		 1148 aa  238  6e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  23.64 
 
 		 1302 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  23.57 
 
 		 1302 aa  230  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  23.49 
 
 		 1302 aa  228  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  23.41 
 
 		 1302 aa  220  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  22.76 
 
 		 1329 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  22.6 
 
 		 1164 aa  211  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  23.77 
 
 		 1317 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1332 aa  193  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  23.18 
 
 		 1275 aa  191  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  23.18 
 
 		 1275 aa  191  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  21.91 
 
 		 1195 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  23.4 
 
 		 1348 aa  184  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  23 
 
 		 1369 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  23.55 
 
 		 1365 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  22.24 
 
 		 1270 aa  179  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  22.73 
 
 		 1366 aa  178  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  21.89 
 
 		 1288 aa  170  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  23.7 
 
 		 1365 aa  169  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  22.92 
 
 		 1150 aa  162  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0500  hypothetical protein  23.07 
 
 		 973 aa  158  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  22.68 
 
 		 1230 aa  157  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  29.39 
 
 		 831 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  26.43 
 
 		 830 aa  149  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  28.1 
 
 		 831 aa  149  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  28.1 
 
 		 831 aa  148  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  27.84 
 
 		 831 aa  147  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  27.86 
 
 		 1176 aa  145  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1885  ImcF-like family protein  22.02 
 
 		 1164 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0217268  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  24.87 
 
 		 830 aa  142  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1026  hypothetical protein  22.27 
 
 		 1167 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170738  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0805  hypothetical protein  22.27 
 
 		 1167 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00300591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0717  hypothetical protein  22.27 
 
 		 1167 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.319931  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2000  hypothetical protein  22.27 
 
 		 1167 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1164 aa  137  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  23.93 
 
 		 1164 aa  135  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0454  hypothetical protein  22.43 
 
 		 1147 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141895  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2090  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1104 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127209  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0524  hypothetical protein  23.53 
 
 		 973 aa  127  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  26.1 
 
 		 1173 aa  127  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1173 aa  125  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2262  ImcF-related  25.45 
 
 		 1335 aa  125  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295752  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  27.16 
 
 		 1289 aa  124  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>