More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0273 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03728  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  80.73 
 
 		 546 aa  914    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4144  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  80.73 
 
 		 546 aa  914    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2430  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  69.44 
 
 		 544 aa  770    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0250  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  88.77 
 
 		 543 aa  992    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0296  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  63.86 
 
 		 522 aa  656    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877142  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4201  ubiquinone biosynthesis protein AarF  58.41 
 
 		 549 aa  649    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03488  predicted protein kinase  62.24 
 
 		 529 aa  672    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4307  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  80.73 
 
 		 546 aa  914    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4359  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  82.82 
 
 		 546 aa  893    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0504  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  57.86 
 
 		 549 aa  645    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3639  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  100 
 
 		 543 aa  1110    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4203  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  82.82 
 
 		 546 aa  893    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0429  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  57.56 
 
 		 549 aa  647    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000673337 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3913  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  81.43 
 
 		 545 aa  913    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001925  ubiquinone biosynthesis monooxygenase UbiB  69.26 
 
 		 544 aa  773    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4245  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  82.02 
 
 		 546 aa  932    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.806176  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0525  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  59.15 
 
 		 549 aa  658    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4218  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  80 
 
 		 546 aa  911    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118244 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4173  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  80.73 
 
 		 546 aa  914    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514072 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0443  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  57.56 
 
 		 549 aa  645    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.627543 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00564  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  69.07 
 
 		 544 aa  776    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3943  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  99.82 
 
 		 543 aa  1109    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0273  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  100 
 
 		 543 aa  1110    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4098  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  58.96 
 
 		 549 aa  658    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5276  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  80.73 
 
 		 546 aa  914    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709941  normal  0.225701 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2998  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  68.02 
 
 		 543 aa  764    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  57.56 
 
 		 549 aa  647    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.915437  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0459  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  58.23 
 
 		 549 aa  639    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03677  hypothetical protein  80.73 
 
 		 546 aa  914    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4356  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  80.73 
 
 		 546 aa  914    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4054  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  80.37 
 
 		 546 aa  917    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4180  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  82.82 
 
 		 546 aa  893    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.944164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4211  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  61.38 
 
 		 544 aa  654    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3761  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  80.81 
 
 		 545 aa  879    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0544  2-octaprenylphenol hydroxylase  61.99 
 
 		 544 aa  701    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3553  2-octaprenylphenol hydroxylase  58.23 
 
 		 549 aa  650    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.96851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0403  2-octaprenylphenol hydroxylase  58.23 
 
 		 549 aa  650    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.977603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0473  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  57.98 
 
 		 549 aa  637    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3958  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  80 
 
 		 546 aa  900    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3375  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  60.07 
 
 		 549 aa  660    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3897  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  57.56 
 
 		 549 aa  645    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4059  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  80.73 
 
 		 546 aa  914    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3794  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  59.52 
 
 		 549 aa  645    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.647257  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4299  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  82.82 
 
 		 546 aa  893    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.128892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3727  2-octaprenylphenol hydroxylase  58.6 
 
 		 549 aa  654    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4252  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  82.82 
 
 		 546 aa  893    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3204  ubiquinone biosynthesis protein AarF  59.33 
 
 		 549 aa  657    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0321  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  60.59 
 
 		 546 aa  677    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  57.38 
 
 		 558 aa  588  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  54.03 
 
 		 549 aa  570  1e-161  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  54.03 
 
 		 549 aa  567  1e-160  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  55.27 
 
 		 547 aa  557  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  60 
 
 		 533 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  59.33 
 
 		 533 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4887  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  59.83 
 
 		 540 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  56.88 
 
 		 542 aa  551  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  61.49 
 
 		 527 aa  551  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  55.19 
 
 		 553 aa  550  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  56.83 
 
 		 561 aa  547  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5063  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  59.41 
 
 		 540 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.6439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0452  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  59.75 
 
 		 539 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.755983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  55.56 
 
 		 539 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  59.24 
 
 		 537 aa  539  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5152  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  54.98 
 
 		 539 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0385  2-octaprenylphenol hydroxylase  57.17 
 
 		 534 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2702  2-octaprenylphenol hydroxylase  52.92 
 
 		 534 aa  533  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136263 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.71 
 
 		 547 aa  534  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1186  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.82 
 
 		 556 aa  530  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0434  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  52.29 
 
 		 525 aa  527  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  54.38 
 
 		 509 aa  522  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  54.55 
 
 		 506 aa  520  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0374  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  51.38 
 
 		 525 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.218508 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  56.32 
 
 		 553 aa  513  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0595  2-octaprenylphenol hydroxylase  53.8 
 
 		 540 aa  512  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294006  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0461  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  51.03 
 
 		 525 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0351  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  50.84 
 
 		 525 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.594267 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2345  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  55.84 
 
 		 557 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0336  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  50.84 
 
 		 525 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  52.86 
 
 		 504 aa  503  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0189  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  50 
 
 		 525 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0686  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  50 
 
 		 525 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0848  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  50 
 
 		 525 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.120118  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2401  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  50 
 
 		 525 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0556  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  49.81 
 
 		 525 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0377  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  51.18 
 
 		 527 aa  498  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2757  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  50 
 
 		 525 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.925826  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2321  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  50 
 
 		 525 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0670  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  50 
 
 		 525 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  50.86 
 
 		 522 aa  494  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  53.89 
 
 		 525 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0870  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  55.58 
 
 		 521 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0799  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  55.58 
 
 		 521 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4047  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  49.43 
 
 		 525 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.690468 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.24 
 
 		 522 aa  494  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0652  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  50.29 
 
 		 525 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.559631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4126  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  53.01 
 
 		 521 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185917  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0863  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  54.7 
 
 		 517 aa  488  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2756  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  49.43 
 
 		 525 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2780  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  49.05 
 
 		 525 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2729  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  49.43 
 
 		 525 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>