More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0225 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02166  sn-glycerol-3-phosphate transporter  90.69 
 
 		 452 aa  845    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0247  sn-glycerol-3-phosphate transporter  86.64 
 
 		 450 aa  817    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0274937  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1419  glycerol-3-phosphate transporter  90.47 
 
 		 452 aa  844    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2419  sn-glycerol-3-phosphate transporter  91.57 
 
 		 452 aa  856    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  69.66 
 
 		 446 aa  647    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5238  glycerol-3-phosphate transporter  73.09 
 
 		 449 aa  669    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0305  sn-glycerol-3-phosphate transporter  73.09 
 
 		 449 aa  667    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02125  hypothetical protein  90.69 
 
 		 452 aa  845    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1411  sn-glycerol-3-phosphate transporter  90.47 
 
 		 452 aa  844    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2511  sn-glycerol-3-phosphate transporter  91.57 
 
 		 452 aa  856    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4149  sn-glycerol-3-phosphate transporter  91.96 
 
 		 449 aa  820    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000087639  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5451  sn-glycerol-3-phosphate transporter  70.39 
 
 		 449 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00923139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2523  sn-glycerol-3-phosphate transporter  91.57 
 
 		 452 aa  856    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  92.43 
 
 		 451 aa  832    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.140488  normal  0.0295712 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  87.28 
 
 		 449 aa  815    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000543007  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2537  sn-glycerol-3-phosphate transporter  90.69 
 
 		 452 aa  845    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2380  sn-glycerol-3-phosphate transporter  90.69 
 
 		 452 aa  845    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0225  sn-glycerol-3-phosphate transporter  100 
 
 		 450 aa  915    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3377  sn-glycerol-3-phosphate transporter  90.69 
 
 		 452 aa  844    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  73.56 
 
 		 448 aa  653    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2627  sn-glycerol-3-phosphate transporter  91.57 
 
 		 452 aa  856    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5978  sn-glycerol-3-phosphate transporter  71.56 
 
 		 448 aa  649    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2622  sn-glycerol-3-phosphate transporter  90.69 
 
 		 452 aa  845    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2392  sn-glycerol-3-phosphate transporter  90.69 
 
 		 452 aa  844    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1713  sn-glycerol-3-phosphate transporter  68.07 
 
 		 483 aa  655    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2468  sn-glycerol-3-phosphate transporter  91.57 
 
 		 452 aa  856    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0862405 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03311  sn-glycerol-3-phosphate transporter  69.11 
 
 		 455 aa  639    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2804  sn-glycerol-3-phosphate transporter  90.89 
 
 		 450 aa  830    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal  0.676266 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0001  sn-glycerol-3-phosphate transporter  71.49 
 
 		 452 aa  663    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000530916  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3958  sn-glycerol-3-phosphate transporter  92.41 
 
 		 449 aa  855    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00220837  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002677  glycerol-3-phosphate transporter  68.89 
 
 		 454 aa  630  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  66.82 
 
 		 457 aa  615  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0511  glycerol 3-phosphate transporter  60.83 
 
 		 481 aa  590  1e-167  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000061877  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2870  glycerol-3-phosphate transporter  61.25 
 
 		 445 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0556  glycerol-3-phosphate transporter  61.78 
 
 		 449 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000367094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0628  glycerol-3-phosphate transporter  63.05 
 
 		 449 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000215527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0572  glycerol-3-phosphate transporter  63.05 
 
 		 449 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00224555  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0661  glycerol-3-phosphate transporter  63.05 
 
 		 449 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00772133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4646  glycerol-3-phosphate transporter  62.76 
 
 		 449 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000791973  unclonable  8.6547e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0729  glycerol-3-phosphate transporter  63.05 
 
 		 449 aa  560  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0571  glycerol-3-phosphate transporter  63.05 
 
 		 449 aa  561  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00198632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0790  glycerol-3-phosphate transporter  63.05 
 
 		 449 aa  560  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000864698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0692  glycerol-3-phosphate transporter  62.3 
 
 		 449 aa  559  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0575  glycerol-3-phosphate transporter  61.57 
 
 		 449 aa  560  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0718  glycerol-3-phosphate transporter  62.82 
 
 		 449 aa  560  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000170433 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2060  glycerol-3-phosphate transporter  58.82 
 
 		 452 aa  525  1e-148  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0395  glycerol-3-phosphate transporter  57.74 
 
 		 452 aa  513  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0536129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0385  glycerol-3-phosphate transporter  57.74 
 
 		 452 aa  513  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000112087  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  55.35 
 
 		 448 aa  509  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4940  glycerol-3-phosphate transporter  44.57 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4955  glycerol-3-phosphate transporter  43.9 
 
 		 444 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3790  phosphoglycerate transporter  45.17 
 
 		 446 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  43.56 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  43.56 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5349  phosphoglycerate transporter family protein  43.9 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5051  phosphoglycerate transporter  43.11 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5375  phosphoglycerate transporter family protein  44.12 
 
 		 444 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5109  phosphoglycerate transporter family protein  44.12 
 
 		 444 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5429  phosphoglycerate transporter family protein  44.12 
 
 		 444 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5500  phosphoglycerate transporter family protein  44.12 
 
 		 444 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5381  phosphoglycerate transporter family protein  43.56 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5573  phosphoglycerate transporter family protein  43.33 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2588  phosphoglycerate transport: transporter  38.91 
 
 		 463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2653  phosphoglycerate transport: transporter  38.91 
 
 		 463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132768 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2629  phosphoglycerate transport: transporter  38.91 
 
 		 463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2759  phosphoglycerate transporter  38.91 
 
 		 463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2540  phosphoglycerate transport: transporter  38.91 
 
 		 463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1436  glycerol-3-phosphate transporter, putative  38.02 
 
 		 457 aa  304  3.0000000000000004e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000217705  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  41.26 
 
 		 456 aa  303  6.000000000000001e-81  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  37.15 
 
 		 446 aa  298  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  36.88 
 
 		 439 aa  281  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0032  regulatory protein UhpC  36.88 
 
 		 439 aa  281  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5097  regulatory protein UhpC  36.88 
 
 		 439 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.113676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4032  regulatory protein UhpC  36.88 
 
 		 439 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.47751 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03551  membrane protein regulates uhpT expression  36.88 
 
 		 439 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0036  phosphoglycerate transporter  36.88 
 
 		 439 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3880  regulatory protein UhpC  36.88 
 
 		 439 aa  280  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03493  hypothetical protein  36.88 
 
 		 439 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4175  regulatory protein UhpC  36.65 
 
 		 439 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  36.69 
 
 		 443 aa  273  7e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  37.5 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  37.5 
 
 		 455 aa  268  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4069  regulatory protein UhpC  36.53 
 
 		 442 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4014  regulatory protein UhpC  37.05 
 
 		 442 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4177  regulatory protein UhpC  36.83 
 
 		 442 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3998  regulatory protein UhpC  36.83 
 
 		 442 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4119  regulatory protein UhpC  36.3 
 
 		 442 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0029  regulatory protein UhpC  37.04 
 
 		 442 aa  259  7e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0083  regulatory protein UhpC  35.05 
 
 		 443 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.644662  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4130  regulatory protein UhpC  35.05 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.543128  normal  0.246836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4078  regulatory protein UhpC  35.05 
 
 		 443 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3502  regulatory protein UhpC  36.32 
 
 		 447 aa  255  9e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 446 aa  253  7e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 441 aa  250  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1684  major facilitator superfamily MFS_1  32.36 
 
 		 422 aa  229  8e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.597788  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 433 aa  229  9e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0624  regulatory protein UhpC  33.18 
 
 		 436 aa  229  9e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 		 437 aa  223  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0436  regulatory protein UhpC  32.76 
 
 		 434 aa  219  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0640  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 480 aa  218  2e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0187826  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>