More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0088 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  100 
 
 		 300 aa  605  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  99.67 
 
 		 300 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  99.67 
 
 		 300 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  85 
 
 		 300 aa  498  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  79.38 
 
 		 300 aa  484  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  79.86 
 
 		 300 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  79.52 
 
 		 300 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  79.52 
 
 		 300 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  79.52 
 
 		 300 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  78.16 
 
 		 300 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  78.16 
 
 		 300 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  79.18 
 
 		 300 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  78.16 
 
 		 300 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  78.16 
 
 		 300 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  78.16 
 
 		 300 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  78.16 
 
 		 300 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  78.16 
 
 		 300 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  78.16 
 
 		 300 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  78.16 
 
 		 300 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  72.45 
 
 		 300 aa  444  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  71 
 
 		 300 aa  430  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  70.07 
 
 		 300 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  69.8 
 
 		 298 aa  415  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  61.72 
 
 		 302 aa  355  7.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  60.33 
 
 		 302 aa  355  7.999999999999999e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  60.33 
 
 		 302 aa  354  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  60.34 
 
 		 301 aa  349  4e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  49.15 
 
 		 298 aa  295  7e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  47.42 
 
 		 318 aa  290  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  47.26 
 
 		 298 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  47.59 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  48.07 
 
 		 296 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  49.32 
 
 		 298 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  48.07 
 
 		 296 aa  268  8e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  48.07 
 
 		 290 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  49.66 
 
 		 298 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  48.6 
 
 		 289 aa  265  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  49.65 
 
 		 289 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  45.58 
 
 		 297 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  48.24 
 
 		 290 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  44.64 
 
 		 297 aa  261  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  49.31 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  47.89 
 
 		 290 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  46.85 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  48.24 
 
 		 317 aa  259  4e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  46.67 
 
 		 289 aa  256  5e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  46.39 
 
 		 296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  47.22 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  46.71 
 
 		 297 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  46.71 
 
 		 299 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  46.32 
 
 		 312 aa  251  9.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0283  cation diffusion facilitator family transporter  48.24 
 
 		 289 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000135254  hitchhiker  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  42.41 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  44.91 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  47.54 
 
 		 289 aa  249  5e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  50.18 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  47.18 
 
 		 289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  44.06 
 
 		 295 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  49.16 
 
 		 310 aa  242  5e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  42.66 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  47.18 
 
 		 290 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  40.56 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  40.22 
 
 		 296 aa  201  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  38.03 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  36.73 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  37.86 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  32.18 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  32.18 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  31.83 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0116  cation diffusion facilitator family transporter  36.92 
 
 		 323 aa  169  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.358203  normal  0.378394 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  34.64 
 
 		 297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  33.33 
 
 		 311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  33.46 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  32.52 
 
 		 314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  31.03 
 
 		 304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  30.8 
 
 		 309 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  33.21 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  32.35 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  33.08 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  31.07 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  32.14 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0532  ferrous-iron efflux pump FieF  35.25 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.800383  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 		 327 aa  133  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  29.39 
 
 		 295 aa  132  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  29.03 
 
 		 295 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  31.32 
 
 		 317 aa  132  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  30.42 
 
 		 306 aa  132  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1123  ferrous-iron efflux pump FieF  30.28 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00791465  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  30.88 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  31.7 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  29.73 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  32.09 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  29.04 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  31.21 
 
 		 295 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  31.34 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  31.34 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  29.3 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 478 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0253813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>