More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A4096 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  99.41 
 
 
507 aa  1019  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  99.61 
 
 
507 aa  1020  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  100 
 
 
507 aa  1026  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  85.91 
 
 
506 aa  873  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  85.12 
 
 
506 aa  864  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  82.46 
 
 
506 aa  823  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  58.35 
 
 
517 aa  584  1e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  58.6 
 
 
517 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  58.4 
 
 
517 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  58.8 
 
 
517 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  58.4 
 
 
517 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  58.8 
 
 
517 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  58.8 
 
 
517 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  58 
 
 
517 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  57.8 
 
 
517 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  57.74 
 
 
517 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  57.8 
 
 
517 aa  544  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  57.4 
 
 
517 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  55.91 
 
 
519 aa  539  1e-152  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  55.82 
 
 
507 aa  533  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  54.2 
 
 
510 aa  528  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  53.59 
 
 
518 aa  520  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0843  ABC transporter related  54.95 
 
 
496 aa  507  1e-142  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  0.0750454 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  49.49 
 
 
497 aa  481  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  47.14 
 
 
492 aa  471  1e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 
501 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.73 
 
 
492 aa  461  1e-128  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  47.53 
 
 
519 aa  458  1e-128  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  47.86 
 
 
524 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  47.86 
 
 
524 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  48.07 
 
 
524 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  45.95 
 
 
495 aa  456  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  45.58 
 
 
501 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  50.4 
 
 
499 aa  456  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  46.56 
 
 
504 aa  453  1e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  48.47 
 
 
524 aa  454  1e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  45.53 
 
 
497 aa  453  1e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  48.27 
 
 
524 aa  452  1e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  45.23 
 
 
501 aa  454  1e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  48.47 
 
 
524 aa  455  1e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.66 
 
 
527 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  47.66 
 
 
511 aa  449  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  45.75 
 
 
495 aa  450  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  47.05 
 
 
516 aa  451  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  47.96 
 
 
503 aa  448  1e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  47.47 
 
 
497 aa  448  1e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  47.96 
 
 
513 aa  447  1e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  46.64 
 
 
515 aa  446  1e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  47.86 
 
 
518 aa  446  1e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  45.21 
 
 
496 aa  444  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  9.97744e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.62 
 
 
494 aa  443  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  45.62 
 
 
494 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  47.67 
 
 
521 aa  443  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  46.96 
 
 
510 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  46.94 
 
 
513 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.62 
 
 
494 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  45.01 
 
 
496 aa  443  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12280  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  49.29 
 
 
505 aa  445  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171798  normal  0.428152 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  45.84 
 
 
496 aa  443  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 
494 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 
494 aa  443  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  47.98 
 
 
512 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  46.36 
 
 
506 aa  439  1e-122  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  4.97905e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  44.83 
 
 
500 aa  440  1e-122  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  46.12 
 
 
515 aa  440  1e-122  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 
494 aa  441  1e-122  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 
494 aa  439  1e-122  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  46.73 
 
 
513 aa  441  1e-122  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  43.12 
 
 
503 aa  441  1e-122  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 
525 aa  441  1e-122  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1580  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 
505 aa  439  1e-122  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.598954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  46.95 
 
 
525 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  46.49 
 
 
508 aa  438  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  46.75 
 
 
505 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  45.93 
 
 
517 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  46.36 
 
 
497 aa  435  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  46.68 
 
 
503 aa  438  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  45.44 
 
 
503 aa  437  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  1.10391e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.01 
 
 
494 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  44.96 
 
 
505 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  45.78 
 
 
502 aa  436  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.71 
 
 
516 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  46.08 
 
 
505 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  44.31 
 
 
500 aa  434  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  46.11 
 
 
514 aa  435  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  45.36 
 
 
509 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  45.1 
 
 
520 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  41.92 
 
 
493 aa  432  1e-120  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  46.48 
 
 
519 aa  431  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  44.91 
 
 
495 aa  431  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  45.56 
 
 
523 aa  432  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  44.82 
 
 
505 aa  429  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  46.53 
 
 
494 aa  430  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6154  putative sugar (D-ribose) ABC transporter ATP-binding protein  45.67 
 
 
500 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0328934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  44.35 
 
 
501 aa  427  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  43.51 
 
 
501 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  44.49 
 
 
499 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  45.51 
 
 
494 aa  427  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  8.1797e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  41.57 
 
 
499 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  46.77 
 
 
512 aa  425  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>