More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A4027 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3698  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  100 
 
 
263 aa  528  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4027  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  100 
 
 
263 aa  528  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3564  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  99.62 
 
 
262 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0517  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  86.97 
 
 
262 aa  454  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03969  carbon-phosphorus lyase complex subunit  85.49 
 
 
252 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3894  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  85.49 
 
 
252 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  85.49 
 
 
252 aa  436  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0301  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  85.1 
 
 
251 aa  434  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4651  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  85.49 
 
 
252 aa  437  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5610  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  85.49 
 
 
252 aa  435  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03929  hypothetical protein  85.49 
 
 
252 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4338  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  85.1 
 
 
252 aa  435  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4563  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  85.49 
 
 
252 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2690  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  86.11 
 
 
273 aa  429  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  84.06 
 
 
262 aa  419  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0709875  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0891  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  81.18 
 
 
254 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0579  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  77.43 
 
 
262 aa  408  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0483  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  78.57 
 
 
262 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2882  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.34 
 
 
269 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.769928  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20400  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.85 
 
 
271 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110651  normal  0.49891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1753  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.08 
 
 
271 aa  350  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3332  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.92 
 
 
284 aa  348  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2563  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  67.28 
 
 
273 aa  347  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2255  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  70.08 
 
 
273 aa  345  4e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000530025  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0274  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.23 
 
 
258 aa  344  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2192  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.96 
 
 
258 aa  342  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.32 
 
 
256 aa  340  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0762  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.01 
 
 
258 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000264723  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4231  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.8 
 
 
258 aa  338  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.503556  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4434  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.23 
 
 
258 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5844  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.59 
 
 
264 aa  335  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71167  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4120  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.61 
 
 
258 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2919  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.6 
 
 
262 aa  332  4e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0502891  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3829  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.71 
 
 
266 aa  331  9e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.179517  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2961  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.68 
 
 
257 aa  328  5.0000000000000004e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.919043  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4778  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.74 
 
 
260 aa  328  6e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal  0.35491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0758  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.28 
 
 
272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850324  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0817  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.68 
 
 
257 aa  325  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.27 
 
 
265 aa  323  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4093  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  62.55 
 
 
266 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6094  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  61.07 
 
 
263 aa  320  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991353  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4190  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.23 
 
 
258 aa  318  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2910  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.24 
 
 
257 aa  317  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.838485  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4211  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  61.66 
 
 
256 aa  315  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637449  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.46 
 
 
262 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3852  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.64 
 
 
257 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0141  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.42 
 
 
294 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5944  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.29 
 
 
256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.504755  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2183  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.29 
 
 
256 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.481502  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1181  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.49 
 
 
256 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3341  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.49 
 
 
256 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489996  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2590  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.49 
 
 
256 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3307  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.49 
 
 
256 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761331  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3777  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.1 
 
 
256 aa  300  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2404  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.1 
 
 
256 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3353  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  63.49 
 
 
611 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403888  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0320  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.1 
 
 
256 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2915  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  61.11 
 
 
254 aa  297  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  58.73 
 
 
260 aa  295  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  58.73 
 
 
260 aa  295  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5001  ABC transporter related  47.83 
 
 
276 aa  249  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.20285  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0428  ABC type ATPase  46.45 
 
 
283 aa  242  5e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.602427  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0464  ABC type ATPase  46.45 
 
 
283 aa  242  5e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.849392  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2292  ABC phosphonate transport system ATPase  47.45 
 
 
276 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4041  ABC transporter related  51.71 
 
 
276 aa  235  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0221  ABC transporter related  51.71 
 
 
276 aa  235  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3839  ABC transporter related  50.86 
 
 
276 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.588878  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3788  ABC transporter related  50.86 
 
 
276 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3508  ABC transporter related  51.07 
 
 
279 aa  231  8.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3688  ABC transporter for phosphonate ATP-binding protein  44.57 
 
 
278 aa  229  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2086  ABC transporter related  45.26 
 
 
278 aa  228  5e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2293  ABC transporter related  52.36 
 
 
276 aa  228  7e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1587  ABC transporter related  50.64 
 
 
280 aa  228  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4145  ABC transporter related  52.36 
 
 
276 aa  227  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0232  ABC transporter related  41.09 
 
 
286 aa  205  7e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5869  ABC transporter-related protein  40.65 
 
 
291 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0938  ABC transporter related  37.04 
 
 
686 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  40.23 
 
 
593 aa  175  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0537  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.93 
 
 
444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128807  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  37.65 
 
 
573 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  38.95 
 
 
612 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  37.8 
 
 
583 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0578  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.1 
 
 
464 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  40 
 
 
566 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0965  ABC transporter related  35.56 
 
 
686 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.346759 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40 
 
 
611 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0111  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.29 
 
 
322 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0386  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.23 
 
 
313 aa  167  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00722146  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0419  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.98 
 
 
334 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0195088  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0434  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.98 
 
 
334 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.542128  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  37.17 
 
 
627 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0817  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.08 
 
 
326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.98 
 
 
617 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.71 
 
 
643 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1566  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.64 
 
 
332 aa  164  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000751653  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  40.74 
 
 
532 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  39.69 
 
 
603 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  37.93 
 
 
549 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.24 
 
 
333 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.991753 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  37.82 
 
 
568 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>