253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A4000 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3591  lipoprotein NlpI  100 
 
 
294 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4000  lipoprotein NlpI  100 
 
 
294 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.825215  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3725  lipoprotein NlpI  100 
 
 
294 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.38632  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0494  lipoprotein NlpI  96.94 
 
 
294 aa  587  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0212481  normal  0.630766 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0590  lipoprotein NlpI  90.14 
 
 
294 aa  545  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0813  lipoprotein NlpI  89.46 
 
 
294 aa  543  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3460  lipoprotein NlpI  87.07 
 
 
294 aa  534  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03030  hypothetical protein  87.07 
 
 
294 aa  528  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0542  TPR repeat-containing protein  87.07 
 
 
294 aa  528  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.622793  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3468  lipoprotein NlpI  87.07 
 
 
294 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3608  lipoprotein NlpI  86.73 
 
 
294 aa  527  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3636  lipoprotein NlpI  87.07 
 
 
294 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02981  hypothetical protein  87.07 
 
 
294 aa  528  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3645  lipoprotein NlpI  87.07 
 
 
294 aa  528  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3459  lipoprotein NlpI  87.07 
 
 
294 aa  528  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3468  lipoprotein NlpI  87.07 
 
 
294 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4482  lipoprotein NlpI  87.07 
 
 
294 aa  528  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3355  lipoprotein NlpI  87.07 
 
 
294 aa  528  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3537  lipoprotein NlpI  87.07 
 
 
294 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3574  lipoprotein NlpI  87.07 
 
 
294 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0535  lipoprotein NlpI  87.07 
 
 
294 aa  528  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317241 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3600  lipoprotein NlpI  86.73 
 
 
294 aa  528  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3341  lipoprotein NlpI  86.05 
 
 
294 aa  525  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002614  lipoprotein nlpI precursor  47.7 
 
 
306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.490991  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03392  lipoprotein NlpI  47 
 
 
307 aa  266  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0996  lipoprotein NlpI  46.72 
 
 
303 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00555439  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0179  lipoprotein NlpI  47.22 
 
 
303 aa  256  4e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2208  lipoprotein NlpI  49.41 
 
 
287 aa  248  7e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1020  lipoprotein NlpI  43.2 
 
 
298 aa  246  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492811  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0967  lipoprotein NlpI  42.76 
 
 
301 aa  241  7e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.095502  hitchhiker  0.00485929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3054  lipoprotein NlpI  43.26 
 
 
297 aa  240  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000578899  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0603  lipoprotein NlpI  42.55 
 
 
327 aa  239  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297207  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2821  lipoprotein NlpI  44.36 
 
 
296 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125409  hitchhiker  0.000291055 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2828  lipoprotein NlpI  45.13 
 
 
301 aa  237  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000420478  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3274  lipoprotein NlpI  44.93 
 
 
300 aa  235  7e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000163193  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1097  lipoprotein NlpI  44.2 
 
 
300 aa  235  8e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00121066  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1134  lipoprotein NlpI  44.93 
 
 
300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00238055  unclonable  0.00000000000409261 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3383  lipoprotein NlpI  44.07 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0016605  hitchhiker  0.00207102 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1032  lipoprotein NlpI  44.2 
 
 
300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967145  hitchhiker  0.000000287221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1036  lipoprotein NlpI  44.2 
 
 
300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000294547  hitchhiker  0.00000000262651 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3411  lipoprotein NlpI  44.93 
 
 
300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00436122  hitchhiker  0.000788701 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3233  lipoprotein NlpI  44.57 
 
 
300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000825968  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0791  lipoprotein NlpI  41.5 
 
 
303 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0277627  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1210  lipoprotein NlpI  44.2 
 
 
300 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3555  lipoprotein NlpI  42.96 
 
 
302 aa  226  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000743312 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01845  lipoprotein NlpI  40.8 
 
 
269 aa  209  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.253228  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2210  lipoprotein NlpI  38.65 
 
 
305 aa  186  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2561  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.53 
 
 
547 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
1121 aa  59.3  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 
754 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 
1421 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 
585 aa  55.8  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 
699 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  34.52 
 
 
706 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 
572 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4642  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
249 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  35.23 
 
 
385 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  34.62 
 
 
820 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 
4079 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 
213 aa  53.1  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 
538 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.61 
 
 
632 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 
649 aa  52.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.99 
 
 
742 aa  52.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.09 
 
 
1056 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
754 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  34.31 
 
 
621 aa  51.6  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3962  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.97 
 
 
395 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 
352 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
621 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  36.79 
 
 
718 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.06 
 
 
988 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  34.31 
 
 
621 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7350  hypothetical protein  43.42 
 
 
668 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35 
 
 
836 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  35.63 
 
 
397 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 
1276 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  39.02 
 
 
605 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 
505 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 
923 aa  50.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  29.41 
 
 
708 aa  50.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1897  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 
268 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0935119 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  24.73 
 
 
579 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1552  hypothetical protein  29.66 
 
 
716 aa  50.4  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.937373  decreased coverage  0.0000146209 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 
3145 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  29.73 
 
 
743 aa  50.1  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  28.69 
 
 
706 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4093  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 
246 aa  49.3  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 
662 aa  49.3  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 
615 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
363 aa  49.3  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 
955 aa  49.3  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 
421 aa  49.3  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  35.71 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.87 
 
 
1979 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  40.24 
 
 
646 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2336  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 
413 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  35.62 
 
 
1694 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1811  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 
596 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.541585  normal  0.135887 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3428  TPR repeat-containing protein  33 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>