244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3738 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3977  Hsp33-like chaperonin  100 
 
 
293 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3738  Hsp33-like chaperonin  100 
 
 
293 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0175  Hsp33-like chaperonin  99.66 
 
 
293 aa  604  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4616  Hsp33-like chaperonin  79.18 
 
 
292 aa  488  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3895  Hsp33-like chaperonin  74.74 
 
 
289 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4072  Hsp33-like chaperonin  75.09 
 
 
289 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03253  Hsp33-like chaperonin  71.67 
 
 
292 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0312  Hsp33 protein  71.67 
 
 
292 aa  450  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4706  Hsp33-like chaperonin  71.67 
 
 
294 aa  451  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862784  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3679  Hsp33-like chaperonin  71.67 
 
 
292 aa  450  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.369906 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3597  Hsp33-like chaperonin  71.67 
 
 
294 aa  451  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0312  Hsp33-like chaperonin  71.67 
 
 
294 aa  451  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03205  hypothetical protein  71.67 
 
 
292 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3873  Hsp33-like chaperonin  71.67 
 
 
294 aa  451  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3779  Hsp33-like chaperonin  70.99 
 
 
294 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3867  Hsp33-like chaperonin  70.65 
 
 
294 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0248  Hsp33-like chaperonin  71.28 
 
 
290 aa  441  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0327  Hsp33-like chaperonin  71.97 
 
 
290 aa  443  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3804  Hsp33-like chaperonin  70.31 
 
 
294 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3695  Hsp33-like chaperonin  70.31 
 
 
294 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3770  Hsp33-like chaperonin  70.31 
 
 
294 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66165  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3697  Hsp33-like chaperonin  70.31 
 
 
294 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3814  Hsp33-like chaperonin  67.24 
 
 
292 aa  428  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0163  Hsp33-like chaperonin  60.55 
 
 
286 aa  364  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2309  Hsp33-like chaperonin  58.02 
 
 
296 aa  357  9e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0148  Hsp33-like chaperonin  58.82 
 
 
286 aa  355  5e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896821  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0153  Hsp33-like chaperonin  58.82 
 
 
286 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251791  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0148  Hsp33-like chaperonin  58.82 
 
 
286 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0146  Hsp33-like chaperonin  57.93 
 
 
286 aa  351  8e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0150  Hsp33-like chaperonin  57.93 
 
 
286 aa  351  8e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.156696 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0149  Hsp33-like chaperonin  57.93 
 
 
286 aa  351  8e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4209  Hsp33-like chaperonin  57.93 
 
 
286 aa  351  8e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3570  Hsp33-like chaperonin  58.97 
 
 
286 aa  349  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.47947  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0141  Hsp33-like chaperonin  57.4 
 
 
290 aa  348  8e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0102  Hsp33-like chaperonin  59.86 
 
 
286 aa  347  1e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.293086  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3622  Hsp33-like chaperonin  57.53 
 
 
286 aa  347  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158671  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00598  Hsp33-like chaperonin  55.75 
 
 
291 aa  347  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0118  Hsp33-like chaperonin  57.99 
 
 
288 aa  343  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218229  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2927  Hsp33-like chaperonin  54.61 
 
 
291 aa  343  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001895  heat-shock chaperonin  55.4 
 
 
291 aa  337  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4737  Hsp33-like chaperonin  58.25 
 
 
286 aa  330  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0669249  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4361  Hsp33-like chaperonin  56.9 
 
 
286 aa  328  8e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1648  Hsp33-like chaperonin  53.19 
 
 
286 aa  317  1e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00511557  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0166  Hsp33-like chaperonin  52.6 
 
 
294 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.210255  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0227  Hsp33-like chaperonin  50 
 
 
297 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0094  Hsp33 protein  50.18 
 
 
286 aa  299  3e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4594  Hsp33-like chaperonin  46.88 
 
 
290 aa  277  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03953  Hsp33-like chaperonin  45.21 
 
 
299 aa  268  5e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68610  Hsp33-like chaperonin  45.36 
 
 
297 aa  254  9e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5937  Hsp33-like chaperonin  46.05 
 
 
297 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0367  Hsp33-like chaperonin  45.61 
 
 
295 aa  249  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2074  Hsp33 protein  43.06 
 
 
289 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05430  Hsp33-like chaperonin  43.92 
 
 
297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512374  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3753  Hsp33 protein  41.11 
 
 
284 aa  238  6.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281487  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2980  chaperonin HSP33  42.7 
 
 
289 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0267  Hsp33-like chaperonin  42.56 
 
 
300 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2658  Hsp33 protein  40.82 
 
 
291 aa  236  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113843  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0238  chaperonin, 33 kDa  40.75 
 
 
300 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3626  heat shock protein HSP33  41.18 
 
 
297 aa  227  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.72943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4960  Hsp33-like chaperonin  38.61 
 
 
299 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909918 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0169  Hsp33-like chaperonin  40.2 
 
 
300 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0267  Hsp33-like chaperonin  38.74 
 
 
299 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0277  Hsp33-like chaperonin  38.94 
 
 
299 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0518  Hsp33 protein  43.88 
 
 
288 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0252  Hsp33-like chaperonin  38.41 
 
 
299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0158259 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1001  Hsp33 protein  41.3 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3996  Hsp33 protein  39.36 
 
 
291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1170  Hsp33 protein  37.93 
 
 
316 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000410448 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2141  Hsp33 protein  37.87 
 
 
316 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1436  Hsp33 protein  37.3 
 
 
316 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211523  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2122  Hsp33 protein  36.99 
 
 
316 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2104  Hsp33 protein  36.99 
 
 
316 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5410  Hsp33 protein  36.36 
 
 
316 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2014  Hsp33 protein  37.87 
 
 
316 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.904084  hitchhiker  0.00347972 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2574  chaperonin, 33 kDa  37.21 
 
 
316 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1463  33 kDa chaperonin  37.21 
 
 
316 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1687  chaperonin HSP33  37.21 
 
 
316 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196197  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2708  chaperonin HSP33  37.21 
 
 
316 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2628  chaperonin, 33 kDa  37.21 
 
 
316 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202437  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2190  chaperonin HSP33  37.21 
 
 
316 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3128  chaperonin HSP33  37.21 
 
 
316 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206679  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0165  Hsp33 protein  37.11 
 
 
294 aa  202  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0334  Hsp33 protein  39.24 
 
 
298 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.107665  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0975  Hsp33 protein  37.35 
 
 
337 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0472426 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1897  33 kDa. chaperonin  37.21 
 
 
316 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1071  Hsp33 protein  37.65 
 
 
337 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2557  Hsp33 protein  35.74 
 
 
316 aa  198  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179906  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1576  putative Hsp33 chaperonin  35.42 
 
 
316 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37783  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5973  Hsp33 protein  36.74 
 
 
308 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2733  hypothetical protein  32.87 
 
 
281 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2870  hypothetical protein  32.52 
 
 
281 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0333  Hsp33 protein  36.45 
 
 
326 aa  189  5e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1179  Hsp33 protein  35.81 
 
 
322 aa  188  9e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.863394  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0302  heat shock protein, Hsp33  36.77 
 
 
326 aa  187  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1058  Hsp33 protein  36.48 
 
 
334 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1108  Hsp33 protein  37.32 
 
 
293 aa  185  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3187  Hsp33 protein  36.13 
 
 
322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1132  putative redox regulated molecular chaperone heat-shock-like protein  36.07 
 
 
338 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1243  Hsp33 protein  35.97 
 
 
317 aa  182  8.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2069  Hsp33 protein  35.64 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>