More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3351 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  99.2 
 
 
250 aa  514  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  100 
 
 
250 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  99.6 
 
 
250 aa  515  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  86 
 
 
250 aa  455  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  73.9 
 
 
252 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  73.9 
 
 
252 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  77.2 
 
 
250 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  69.48 
 
 
252 aa  377  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  69.48 
 
 
252 aa  378  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  69.48 
 
 
252 aa  378  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  69.48 
 
 
252 aa  378  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  69.48 
 
 
252 aa  378  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  69.08 
 
 
252 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  69.08 
 
 
252 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  69.08 
 
 
252 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  71.08 
 
 
252 aa  360  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  76.8 
 
 
250 aa  352  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  64.8 
 
 
251 aa  344  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  59.52 
 
 
253 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  62.55 
 
 
254 aa  321  8e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  62.55 
 
 
254 aa  321  8e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  62.55 
 
 
254 aa  321  8e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  62.55 
 
 
254 aa  321  8e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  62.55 
 
 
254 aa  321  8e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  62.55 
 
 
262 aa  321  9.000000000000001e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  66.67 
 
 
252 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  58.73 
 
 
253 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  58.73 
 
 
253 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  58.73 
 
 
253 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  58.73 
 
 
253 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  62.14 
 
 
254 aa  319  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  61.92 
 
 
254 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  62.23 
 
 
235 aa  310  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  61.97 
 
 
252 aa  299  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  61.54 
 
 
252 aa  295  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  60.71 
 
 
251 aa  291  7e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  57.66 
 
 
250 aa  289  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  59.83 
 
 
249 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  59.13 
 
 
250 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  55.38 
 
 
253 aa  258  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  54.58 
 
 
253 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  55.78 
 
 
253 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  54.58 
 
 
253 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  55.78 
 
 
253 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  54.98 
 
 
604 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  53.39 
 
 
253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  57.21 
 
 
261 aa  246  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  51 
 
 
254 aa  238  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  45.78 
 
 
256 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  41.6 
 
 
312 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  41.89 
 
 
275 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  36.05 
 
 
289 aa  166  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  39.83 
 
 
290 aa  159  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  37.7 
 
 
269 aa  157  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  31.76 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  27.56 
 
 
271 aa  92.8  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  32.95 
 
 
424 aa  90.9  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  30.29 
 
 
272 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  30.57 
 
 
279 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  29.93 
 
 
272 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  28.4 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  30.97 
 
 
271 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  25.34 
 
 
270 aa  85.9  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  27.38 
 
 
268 aa  85.9  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  29.55 
 
 
272 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  29.17 
 
 
282 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  32.37 
 
 
365 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  24.89 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  26.82 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  28.29 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  32.24 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  29.55 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  26 
 
 
267 aa  82  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  28.95 
 
 
278 aa  82  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  25.47 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  27.31 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  28.4 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  27.43 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  28.35 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  32.29 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  30.61 
 
 
281 aa  79  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  28.37 
 
 
280 aa  78.6  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  28.29 
 
 
268 aa  78.6  0.00000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  26.27 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  29.62 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  26.04 
 
 
487 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0890  peptidase M48, Ste24p  31.87 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397549  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  29.2 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  26.14 
 
 
285 aa  75.5  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3668  peptidase M48, Ste24p  27.17 
 
 
273 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  29.61 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  29.45 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  29.06 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  31.55 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  31.44 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  31.55 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1773  putative metalloprotease  28.57 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.480116  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  25.66 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  26.38 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  25.1 
 
 
487 aa  73.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>