211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3288 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  100 
 
 		 414 aa  849    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  100 
 
 		 414 aa  849    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  99.76 
 
 		 414 aa  847    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  74.7 
 
 		 410 aa  627  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  70.62 
 
 		 412 aa  598  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  70.82 
 
 		 408 aa  593  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  67.58 
 
 		 410 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  66.58 
 
 		 410 aa  521  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  63.52 
 
 		 400 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  59.41 
 
 		 442 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  57.46 
 
 		 414 aa  488  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  63.28 
 
 		 400 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  63.28 
 
 		 400 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  60.7 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  60.7 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  63.28 
 
 		 400 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  60.7 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  60.7 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  60.45 
 
 		 400 aa  484  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  60.7 
 
 		 400 aa  487  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  63.03 
 
 		 400 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  60.7 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  60.7 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  60.45 
 
 		 400 aa  483  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  57.84 
 
 		 401 aa  479  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  55.22 
 
 		 404 aa  461  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  53.66 
 
 		 423 aa  455  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  52.91 
 
 		 515 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3442  exonuclease subunit SbcD  50.67 
 
 		 483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289654  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  53.33 
 
 		 406 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  49.21 
 
 		 506 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  50.61 
 
 		 414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  52.58 
 
 		 425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  50.61 
 
 		 406 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  46.27 
 
 		 408 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  44.34 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  37.74 
 
 		 418 aa  306  3e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  37.29 
 
 		 414 aa  292  6e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  37.16 
 
 		 409 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  39.07 
 
 		 408 aa  282  8.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  36.47 
 
 		 409 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  35.52 
 
 		 410 aa  268  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  35.12 
 
 		 410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  37.35 
 
 		 416 aa  256  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  32.76 
 
 		 498 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1319  nuclease SbcCD, D subunit  37.99 
 
 		 411 aa  250  3e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  32.67 
 
 		 410 aa  239  5.999999999999999e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1100  nuclease SbcCD, D subunit  43.77 
 
 		 537 aa  227  3e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1398  nuclease SbcCD, D subunit  42.7 
 
 		 517 aa  223  4e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1064  exodeoxyribonuclease I subunit D  43.07 
 
 		 528 aa  223  7e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  34.28 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  34.5 
 
 		 412 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  34.5 
 
 		 412 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1822  nuclease SbcCD, D subunit  34.08 
 
 		 467 aa  182  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1557  nuclease SbcCD, D subunit  33.5 
 
 		 412 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436101  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4885  nuclease SbcCD, D subunit  36.05 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.788581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3216  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.99 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  31.7 
 
 		 409 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1715  exonuclease SbcD  32.14 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1585  nuclease SbcCD, D subunit  34.86 
 
 		 412 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583238  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3765  exonuclease SbcD  32.14 
 
 		 414 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0831731  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  35.16 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0434  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.57 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0609998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0468  nuclease SbcCD, D subunit  30.59 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  30.86 
 
 		 407 aa  157  5.0000000000000005e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0463  nuclease SbcCD, D subunit  30.82 
 
 		 419 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165432  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  35 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  32.44 
 
 		 386 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  34.88 
 
 		 382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  32.45 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  31.53 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.98 
 
 		 418 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  30.7 
 
 		 385 aa  140  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  29.55 
 
 		 366 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.42 
 
 		 386 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  30.77 
 
 		 379 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  31.62 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  30.33 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  30.23 
 
 		 377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  31.13 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0858  putative Exonuclease SbcD homolog  29.5 
 
 		 413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.14 
 
 		 390 aa  133  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  30.51 
 
 		 392 aa  133  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  31.51 
 
 		 407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  26.83 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  31.1 
 
 		 387 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  30.32 
 
 		 390 aa  130  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0348  nuclease SbcCD, D subunit  29.17 
 
 		 415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  31.5 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0304  nuclease SbcCD, D subunit  31.5 
 
 		 415 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.919689  normal  0.177579 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  29.43 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  33.58 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  27.45 
 
 		 386 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  30.03 
 
 		 381 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.92 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  28.98 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.92 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  29.24 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4361  nuclease SbcCD, D subunit  32.43 
 
 		 383 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.820345  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  27.33 
 
 		 393 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>