More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3226 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_t00051  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00052  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00053  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00057  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0017  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.687744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0018  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0019  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.69794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4492  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0063  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0052  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00733518  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3226  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0172509  normal  0.439997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0088  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0282515  hitchhiker  0.000000388022 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3467  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139541  normal  0.865403 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3185  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3661  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.677335  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2956  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.211186  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3547  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.226089  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3135  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.369915  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3153  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.311913  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3316  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.863126  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3227  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0186102  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3136  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.364243  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0013  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000085866 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0082  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0688432  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3215  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4693  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0080  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0693639  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0029  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.992262  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5066  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.126908  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5065  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5064  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0026  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116452  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0062  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4276  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000119762  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3201  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.145985  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4080  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909328  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3584  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4212  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353774  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3152  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469971  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3479  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.344656  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3478  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3990  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448395  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3646  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981191  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4079  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0890507  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4081  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0905537  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0081  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0120643  normal  0.12492 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0081  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0699076  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0027  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.992262  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0070  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0467546  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2957  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220059  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0068  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141165  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0069  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.043282  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2955  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.14009  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0019  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0021  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0020  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4700  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00322718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4696  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0069  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0763001  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0070  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0792206  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3183  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5071  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102189  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4214  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0070  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.628409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4213  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.355481  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3216  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3315  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583787  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3202  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.148125  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0011  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna067  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000491703  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4695  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4694  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna116  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000457869  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t022  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0028  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R19  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000168289  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0121  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000952956  decreased coverage  0.0000866797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0112  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000290991  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0040  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251493  hitchhiker  0.0001025 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0087  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00788985  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0041  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000296842  normal  0.054295 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0020  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0039  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00627079  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna065  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000522671  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0036  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.119632  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2750  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.88112e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2747  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000177551  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0097  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000407558  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna073  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000472118  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0019  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0104  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000123497  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3184  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna063  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000457869  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0077  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna069  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000397196  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0089  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0276092  hitchhiker  0.00000375071 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t017  tRNA-Met  98.68 
 
 
77 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000231655  unclonable  0.00000000000340211 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0082  tRNA-Met  98.68 
 
 
77 bp  143  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00104  tRNA-Met  98.65 
 
 
74 bp  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03399  tRNA-Met  98.65 
 
 
74 bp  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>