More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2908 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  100 
 
 
128 aa  262  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  100 
 
 
128 aa  262  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  100 
 
 
128 aa  262  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  77.95 
 
 
134 aa  202  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  65.87 
 
 
131 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  65.08 
 
 
131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0153  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  63.49 
 
 
131 aa  158  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471922  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  63.49 
 
 
131 aa  158  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0349436  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  62.7 
 
 
131 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0107  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  60.16 
 
 
132 aa  153  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000992989  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  60.16 
 
 
129 aa  152  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0104  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  60.16 
 
 
132 aa  152  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000574829  normal  0.261189 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00100  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  60.16 
 
 
129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3501  mutator MutT protein  60.16 
 
 
129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00099  hypothetical protein  60.16 
 
 
129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3558  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  60.16 
 
 
129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.016637  hitchhiker  0.00136766 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  59.38 
 
 
129 aa  150  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  59.2 
 
 
131 aa  148  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  58.4 
 
 
131 aa  147  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  59.2 
 
 
132 aa  147  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0093  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  58.59 
 
 
129 aa  147  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316081  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0645  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  60.94 
 
 
130 aa  146  9e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62648  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  57.14 
 
 
134 aa  140  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0991  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  51.22 
 
 
132 aa  121  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  47.66 
 
 
130 aa  117  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  45.67 
 
 
319 aa  116  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  44.35 
 
 
315 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  47.97 
 
 
317 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  46.34 
 
 
316 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  47.58 
 
 
128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  45.74 
 
 
132 aa  113  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  45.53 
 
 
314 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  45.16 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  44.72 
 
 
314 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  44.72 
 
 
314 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  43.9 
 
 
313 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  47.62 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  45.53 
 
 
314 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  44.72 
 
 
314 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  44.35 
 
 
133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  44.8 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  45 
 
 
321 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  45.38 
 
 
329 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  45.38 
 
 
329 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  46.61 
 
 
306 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  42.28 
 
 
316 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  41.6 
 
 
134 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  42.86 
 
 
129 aa  104  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  42.28 
 
 
313 aa  104  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  41.27 
 
 
126 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  41.13 
 
 
134 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  43.44 
 
 
317 aa  102  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  43.2 
 
 
141 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004482  MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  45.74 
 
 
132 aa  101  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3395  mutator mutT protein  44.35 
 
 
131 aa  100  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  43.85 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  41.6 
 
 
137 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  39.06 
 
 
383 aa  99  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  38.89 
 
 
129 aa  98.6  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  42.28 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  39.68 
 
 
314 aa  98.2  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.62 
 
 
360 aa  98.2  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  41.6 
 
 
132 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  41.6 
 
 
132 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  40.8 
 
 
135 aa  96.7  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  44 
 
 
141 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  43.75 
 
 
139 aa  96.7  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  41.6 
 
 
132 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  42.62 
 
 
136 aa  96.7  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  41.73 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  40.16 
 
 
329 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  38.33 
 
 
315 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 
133 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  46 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  39.2 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
172 aa  94.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  41.46 
 
 
130 aa  94.4  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  41.27 
 
 
142 aa  94.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0407  mutator MutT protein  41.46 
 
 
129 aa  94.7  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  40.17 
 
 
315 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  38.58 
 
 
131 aa  94.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  41.46 
 
 
130 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  41.46 
 
 
130 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  40.98 
 
 
128 aa  94.4  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  43.24 
 
 
146 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  41.27 
 
 
149 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  40.16 
 
 
142 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 
150 aa  94  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  40.48 
 
 
352 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  40.16 
 
 
137 aa  94  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  41.09 
 
 
149 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 
151 aa  94  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  40 
 
 
133 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  38.89 
 
 
310 aa  93.6  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  40.68 
 
 
137 aa  93.6  8e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  41.09 
 
 
334 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  40.65 
 
 
130 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  41.38 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  36.22 
 
 
318 aa  92.8  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>