152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2558 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2558  outer membrane lipoprotein Pcp  100 
 
 
155 aa  296  6e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000494181  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1877  17 kDa surface antigen  100 
 
 
155 aa  296  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000817006  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1769  outer membrane lipoprotein Pcp  99.35 
 
 
155 aa  295  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000141648  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1898  outer membrane lipoprotein pcp  73.55 
 
 
155 aa  201  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.470796  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1542  outer membrane lipoprotein pcp  73.55 
 
 
155 aa  201  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1729  outer membrane lipoprotein pcp  73.55 
 
 
155 aa  201  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0331047  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1555  outer membrane lipoprotein pcp  73.55 
 
 
155 aa  201  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.949838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1615  outer membrane lipoprotein pcp  73.55 
 
 
155 aa  201  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.397211 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01611  outer membrane lipoprotein  74.84 
 
 
155 aa  201  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1999  17 kDa surface antigen  74.84 
 
 
155 aa  201  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00005432  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2353  outer membrane lipoprotein SlyB  74.84 
 
 
155 aa  201  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00612536  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01601  hypothetical protein  74.84 
 
 
155 aa  201  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1717  outer membrane lipoprotein SlyB  74.84 
 
 
155 aa  201  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.535204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1851  outer membrane lipoprotein SlyB  74.84 
 
 
155 aa  201  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000135134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1988  17 kDa surface antigen  74.84 
 
 
155 aa  201  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.636223  hitchhiker  0.00129397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1558  outer membrane lipoprotein SlyB  74.84 
 
 
155 aa  201  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1833  outer membrane lipoprotein SlyB  74.84 
 
 
155 aa  201  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.520508  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1807  17 kDa surface antigen  73.55 
 
 
155 aa  195  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55882  hitchhiker  0.000926812 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2665  17 kDa surface antigen  70.32 
 
 
155 aa  184  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000160562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2381  17 kDa surface antigen  70.32 
 
 
155 aa  184  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00375113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2215  17 kDa surface antigen  68.18 
 
 
163 aa  180  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.443445  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1723  17 kDa surface antigen  67.1 
 
 
155 aa  175  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00134301  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1690  17 kDa surface antigen  66.45 
 
 
155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26678  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0378  outer membrane lipoprotein PcP  69.87 
 
 
155 aa  167  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1219  outer membrane lipoprotein PcP  69.87 
 
 
155 aa  167  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0445  17 kDa surface antigen  69.23 
 
 
155 aa  166  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0736  17 kDa surface antigen  69.68 
 
 
155 aa  155  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0665  outer membrane lipoprotein PcP  69.03 
 
 
155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  50.68 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0470  17 kDa surface antigen  39.73 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000215158  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1151  17 kDa surface antigen  43.08 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.965272  normal  0.0962172 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50740  hypothetical protein  42.36 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688218 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4325  hypothetical protein  42.36 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.138091  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003797  putative outer membrane lipoprotein Pcp  41.78 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6520  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  33.56 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6233  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  33.33 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0997303  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  34.46 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3852  lipoprotein SlyB, putative  37.01 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.782854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1231  surface antigen protein  37.14 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.302793  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3682  outer membrane lipoprotein  39.16 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0952  outer membrane lipoprotein pcp precursor  44.16 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.013543  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  35.34 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3449  17 kDa surface antigen  38.4 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499306  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19520  outer membrane lipoprotein  40.82 
 
 
154 aa  67  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3432  17 kDa surface antigen  38.97 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0130273 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2635  17 kDa surface antigen  38.73 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0116  17 kDa surface antigen  37.76 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.72771  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0599  17 kDa surface antigen  37.76 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.181181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0568  17 kDa surface antigen  37.76 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  decreased coverage  0.000059328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0501  17 kDa surface antigen  37.76 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.354763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0525  17 kDa surface antigen  37.76 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0526  putative outer membrane lipoprotein, SlyB-like  39.33 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0527356  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  32.03 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2695  17 kDa surface antigen  30.13 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000023242  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5596  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  30.94 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  31.43 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1167  17 kDa surface antigen  32.28 
 
 
154 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3037  17 kDa surface antigen  33.12 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2507  outer membrane lipoprotein  40.56 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3507  outer membrane lipoprotein  40.56 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1157  outer membrane lipoprotein  40.56 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0428  outer membrane lipoprotein  40.56 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1287  outer membrane lipoprotein  40.56 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3471  outer membrane lipoprotein  40.56 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.31165  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3509  outer membrane lipoprotein  40.56 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3277  outer membrane lipoprotein  40.56 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1131  17 kDa surface antigen  32.28 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40399  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2871  17 kDa surface antigen-like protein  33.55 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000441534  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  36.67 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000341658  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2627  17 kDa surface antigen  33.12 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.940371  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4284  17 kDa surface antigen  32.28 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  43.28 
 
 
179 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  43.28 
 
 
179 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  43.28 
 
 
179 aa  55.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  43.28 
 
 
179 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  43.28 
 
 
179 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  43.28 
 
 
179 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  43.28 
 
 
179 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4115  lipoprotein SlyB, putative  35.71 
 
 
154 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.404382  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0037  17 kDa surface antigen  46.1 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  41.79 
 
 
179 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  43.28 
 
 
179 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  41.79 
 
 
179 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  41.79 
 
 
179 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  41.79 
 
 
179 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  41.79 
 
 
179 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  40.24 
 
 
225 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  41.79 
 
 
179 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  50 
 
 
178 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1150  Outer membrane lipoprotein-like  40.46 
 
 
303 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527599  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1440  17 kDa surface antigen  41.67 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.390363  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  32.41 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1652  17 kDa surface antigen  35 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000172178  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  35.11 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2622  hypothetical protein  35.83 
 
 
156 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1727  17 kDa surface antigen  35 
 
 
156 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000263697  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2250  17 kDa surface antigen  32.61 
 
 
164 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454882  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1757  17 kDa surface antigen  35 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000073012  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  37.61 
 
 
165 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  37.61 
 
 
165 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>