More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2529 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1799  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  70.6 
 
 
513 aa  743  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.322981  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1869  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  72.34 
 
 
513 aa  768  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.148583 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1807  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  72.34 
 
 
513 aa  768  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1902  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  99.81 
 
 
525 aa  1067  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1808  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  72.34 
 
 
513 aa  768  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.354235 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2152  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  69.25 
 
 
514 aa  738  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1794  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  99.81 
 
 
525 aa  1067  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1556  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  70.6 
 
 
513 aa  742  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1729  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  73.42 
 
 
522 aa  792  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.52273  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01311  hypothetical protein  70.6 
 
 
513 aa  742  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00331968  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1761  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  72.47 
 
 
536 aa  777  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2324  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  73.8 
 
 
522 aa  794  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2302  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  70.6 
 
 
513 aa  742  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0336241  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1438  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  70.6 
 
 
513 aa  742  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1968  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  70.6 
 
 
513 aa  744  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.337458 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1649  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  72.15 
 
 
513 aa  766  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.727425  hitchhiker  0.000895346 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2529  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  100 
 
 
525 aa  1071  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2617  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  84.35 
 
 
523 aa  914  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.881496 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1467  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  72.34 
 
 
513 aa  768  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0744789  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1534  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  70.41 
 
 
513 aa  736  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2604  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  72.47 
 
 
522 aa  778  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2323  transcriptional regulator, TyrR  70.6 
 
 
513 aa  742  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00133165  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01300  DNA-binding transcriptional dual regulator, tyrosine-binding  70.6 
 
 
513 aa  742  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0041974  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0926  transcriptional regulator TyrR  52.23 
 
 
513 aa  547  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01919  hypothetical protein  52.33 
 
 
514 aa  542  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02829  Transcriptional regulatory protein tyrR  50.87 
 
 
518 aa  538  1e-152  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0448077  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003165  transcriptional repressor protein TyrR  50.88 
 
 
514 aa  531  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2998  transcriptional regulator, TyrR  51.26 
 
 
518 aa  525  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.014514  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0864  transcriptional regulator, sigma-54 interaction protein  50.19 
 
 
515 aa  521  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1481  transcriptional regulator, TyrR  50.1 
 
 
512 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000204273  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1517  transcriptional regulator, TyrR  50.1 
 
 
512 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1669  transcriptional regulatory protein TyrR  50.1 
 
 
512 aa  519  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1486  transcriptional regulator, TyrR  50.1 
 
 
512 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.181258  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2866  transcriptional regulator, TyrR  50.1 
 
 
512 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313712  hitchhiker  7.67573e-11 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1717  transcriptional regulator, TyrR  50.48 
 
 
512 aa  519  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0924864  normal  0.0289301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2928  transcriptional regulator, TyrR  50.48 
 
 
512 aa  518  1e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.422498  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2672  transcriptional regulator, TyrR  49.71 
 
 
512 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0181063  hitchhiker  0.0037784 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2779  transcriptional regulator, TyrR  49.71 
 
 
512 aa  514  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00129727  hitchhiker  3.13655e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2605  transcriptional regulator, TyrR  49.71 
 
 
512 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  decreased coverage  1.06827e-07 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1437  transcriptional regulator, TyrR  50.29 
 
 
514 aa  514  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.555586  normal  0.67019 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1388  transcriptional regulator, TyrR  49.71 
 
 
512 aa  514  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2220  transcriptional regulatory protein TyrR  48.94 
 
 
512 aa  511  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2593  sigma-54 factor, interaction region  48.74 
 
 
512 aa  499  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  4.97691e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1330  transcriptional regulator, TyrR  47.97 
 
 
512 aa  500  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540713  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1450  transcriptional regulator, TyrR  48.07 
 
 
513 aa  498  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276382  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3764  sigma-54 dependent transcriptional regulator TyrR  46.21 
 
 
516 aa  488  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.286891  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1500  transcriptional regulator TyrR  44.83 
 
 
520 aa  438  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3111  transcriptional regulator, TyrR  44.57 
 
 
517 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.605009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3778  transcriptional regulator, TyrR  43.6 
 
 
519 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18738  hitchhiker  0.000851143 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1425  transcriptional regulator, TyrR  43.22 
 
 
519 aa  416  1e-115  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.392472  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4489  transcriptional regulator TyrR  43.22 
 
 
519 aa  416  1e-115  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3994  transcriptional regulator, TyrR  43.02 
 
 
519 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.295924  normal  0.0800973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52980  transcriptional regulator PhhR  43.43 
 
 
519 aa  406  1e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4643  transcriptional regulator PhhR  43.76 
 
 
515 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1823  phenylalanine hydroxylase transcriptional activator PhhR  42.08 
 
 
521 aa  401  1e-110  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3574  helix-turn-helix, Fis-type  41.52 
 
 
525 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1101  helix-turn-helix, Fis-type  41.7 
 
 
502 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1034  transcriptional regulator, TyrR  41.47 
 
 
502 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0997  sigma-54 dependent transcriptional regulator/sensory box protein  41.47 
 
 
502 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4227  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  41.39 
 
 
531 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0941591  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25940  sigma54-dependent activator protein  41.59 
 
 
505 aa  372  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.935166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4390  transcriptional regulator TyrR  41.54 
 
 
502 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1280  transcriptional regulator TyrR, putative  41.2 
 
 
502 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0996  putative PAS/PAC sensor protein  41.28 
 
 
502 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1348  putative PAS/PAC sensor protein  40.43 
 
 
506 aa  364  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32940  transcriptional regulator  41.07 
 
 
511 aa  358  1e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.86487e-05 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2801  transcriptional regulator  40.88 
 
 
511 aa  356  5e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3097  putative PAS/PAC sensor protein  41.76 
 
 
510 aa  356  6e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1706  sigma-54 dependent transcriptional regulator  35.62 
 
 
532 aa  343  5e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0090  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.11 
 
 
541 aa  323  7e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00173924  hitchhiker  0.00306857 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0663  putative PAS/PAC sensor protein  36.08 
 
 
527 aa  312  7e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1103  transcriptional regulatory protein  50.32 
 
 
313 aa  301  2e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1326  putative sigma54 specific transcriptional regulator  35.05 
 
 
540 aa  296  5e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.01296e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2382  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  32.83 
 
 
539 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0222564  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1552  Fis family transcriptional regulator  32.89 
 
 
525 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.246478  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0608  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  44.07 
 
 
527 aa  260  6e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.79337e-05 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4389  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.19 
 
 
495 aa  254  2e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205713  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2640  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.72 
 
 
532 aa  255  2e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0508  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  45.05 
 
 
495 aa  254  4e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2200  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.07 
 
 
459 aa  253  7e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1219  NifA subfamily transcriptional regulator  44.23 
 
 
529 aa  253  7e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.832328  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04971  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  43.27 
 
 
444 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001184  putative two-component response regulator  43.77 
 
 
443 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3599  two component Fis family transcriptional regulator  42.54 
 
 
459 aa  251  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1635  Fis family transcriptional regulator  41.42 
 
 
576 aa  251  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.980236  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2365  two component signal transduction response regulator  33.63 
 
 
575 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1825  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  44.55 
 
 
336 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.760782  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2132  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  44.87 
 
 
336 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.11031  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1486  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.95 
 
 
525 aa  247  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0842644  hitchhiker  1.47012e-08 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4240  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.23 
 
 
469 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1913  putative sigma54 specific transcriptional regulator  39.51 
 
 
710 aa  245  1e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0899132  normal  0.0546689 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1719  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40.18 
 
 
582 aa  245  1e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2153  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  32.89 
 
 
604 aa  244  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0173  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.66 
 
 
463 aa  243  6e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4396  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.91 
 
 
469 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4373  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.91 
 
 
469 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1763  putative PAS/PAC sensor protein  39.35 
 
 
698 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0168  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.18 
 
 
459 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.564625  normal  0.730975 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1487  sigma-L-dependent transcriptional regulator  39.16 
 
 
696 aa  242  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0776  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.84 
 
 
454 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>