More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2494 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  57.18 
 
 		 722 aa  869    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  57.32 
 
 		 722 aa  872    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  100 
 
 		 720 aa  1486    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  99.44 
 
 		 720 aa  1477    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  99.31 
 
 		 720 aa  1477    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  57.18 
 
 		 722 aa  869    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  57.04 
 
 		 722 aa  864    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  40.54 
 
 		 684 aa  103  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  37.72 
 
 		 961 aa  102  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  27.11 
 
 		 770 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  38.75 
 
 		 329 aa  100  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.68 
 
 		 318 aa  100  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  34.38 
 
 		 373 aa  98.6  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  38.51 
 
 		 393 aa  97.1  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  38.24 
 
 		 838 aa  96.7  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  26.84 
 
 		 770 aa  97.1  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  26.84 
 
 		 770 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  36.88 
 
 		 831 aa  96.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  33.16 
 
 		 789 aa  96.7  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  34.83 
 
 		 373 aa  96.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  35.98 
 
 		 331 aa  96.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  38.51 
 
 		 557 aa  95.5  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  37.04 
 
 		 293 aa  94.7  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.65 
 
 		 341 aa  93.2  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  32.12 
 
 		 1037 aa  93.2  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  36.94 
 
 		 241 aa  92.4  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  30.34 
 
 		 291 aa  93.2  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  34.78 
 
 		 208 aa  92.8  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  38.16 
 
 		 376 aa  92.4  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  38.04 
 
 		 1402 aa  92.4  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  35.8 
 
 		 380 aa  91.7  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  34.36 
 
 		 271 aa  91.3  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.25 
 
 		 865 aa  91.3  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  34.88 
 
 		 264 aa  90.9  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  37.5 
 
 		 376 aa  90.9  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  35.46 
 
 		 185 aa  90.5  9e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  25.41 
 
 		 772 aa  90.5  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  25.62 
 
 		 530 aa  89.7  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  32.96 
 
 		 252 aa  90.1  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1532  Sel1 domain-containing protein  32.93 
 
 		 746 aa  90.1  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00292625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  38.27 
 
 		 425 aa  89.7  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  38.16 
 
 		 255 aa  89.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.46 
 
 		 380 aa  89  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  39.02 
 
 		 552 aa  88.6  4e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  37.82 
 
 		 489 aa  88.6  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  34.93 
 
 		 232 aa  88.6  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1493 aa  88.2  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  36.42 
 
 		 2413 aa  88.2  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  34.57 
 
 		 416 aa  87.4  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  36.02 
 
 		 490 aa  87.4  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  36.02 
 
 		 490 aa  87  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  32.18 
 
 		 305 aa  86.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  32.32 
 
 		 839 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  35.51 
 
 		 329 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  35 
 
 		 235 aa  86.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 223 aa  85.9  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  34.78 
 
 		 328 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 		 976 aa  85.5  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  27.65 
 
 		 769 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  36.17 
 
 		 685 aa  85.1  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  30.72 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1775  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.52 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  27.45 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  34.78 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.76 
 
 		 325 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  25.08 
 
 		 746 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  38.76 
 
 		 325 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  25.94 
 
 		 454 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 181 aa  83.6  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.52 
 
 		 211 aa  84  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  34.52 
 
 		 193 aa  83.2  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  32.12 
 
 		 410 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.9 
 
 		 528 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.76 
 
 		 278 aa  82.4  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  37.98 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.95 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  36.8 
 
 		 1430 aa  81.6  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  33.74 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  30.12 
 
 		 1877 aa  81.3  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  33.55 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  35.38 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.04 
 
 		 890 aa  81.3  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1002 aa  80.9  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  25.93 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  34.87 
 
 		 245 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 1032 aa  80.1  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  36.15 
 
 		 331 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  37.98 
 
 		 327 aa  80.5  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  31.33 
 
 		 234 aa  80.5  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  41.74 
 
 		 117 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  24.21 
 
 		 770 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  33.55 
 
 		 1059 aa  79.7  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0788  Sel1 domain-containing protein  31.76 
 
 		 234 aa  79.7  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191842 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  39.2 
 
 		 233 aa  79.7  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  36.15 
 
 		 331 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  24 
 
 		 769 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  23.1 
 
 		 770 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  26.84 
 
 		 768 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>