259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2478 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2191  alpha/beta fold family hydrolase  99.72 
 
 
363 aa  747    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2082  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  681    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0227342  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2478  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  748    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000532827  normal  0.854923 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4372  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  82.77 
 
 
357 aa  565  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000526664  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3213  hypothetical protein  78.45 
 
 
352 aa  541  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3911  hypothetical protein  68.63 
 
 
367 aa  494  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0552429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32340  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  72.7 
 
 
366 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3245  hypothetical protein  71.47 
 
 
328 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1003  hydrolase of the alpha/beta superfamily  67.18 
 
 
377 aa  446  1.0000000000000001e-124  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.508552 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2946  hypothetical protein  63.79 
 
 
351 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0623517 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  39.61 
 
 
302 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  36.75 
 
 
301 aa  202  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  38.13 
 
 
304 aa  199  7e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  37.29 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  36.95 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  37.29 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  36.95 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  37.86 
 
 
303 aa  195  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  36.95 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.1 
 
 
346 aa  192  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  36.61 
 
 
306 aa  192  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  36.61 
 
 
306 aa  192  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  36.61 
 
 
310 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  36.61 
 
 
310 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  38.85 
 
 
312 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7287  alpha/beta fold family hydrolase  38.51 
 
 
304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  40.79 
 
 
307 aa  189  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  35.67 
 
 
356 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1359  membrane protein  35.69 
 
 
347 aa  188  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  37.58 
 
 
346 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  36.58 
 
 
342 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  36.94 
 
 
320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  36.91 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  40.38 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  36.74 
 
 
330 aa  184  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  37.26 
 
 
362 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  32.58 
 
 
351 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3138  membrane protein  36.36 
 
 
318 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  34.59 
 
 
355 aa  179  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  34.92 
 
 
342 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  34.94 
 
 
337 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  35.35 
 
 
321 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  34.82 
 
 
360 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  36.03 
 
 
336 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  34.12 
 
 
329 aa  176  6e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  34.5 
 
 
342 aa  176  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  34.31 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  33.52 
 
 
345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  34.82 
 
 
360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  35.35 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  35.24 
 
 
342 aa  172  7.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  35.95 
 
 
305 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  34.09 
 
 
305 aa  170  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  34 
 
 
345 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  34.78 
 
 
368 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  35.17 
 
 
368 aa  167  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  35.13 
 
 
367 aa  166  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  33.22 
 
 
305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  34.25 
 
 
320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  33.33 
 
 
358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  30.79 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  32.8 
 
 
378 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  34.47 
 
 
354 aa  162  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  32.89 
 
 
305 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2528  dienelactone hydrolase domain protein  33.33 
 
 
305 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0061  dienelactone hydrolase domain-containing protein  36.22 
 
 
307 aa  153  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0327  hydrolase of the alpha/beta family protein  33.63 
 
 
378 aa  153  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  0.920722 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  33.33 
 
 
378 aa  153  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  35.22 
 
 
372 aa  152  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0060  dienelactone hydrolase domain-containing protein  35.9 
 
 
307 aa  151  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198553  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18100  alpha/beta superfamily hydrolase  32.19 
 
 
318 aa  149  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.111266  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  33.86 
 
 
348 aa  149  8e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  33.55 
 
 
359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1355  hydrolase of the alpha/beta superfamily  31.83 
 
 
364 aa  146  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7269  alpha/beta fold family hydrolase  34.88 
 
 
306 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1211  alpha/beta fold family hydrolase  34.74 
 
 
310 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  41.98 
 
 
237 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1824  hypothetical protein  33.97 
 
 
310 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0326  hypothetical protein  33.77 
 
 
306 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0346  hypothetical protein  33.98 
 
 
306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13117  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  34.53 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0389  hypothetical protein  34.39 
 
 
327 aa  129  6e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1801  peptidase S15  32.18 
 
 
359 aa  129  6e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0921654  normal  0.010289 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1162  peptidase S15  34.77 
 
 
365 aa  129  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000035975  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1060  hypothetical protein  31.44 
 
 
308 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.711691  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1539  hypothetical protein  32.21 
 
 
310 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  30.35 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03774  alpha/beta superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16580)  39.16 
 
 
237 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.61538  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2928  hypothetical protein  31.8 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1979  putative dienelactone hydrolase-related enzyme  31.96 
 
 
311 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.559039  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3234  hypothetical protein  68.57 
 
 
119 aa  109  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  28.72 
 
 
451 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  39.62 
 
 
132 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  36.59 
 
 
340 aa  87  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  26.06 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  30.43 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1092  hypothetical protein  50 
 
 
72 aa  79  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00345327  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4173  hypothetical protein  22.48 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0253164  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  31.29 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1319  hypothetical protein  31.75 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.668778  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>