More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2393 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 412 aa  865    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  55.58 
 
 		 428 aa  498  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  53.71 
 
 		 426 aa  448  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  53.47 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  53.35 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  50.86 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  50.86 
 
 		 446 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  50.86 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  51.4 
 
 		 398 aa  411  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  41.06 
 
 		 411 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  41.06 
 
 		 411 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  41.06 
 
 		 411 aa  317  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  36.64 
 
 		 411 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  48.05 
 
 		 255 aa  258  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  33.16 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  30.3 
 
 		 401 aa  166  8e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  30.3 
 
 		 402 aa  165  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  30.2 
 
 		 431 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  27.71 
 
 		 411 aa  129  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  31.92 
 
 		 341 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  26.36 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  26.99 
 
 		 401 aa  127  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  27.58 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  29.12 
 
 		 388 aa  126  9e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  27.23 
 
 		 430 aa  123  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  27.23 
 
 		 430 aa  123  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  27.32 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  26.95 
 
 		 412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  26.73 
 
 		 414 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  29.48 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  26.34 
 
 		 392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  25.83 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  26.1 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  25.31 
 
 		 435 aa  113  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  25.69 
 
 		 471 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  24.81 
 
 		 397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  25.07 
 
 		 375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  24.87 
 
 		 407 aa  110  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  26.76 
 
 		 381 aa  107  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  28.43 
 
 		 384 aa  107  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  25.44 
 
 		 407 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  27.99 
 
 		 414 aa  99.8  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  26.38 
 
 		 403 aa  99.8  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  28.26 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.53 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  30.2 
 
 		 273 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  26.01 
 
 		 403 aa  97.4  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  24.74 
 
 		 359 aa  97.1  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  25.15 
 
 		 363 aa  97.1  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  26.23 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  33 
 
 		 276 aa  94.7  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  28.68 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  25.83 
 
 		 393 aa  94  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  26.44 
 
 		 377 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.23 
 
 		 369 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  25.93 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2141  hypothetical protein  57.35 
 
 		 140 aa  92  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.256341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 368 aa  89.7  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  25.77 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  31.35 
 
 		 190 aa  89.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  22.26 
 
 		 338 aa  87.4  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  23.98 
 
 		 379 aa  87.4  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  23.12 
 
 		 378 aa  87.4  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  26.56 
 
 		 305 aa  86.3  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  26.22 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  30.52 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  26.1 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  25.74 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  28.4 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  22.57 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  27.45 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  26.56 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  25.09 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  25.76 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  28.46 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  22.61 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  23.64 
 
 		 325 aa  76.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3063  integrase family protein  48.53 
 
 		 257 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000494154  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  24.78 
 
 		 383 aa  76.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  24.71 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  23.6 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  22.49 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  22.42 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  27.05 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  23.23 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  23.23 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  25.97 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2937  integrase, putative  36.97 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.456202  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.25 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.25 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  22.49 
 
 		 451 aa  73.2  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  23.61 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  26.53 
 
 		 369 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  24.33 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  25.42 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.02 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  25.9 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  25.85 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  24.21 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  25.89 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>