More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2258 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  99.44 
 
 
712 aa  1440    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  51.42 
 
 
719 aa  711    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  99.72 
 
 
712 aa  1444    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  100 
 
 
712 aa  1452    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06452  ABC-type RTX toxin transporter ATPase and permease components  61.15 
 
 
523 aa  633  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  43.74 
 
 
720 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  45.39 
 
 
750 aa  588  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  47.1 
 
 
753 aa  588  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  44.03 
 
 
728 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  44.78 
 
 
725 aa  579  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  43.68 
 
 
726 aa  580  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  43.74 
 
 
728 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  44.7 
 
 
743 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  44.25 
 
 
706 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  44.6 
 
 
720 aa  566  1e-160  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  43.78 
 
 
705 aa  568  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  44.46 
 
 
720 aa  565  1e-160  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  46.1 
 
 
712 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  41.69 
 
 
741 aa  559  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  42.98 
 
 
721 aa  556  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  42.26 
 
 
739 aa  556  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  42.65 
 
 
731 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  43.26 
 
 
731 aa  551  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  43.18 
 
 
720 aa  546  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  42.32 
 
 
726 aa  540  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.9 
 
 
717 aa  523  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  37.84 
 
 
699 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  39.77 
 
 
739 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  38.3 
 
 
724 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  38.3 
 
 
724 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  37.07 
 
 
700 aa  487  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  43.49 
 
 
865 aa  478  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  38.36 
 
 
892 aa  469  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  38.47 
 
 
1003 aa  464  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  38.22 
 
 
976 aa  460  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  37.14 
 
 
1013 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  39.73 
 
 
1024 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  40.8 
 
 
1008 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.44 
 
 
1000 aa  449  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  40.8 
 
 
1008 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  38.78 
 
 
980 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  37.58 
 
 
1016 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  36.35 
 
 
986 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  39.81 
 
 
714 aa  443  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2004  type I secretion system ATPase  40.15 
 
 
715 aa  443  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  39.33 
 
 
971 aa  445  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1891  toxin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.15 
 
 
715 aa  443  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  39.53 
 
 
930 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  39.76 
 
 
1001 aa  441  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  38.88 
 
 
975 aa  442  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  35.7 
 
 
999 aa  439  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  36.76 
 
 
1012 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  36.76 
 
 
968 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.91 
 
 
1006 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  32.59 
 
 
982 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  33.85 
 
 
714 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  33.43 
 
 
714 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  36.65 
 
 
1038 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  36.8 
 
 
1038 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  35.03 
 
 
906 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  34.88 
 
 
906 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.89 
 
 
1019 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2547  ABC transporter related  38.12 
 
 
740 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293981  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  35.63 
 
 
908 aa  375  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.45 
 
 
1018 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  31.86 
 
 
1018 aa  372  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  32.86 
 
 
740 aa  372  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.32 
 
 
1018 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.64 
 
 
908 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  35.7 
 
 
1042 aa  361  3e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  31.14 
 
 
1040 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1051  ABC transporter related  32.36 
 
 
744 aa  357  5.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2722  ABC transporter related  37.55 
 
 
730 aa  352  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  33.23 
 
 
724 aa  350  6e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0535  ABC transporter, transmembrane region  32.06 
 
 
744 aa  349  9e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.622763 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4070  ABC transporter related  32.93 
 
 
724 aa  347  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  34.39 
 
 
1013 aa  347  5e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3863  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.2 
 
 
736 aa  346  8.999999999999999e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779093  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  33.83 
 
 
1011 aa  345  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  29.39 
 
 
738 aa  339  9e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1058  RtxB protein  45.71 
 
 
368 aa  339  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3567  ABC transporter related  33.07 
 
 
767 aa  337  5e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1440  ABC transporter related  33.61 
 
 
770 aa  331  3e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338764  normal  0.147226 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2883  ABC transporter related  34.22 
 
 
741 aa  330  4e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0605721 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  31.64 
 
 
717 aa  324  4e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  30.36 
 
 
727 aa  318  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  31.34 
 
 
721 aa  317  4e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  31.49 
 
 
759 aa  313  5.999999999999999e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  30.78 
 
 
727 aa  312  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  31.31 
 
 
726 aa  312  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  30.25 
 
 
737 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  29.84 
 
 
578 aa  306  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  29.84 
 
 
578 aa  306  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1898  ABC transporter related  30.92 
 
 
742 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  29.13 
 
 
734 aa  303  9e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.41 
 
 
578 aa  301  2e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  35.99 
 
 
720 aa  299  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.16 
 
 
586 aa  299  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  28.83 
 
 
734 aa  298  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.99 
 
 
586 aa  297  5e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>