More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2164 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  421  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  99.53 
 
 
214 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  99.53 
 
 
214 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  92.99 
 
 
214 aa  397  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  84.11 
 
 
214 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  85.05 
 
 
215 aa  357  5e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  85.05 
 
 
215 aa  357  5e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  84.58 
 
 
215 aa  358  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  84.58 
 
 
215 aa  358  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  84.58 
 
 
215 aa  358  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  84.58 
 
 
215 aa  358  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  84.58 
 
 
215 aa  358  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  84.58 
 
 
215 aa  356  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  84.58 
 
 
215 aa  356  9.999999999999999e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  84.58 
 
 
215 aa  356  9.999999999999999e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  84.58 
 
 
215 aa  356  9.999999999999999e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  84.58 
 
 
215 aa  356  9.999999999999999e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  84.58 
 
 
215 aa  356  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  84.11 
 
 
215 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  82.24 
 
 
215 aa  352  2.9999999999999997e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  65.38 
 
 
212 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  63.77 
 
 
212 aa  271  7e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  63.55 
 
 
212 aa  248  6e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  55.07 
 
 
207 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  53.59 
 
 
212 aa  237  9e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  51.67 
 
 
213 aa  236  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  54.07 
 
 
210 aa  229  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  52.45 
 
 
207 aa  228  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  52.63 
 
 
210 aa  228  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  50.72 
 
 
210 aa  222  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  50.72 
 
 
210 aa  222  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  50.24 
 
 
210 aa  221  8e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  50.96 
 
 
210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  50.96 
 
 
210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  50.96 
 
 
210 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  50.96 
 
 
210 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  50.96 
 
 
210 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  50.96 
 
 
210 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2154  hypothetical protein  53.59 
 
 
210 aa  216  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0620075  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  51.22 
 
 
208 aa  214  5e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  43.69 
 
 
207 aa  177  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.59 
 
 
206 aa  175  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  40.1 
 
 
206 aa  175  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.6 
 
 
206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.6 
 
 
206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.6 
 
 
206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.6 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  41.09 
 
 
206 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  41.09 
 
 
206 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  41.09 
 
 
206 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  41.09 
 
 
206 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  41.09 
 
 
206 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  41.09 
 
 
206 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  41.09 
 
 
206 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  41.09 
 
 
206 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.6 
 
 
206 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  40.59 
 
 
206 aa  170  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.58 
 
 
207 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.59 
 
 
206 aa  168  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  41.09 
 
 
206 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3245  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.5 
 
 
207 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  41.26 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.74 
 
 
231 aa  159  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3108  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  43 
 
 
207 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.94 
 
 
218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  38.94 
 
 
216 aa  151  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.75 
 
 
217 aa  149  4e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.94 
 
 
213 aa  145  6e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.87 
 
 
202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.24 
 
 
226 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.24 
 
 
226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3813  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.62 
 
 
206 aa  135  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0677256  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5328  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.89 
 
 
213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.62 
 
 
211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.16 
 
 
212 aa  131  9e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.16 
 
 
212 aa  131  9e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2124  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  41.09 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.66 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4785  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.45 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0238  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.35 
 
 
210 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.07 
 
 
212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0559701  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.25 
 
 
205 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0186  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.38 
 
 
210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.969233  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5252  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.49 
 
 
213 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6025  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.59 
 
 
212 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0264079 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  35.15 
 
 
239 aa  124  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.5 
 
 
201 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0635  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36 
 
 
201 aa  123  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.586575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4933  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.17 
 
 
217 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1394  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.61 
 
 
236 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6435  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.61 
 
 
236 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.44 
 
 
231 aa  122  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.92 
 
 
207 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.17 
 
 
206 aa  121  9e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0372  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.75 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  32.37 
 
 
210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.9 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.666037 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  37.24 
 
 
206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.24 
 
 
206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.5 
 
 
216 aa  118  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>