26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2138 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2244  cytochrome c class I  100 
 
 		 104 aa  211  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2138  cytochrome c family protein  100 
 
 		 104 aa  211  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.203882 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2134  cytochrome c family protein  99.03 
 
 		 103 aa  207  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1289  cytochrome c553  34.65 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1170  cytochrome c553  34.65 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0575  cytochrome c553  34.65 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.673779  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0241  cytochrome c-553 (cytochrome c553) (low-potential cytochromec)  38.61 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1418  cytochrome c553  34.29 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.785663  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0084  glutamate racemase 2  38.61 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000295238  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0474  cytochrome c family protein  33.66 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2802  cytochrome c, class I  32.05 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190296  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1235  cytochrome c553  29.79 
 
 		 105 aa  49.7  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1602  cytochrome c553  32.14 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.330816  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1416  cytochrome c553  29.52 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  29.63 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1817  cytochrome c class I  32.69 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  37.74 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0539  cytochrome c class I  33.67 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113512 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0123  cytochrome c class I  32.88 
 
 		 418 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.266844  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3829  cytochrome c, class I  28.87 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.82757  normal  0.284345 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1343  cytochrome c, class I  30 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.022471  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0996  cytochrome c class I  31.73 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1873  putative cytochrome c  32.05 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal  0.677809 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1543  cytochrome c-553  32.61 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.31178  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3294  cytochrome c, class I  25 
 
 		 277 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79873  normal  0.176806 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1415  cytochrome c class I  22.55 
 
 		 123 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>