More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2122 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  100 
 
 
409 aa  813    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  99.76 
 
 
409 aa  810    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  72.13 
 
 
409 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  63.3 
 
 
425 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  63.3 
 
 
425 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  57.49 
 
 
411 aa  483  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  56.13 
 
 
429 aa  479  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  58.23 
 
 
432 aa  471  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  57.99 
 
 
432 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  57.99 
 
 
432 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  57.88 
 
 
428 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  53.94 
 
 
429 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  57.46 
 
 
435 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  58.68 
 
 
434 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  55.77 
 
 
428 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  58.64 
 
 
434 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  57.6 
 
 
432 aa  464  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  55.77 
 
 
423 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  57.64 
 
 
427 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  56.02 
 
 
423 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  57.88 
 
 
434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  56.51 
 
 
433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  56.2 
 
 
420 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  55.96 
 
 
420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  55.96 
 
 
420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  55.58 
 
 
420 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  54.05 
 
 
428 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  56.9 
 
 
436 aa  450  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  54.68 
 
 
428 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  54.05 
 
 
428 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  53.56 
 
 
423 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  55.72 
 
 
420 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  53.79 
 
 
430 aa  441  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  53.32 
 
 
428 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  54.03 
 
 
419 aa  438  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  53.55 
 
 
419 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  56.4 
 
 
437 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  54.28 
 
 
415 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  54.28 
 
 
415 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  54.03 
 
 
416 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  51.81 
 
 
445 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  52.05 
 
 
428 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  52.06 
 
 
445 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  52.21 
 
 
423 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  52.4 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  53.77 
 
 
434 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  53.06 
 
 
430 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  53.19 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  50.74 
 
 
428 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  49.51 
 
 
429 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  51.83 
 
 
435 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  50.74 
 
 
424 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  50.49 
 
 
424 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  50.25 
 
 
424 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  52.81 
 
 
421 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  49.63 
 
 
423 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  51.79 
 
 
398 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  51.79 
 
 
398 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  51.79 
 
 
398 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  48.24 
 
 
474 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  48.47 
 
 
457 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  48.47 
 
 
474 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  48.24 
 
 
474 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  48.47 
 
 
457 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  48 
 
 
474 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  48.47 
 
 
474 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  49.76 
 
 
432 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  48.77 
 
 
433 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  47.07 
 
 
441 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  51.82 
 
 
436 aa  365  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  44.23 
 
 
428 aa  341  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  39.42 
 
 
428 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  40.29 
 
 
436 aa  296  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4834  major facilitator transporter  47.28 
 
 
411 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  35.12 
 
 
418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  35.2 
 
 
415 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  34.7 
 
 
415 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  34.45 
 
 
415 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  33.9 
 
 
491 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  33.42 
 
 
415 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  34.62 
 
 
415 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  34.87 
 
 
415 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  34.87 
 
 
415 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  34.26 
 
 
408 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  30.3 
 
 
432 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  31.24 
 
 
432 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  31.24 
 
 
433 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  31.24 
 
 
433 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  31.24 
 
 
433 aa  195  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  30.77 
 
 
432 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  30.54 
 
 
433 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  30.77 
 
 
432 aa  193  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  31.87 
 
 
412 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  35.59 
 
 
402 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  29.41 
 
 
432 aa  189  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  33.25 
 
 
410 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  31.42 
 
 
412 aa  186  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  33.85 
 
 
418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2058  major facilitator family protein  29.37 
 
 
415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0107331  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  30.05 
 
 
425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>