255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2007 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
554 aa  1104    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  99.82 
 
 
554 aa  1103    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
554 aa  1104    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  69.02 
 
 
548 aa  742    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  57.89 
 
 
547 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  57.71 
 
 
547 aa  615  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  57.89 
 
 
547 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  58.08 
 
 
547 aa  617  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  58.08 
 
 
547 aa  618  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  58.08 
 
 
547 aa  617  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  57.71 
 
 
547 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  57.71 
 
 
547 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  57.53 
 
 
547 aa  610  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  56.55 
 
 
546 aa  593  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2589  flagellar hook-associated protein FlgK  55.87 
 
 
568 aa  570  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  56.19 
 
 
553 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  56.19 
 
 
553 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  56.19 
 
 
553 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  56.19 
 
 
553 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  56.19 
 
 
553 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1877  flagellar hook-associated protein FlgK  56.07 
 
 
556 aa  552  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1534  flagellar hook-associated protein FlgK  52.03 
 
 
551 aa  496  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  45.67 
 
 
541 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  42.81 
 
 
539 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  51.92 
 
 
640 aa  402  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  41.86 
 
 
631 aa  350  5e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  43.78 
 
 
631 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  40.62 
 
 
652 aa  309  9e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  38.65 
 
 
645 aa  277  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0473  flagellar hook-associated protein FlgK  36.75 
 
 
667 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0276  flagellar hook-associated protein FlgK  36.53 
 
 
714 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3335  flagellar hook-associated protein FlgK  36.53 
 
 
667 aa  269  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0288  flagellar hook-associated protein FlgK  36.53 
 
 
667 aa  269  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3344  flagellar hook-associated protein FlgK  36.53 
 
 
667 aa  269  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3004  flagellar hook-associated protein FlgK  36.53 
 
 
667 aa  269  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2089  flagellar hook-associated protein FlgK  36.53 
 
 
667 aa  269  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0250  flagellar hook-associated protein FlgK  35.79 
 
 
667 aa  264  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  34.73 
 
 
549 aa  263  4e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  37.19 
 
 
647 aa  263  6e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  37.5 
 
 
638 aa  261  3e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  35.28 
 
 
683 aa  258  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  37.78 
 
 
629 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  36.3 
 
 
676 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3010  flagellar hook-associated protein FlgK  34.81 
 
 
659 aa  251  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  37.2 
 
 
657 aa  250  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  37.98 
 
 
657 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  35.29 
 
 
637 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  35.06 
 
 
660 aa  243  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3034  flagellar hook-associated protein FlgK  34.08 
 
 
643 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2401  flagellar hook-associated protein FlgK  34.08 
 
 
643 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3015  flagellar hook-associated protein FlgK  34.08 
 
 
643 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316053  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2925  flagellar hook-associated protein FlgK  34.82 
 
 
665 aa  240  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.719396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  32.53 
 
 
682 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  34 
 
 
682 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  33.04 
 
 
657 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3060  flagellar hook-associated protein FlgK  34.59 
 
 
665 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  33.33 
 
 
683 aa  238  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  34.31 
 
 
645 aa  230  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  34.31 
 
 
645 aa  230  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  32.59 
 
 
681 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  33.87 
 
 
642 aa  224  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01003  flagellar hook-associated protein FlgK  34.9 
 
 
624 aa  223  8e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163579  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06163  flagellar hook-associated protein FlgK  34.9 
 
 
624 aa  223  8e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.557443  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  32.37 
 
 
680 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  32.74 
 
 
920 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  33.48 
 
 
686 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  32.44 
 
 
680 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4711  flagellar hook-associated protein FlgK  34.23 
 
 
641 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402809  normal  0.0701142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  34.05 
 
 
681 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  32.15 
 
 
640 aa  213  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  32.59 
 
 
686 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1897  flagellar hook-associated protein FlgK  33.56 
 
 
626 aa  208  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.844089  normal  0.0573856 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  32.27 
 
 
653 aa  208  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  31.43 
 
 
688 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  29.66 
 
 
644 aa  195  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  26.79 
 
 
630 aa  193  6e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  30.31 
 
 
695 aa  193  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  28.51 
 
 
685 aa  189  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3110  flagellar hook-associated protein FlgK  29.87 
 
 
672 aa  188  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293616  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  34.24 
 
 
660 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3837  flagellar hook-associated protein FlgK  30.09 
 
 
691 aa  184  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  32.13 
 
 
640 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  29.35 
 
 
560 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  30.46 
 
 
638 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1233  flagellar hook-associated protein FlgK  31.06 
 
 
649 aa  173  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  30.62 
 
 
649 aa  173  9e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  30.63 
 
 
638 aa  171  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0560  flagellar hook-associated protein FlgK  29.35 
 
 
658 aa  170  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2329  flagellar hook-associated protein FlgK  24.8 
 
 
626 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  30.24 
 
 
640 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  27.93 
 
 
665 aa  166  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0624  flagellar hook-associated protein FlgK  30.85 
 
 
642 aa  166  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  30.49 
 
 
642 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  31.55 
 
 
477 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4430  flagellar hook-associated protein FlgK  27.99 
 
 
642 aa  160  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2309  flagellar hook-associated protein  28.41 
 
 
638 aa  157  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  29.57 
 
 
637 aa  157  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2953  flagellar hook-associated protein FlgK  30.43 
 
 
641 aa  157  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  30.43 
 
 
641 aa  157  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  29.98 
 
 
641 aa  156  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>