More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1720 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  100 
 
 
452 aa  893  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  99.56 
 
 
452 aa  890  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  99.56 
 
 
452 aa  891  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  78.36 
 
 
453 aa  717  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  61.64 
 
 
445 aa  506  1e-142  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  61.87 
 
 
445 aa  503  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.89575e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  61.87 
 
 
445 aa  503  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  61.87 
 
 
445 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  61.87 
 
 
445 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  61.87 
 
 
469 aa  503  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  61.87 
 
 
445 aa  503  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  60.97 
 
 
457 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  58.43 
 
 
460 aa  501  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  61.42 
 
 
445 aa  500  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  41.82 
 
 
446 aa  325  8e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  39.28 
 
 
464 aa  310  3e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  38.64 
 
 
439 aa  305  9e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  38.26 
 
 
441 aa  293  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  37.95 
 
 
442 aa  290  5e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  37.5 
 
 
445 aa  287  3e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  37.41 
 
 
443 aa  283  3e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  36.74 
 
 
443 aa  280  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  36.51 
 
 
443 aa  279  7e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  36.51 
 
 
443 aa  279  7e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  36.51 
 
 
443 aa  279  7e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  36.51 
 
 
443 aa  279  7e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  36.51 
 
 
443 aa  279  7e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  36.51 
 
 
443 aa  279  7e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  36.24 
 
 
438 aa  276  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  36.05 
 
 
443 aa  276  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  35.06 
 
 
480 aa  275  1e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  35.17 
 
 
452 aa  275  1e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2112  metabolite transporter  37.99 
 
 
442 aa  270  3e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151883  normal  0.38629 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  35.23 
 
 
468 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  35.23 
 
 
468 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  35 
 
 
468 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  35 
 
 
468 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  35 
 
 
468 aa  269  9e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  36.36 
 
 
457 aa  269  9e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  35.54 
 
 
458 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  35.65 
 
 
442 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3468  General substrate transporter  35.59 
 
 
468 aa  239  8e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1884  D-xylose proton-symporter  31.07 
 
 
447 aa  219  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.326848  hitchhiker  1.4456e-12 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1641  major facilitator transporter  32.79 
 
 
434 aa  216  5e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119358  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  30.43 
 
 
476 aa  176  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
456 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  29.57 
 
 
447 aa  160  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  7.87137e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 
451 aa  153  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.15751e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 
423 aa  150  4e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  30.66 
 
 
427 aa  150  6e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 
470 aa  149  1e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
451 aa  147  4e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.78504e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  27.59 
 
 
467 aa  143  6e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  25.9 
 
 
457 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  26.24 
 
 
463 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  28.22 
 
 
474 aa  142  1e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  27.89 
 
 
474 aa  142  1e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 
450 aa  142  1e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.74507e-10 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  30.53 
 
 
464 aa  141  2e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  31.13 
 
 
465 aa  141  2e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 
465 aa  141  2e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  27.31 
 
 
471 aa  140  4e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  27.67 
 
 
474 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 
473 aa  139  9e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 
446 aa  139  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.04713e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  25.11 
 
 
456 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  26.9 
 
 
476 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  30.04 
 
 
435 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1490  major facilitator family transporter  29.25 
 
 
468 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 
472 aa  137  3e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  27.31 
 
 
473 aa  137  3e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.89 
 
 
472 aa  136  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  28.05 
 
 
468 aa  135  1e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  25.5 
 
 
460 aa  135  2e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  28.05 
 
 
468 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1172  MFS transporter  29.57 
 
 
489 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.537598  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  28.05 
 
 
468 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 
459 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1432  major facilitator family transporter  29.57 
 
 
489 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  28.05 
 
 
468 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 
446 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0308  major facilitator family transporter  28.05 
 
 
474 aa  134  4e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2505  major facilitator family transporter  28.05 
 
 
468 aa  134  4e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0584  major facilitator family transporter  28.05 
 
 
474 aa  134  4e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 
447 aa  133  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  29.1 
 
 
469 aa  133  6e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0027  putative sugar transport protein  29.36 
 
 
489 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  28.73 
 
 
479 aa  133  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  30.54 
 
 
475 aa  133  7e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  30.54 
 
 
475 aa  133  7e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 
467 aa  133  7e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  29.78 
 
 
450 aa  133  8e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1518  major facilitator superfamily permease  29.14 
 
 
489 aa  132  1e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28243  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  27.44 
 
 
467 aa  132  1e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  30.3 
 
 
475 aa  132  1e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  30.58 
 
 
485 aa  132  1e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  29.6 
 
 
449 aa  132  2e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  27.44 
 
 
463 aa  131  2e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  1.99551e-15 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  25.69 
 
 
485 aa  131  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  27.39 
 
 
455 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>